CFAP157
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CFAP157 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , C9orf117, białko związane z rzęskami i wiciami 157 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Białko 157 związane z rzęskami i wiciami (CFAP157), znane również jako otwarta ramka odczytu 117 chromosomu 9 (c9orf117), jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen CFAP157.
Gen CFAP157 jest „szczególnie wymagany podczas spermatogenezy do morfogenezy wici i ruchliwości plemników i może być wymagany do powstrzymania tworzenia się nadliczbowych aksonemów i zapewnienia prawidłowej ultrastruktury”, zgodnie z UniProt .
Gen
Lokalizacja
CFAP157 znajduje się na chromosomie 9, 9q34.11 u człowieka od pary zasad 127 706 989 do pary zasad 127 716 002.
Cechy
Rozmiar genu wynosi 9013 zasad, a orientacja to nić dodatnia. Gen zawiera 9 eksonów .
mRNA
Najpopularniejszy wariant mRNA CFAP157 zawiera 1722 par zasad .
Wyrażenie
CFAP157 ulega ekspresji w wielu tkankach ludzkiego ciała, takich jak szyjka macicy , płuca , jądra i macica . Osoby z guzem macicy prawdopodobnie będą miały ekspresję w CFAP157. Gen ten ulega ekspresji zarówno u dorosłych, jak i płodów.
Białko
Istnieje 520 aminokwasów w CFAP157 u ludzi. Białko jest w glutaminę i ubogie w glicynę . Białko jest dość obojętne z punktem izoelektrycznym przy pH 7,4. Średnią masę białka szacuje się na 60 531,748 Da, a współczynnik absorpcji na 25 440 M -1 cm -1 .
CFAP157 składa się głównie z α-helis i nie ma helisy transbłonowej . Program do tworzenia struktury białek o nazwie Phyre jest używany do tworzenia przewidywanej struktury CFAP157.
Homologia
Nie jest znany paralog dla CFAP157 u ludzi. CFAP157 ma wiele ortologów. Poniższa tabela zawiera niektóre ortologi, w tym człowieka, szympansa pospolitego, makaka rezusa, bydła, psa, myszy, szczura, tropikalną żabę szponiastą i danio pręgowanego.
| Gatunek | Nazwa zwyczajowa | Numer dostępowy | Tożsamość sekwencji | Podobieństwo sekwencji |
|---|---|---|---|---|
| Homo sapiens | Człowiek | NP_001012520 | 100% | 100% |
| Panowie troglodyci | Szympans pospolity | XP_001143084 | 98,5% | 99,0% |
| Macaca Mulat | Makak rezus | XP_001095281 | 95,2% | 96,4% |
| Bos Byk | Bydło | XP_005213477 | 70,5% | 84,0% |
| Canis lupus familiaris | Pies | XP_005625392 | 71,5% | 80,9% |
| Mus musculus | Mysz | NP_079895 | 64,6% | 79,0% |
| Rattus norvegicus | Szczur | NP_001094339 | 64,2% | 78,4% |
| Xenopus tropicalis | Tropikalna żaba szponiasta | NP_001072774 | 41,5% | 60,5% |
| Danio Rerio | Danio pręgowany | NP_001103638 | 34,0% | 54,9% |
Białka oddziałujące
P14335 ( szczep wirusa Kunjin MRM61C) jest wirusem, który oddziałuje z CFAP157 poprzez dwuhybrydowe badania przesiewowe . Wirus Kunjin nie jest tak groźny jak inne wirusy, ale jest to zauważalne odkrycie, ponieważ możliwe jest wykorzystanie interakcji do opracowania nowych rodzajów leków. Naukowcy z University of Queensland odkryli nowe medyczne zastosowanie wirusa Kunjin w 2005 roku, a możliwe metody leczenia obejmują szczepionki przeciwko HIV/rakowi.
- ^ a b c GRCm38: Ensembl wydanie 89: ENSMUSG00000038987 - Ensembl , maj 2017
- ^ „Referencja Human PubMed:” . Narodowe Centrum Informacji Biotechnologicznej, Narodowa Biblioteka Medyczna Stanów Zjednoczonych .
- ^ „Odnośnik Mouse PubMed:” . Narodowe Centrum Informacji Biotechnologicznej, Narodowa Biblioteka Medyczna Stanów Zjednoczonych .
- ^ „CFAP157 - Białko związane z rzęskami i wiciami 157 - Homo sapiens (człowiek) - Gen i białko CFAP157” . www.uniprot.org . Źródło 2018-02-05 .
- ^ a b Baza danych, GeneCards Ludzki gen. „CFAP157 Gene - GeneCards | CF157 Białko | CF157 Przeciwciało” . www.genecards.org . Źródło 2018-02-20 .
- Bibliografia _ _ _ _ www.ncbi.nlm.nih.gov . Źródło 2018-04-23 .
- ^ Grupa, Schuler. "Profil EST - Hs.652519" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Źródło 2018-04-23 .
- ^ „Białko związane z rzęskami i wiciami 157 [Homo sapiens] - Białko - NCBI” . www.ncbi.nlm.nih.gov . Źródło 2018-02-20 .
- ^ „Prot pi | Kalkulator bioinformatyczny” . www.protpi.ch . Źródło 2018-04-23 .
- ^ „BLAST: podstawowe narzędzie wyszukiwania lokalnego wyrównania” . blast.ncbi.nlm.nih.gov . Źródło 2018-04-23 .
- ^ „Nowe zastosowania medyczne wirusa Kunjin” . News-Medical.net . 2005-04-12 . Źródło 2018-05-06 .