CAFASP

CAFASP , czyli Critical Assessment of Fully Automated Structure Prediction, to ślepy eksperyment na dużą skalę w przewidywaniu struktury białek , który bada wydajność automatycznych serwerów sieciowych do przewidywania struktury w modelowaniu homologii , rozpoznawaniu fałd i przewidywaniu ab initio trzeciorzędowych struktur białek opartych wyłącznie na sekwencja aminokwasowa . Eksperyment odbywa się raz na dwa lata równolegle z CASP , który koncentruje się na prognozach uwzględniających interwencję człowieka i wiedzę specjalistyczną. W porównaniu z pokrewnymi technikami porównawczymi LiveBench i EVA , które co tydzień porównują nowo rozwiązane struktury białek zdeponowane w Protein Data Bank , CAFASP generuje znacznie mniej danych, ale ma tę zaletę, że tworzy prognozy, które są bezpośrednio porównywalne z przewidywaniami tworzonymi przez ekspertów prognozujących ludzi. Ostatnio CAFASP został uruchomiony zasadniczo zintegrowany z wynikami CASP, a nie jako oddzielny eksperyment.

Linki zewnętrzne