EVA (wskaźnik)

EVA był nieprzerwanie realizowanym projektem wzorcowym do oceny jakości i wartości metod przewidywania struktury białek i struktur drugorzędowych . Metody przewidywania zarówno struktury drugorzędowej , jak i trzeciorzędowej — w tym modelowanie homologii , gwintowanie białek i przewidywanie kolejności kontaktów — porównano z wynikami nowo rozwiązanych struktur białek zdeponowanych w Protein Data Bank każdego tygodnia . Projekt miał na celu określenie dokładności predykcji, jakiej można by oczekiwać od niebędących ekspertami użytkowników powszechnych, publicznie dostępnych serwerów predykcyjnych ; jest to podobne do powiązanego LiveBench i kontrastuje z przeprowadzanym co dwa lata testem porównawczym CASP , którego celem jest określenie maksymalnej dokładności osiągalnej przez ekspertów ds. przewidywań.

  •   Rost B, Eyrich VA. (2001). EVA: wielkoskalowa analiza przewidywania struktury drugorzędowej. Proteins Suppl 5:192-9. PMID 11835497
  •   Eyrich VA, Marti-Renom MA, Przybylski D, Madhusudhan MS, Fiser A, Pazos F, Valencia A, Sali A, Rost B. (2001). EVA: ciągła automatyczna ocena serwerów przewidywania struktury białek. Bioinformatyka 17(12):1242-3. PMID 11751240
  •   Koh IY, Eyrich VA, Marti-Renom MA, Przybylski D, Madhusudhan MS, Eswar N, Grana O, Pazos F, Valencia A, Sali A, Rost B. (2003). EVA: Ocena serwerów przewidywania struktury białek. Kwasy nukleinowe Res 31(13):3311-5. PMID 12824315

Linki zewnętrzne