Davida J. Pattersona

David Joseph Patterson jest północnoirlandzkim taksonomistą specjalizującym się w pierwotniakach i wykorzystaniu taksonomii w informatyce różnorodności biologicznej .

David J. Patterson, wyspa Sylt, 1992

Wczesne życie i edukacja

David Joseph Patterson urodził się w Belfaście w Irlandii Północnej 19 kwietnia 1950 r. Jako syn Doris Mary (z domu Bell) i Samuela Pattersona, z jednym starszym bratem (matematyk Samuel James ) i siostrą (Frances Mary). Ojciec Alice Mii Vørs Patterson, Daniela Kierana Pattersona i Williama Zhao Pattersona. Kształcił się w szkołach podstawowych Belmont, Strandtown i Grosvenor High w Belfaście. Uzyskał tytuł Bachelor of Science z wyróżnieniem pierwszej klasy na Queen's University Belfast w 1971 roku.

Kariera

David Patterson uzyskał tytuł doktora filozofii na Uniwersytecie w Bristolu w 1976 r., gdzie był później zatrudniony (1977–1993). Uzyskał tytuł doktora nauk ścisłych w 1990 roku na Queen's University w Belfaście. W 1993 roku przeniósł się do University of Sydney w Australii , gdzie został dyrektorem Szkoły Nauk Biologicznych. W 2004 roku przeniósł się do Laboratorium Biologii Morskiej w Woods Hole (Mass., USA), gdzie współtworzył projekt Encyclopedia of Life odpowiedzialny za komponent informatyczny, opierając EOL na modelu opracowanym w ramach projektu micro*scope. W latach 2012-2014 był profesorem naukowym na Arizona State University; a także był profesorem (MBL) na Uniwersytecie Browna w Providence w stanie Rhode Island oraz emerytowanym profesorem na Uniwersytecie w Sydney w Sydney w Australii. Jako taksonomista interesował się przede wszystkim różnorodnością pierwotniaków i ewolucją protistów. On i jego współpracownicy opisali około 250 nowych taksonów. David Patterson otrzymał nagrodę im. Thomasa Henry'ego Huxleya oraz Medal Naukowy Towarzystwa Zoologicznego w Londynie; był sekretarzem Sekcji Brytyjskiej Towarzystwa Protozoologów; Prezes Międzynarodowego Towarzystwa Protistologii Ewolucyjnej; i wiceprzewodniczący (Międzynarodowego) Towarzystwa Protozoologii. Był członkiem Międzynarodowej Komisji Nomenklatury Zoologicznej, Komitetu Redakcyjnego ds. Glonów Międzynarodowego Stowarzyszenia Taksonomii Roślin, Komitetu Wykonawczego Międzynarodowej Unii Nauk Biologicznych oraz Komitetu Naukowego Światowego Systemu Danych.

Opublikował około 200 recenzowanych artykułów, w tym kilka książek w całej swojej karierze. Początkowe zainteresowania fizjologią jonów, regulacją objętości i kurczliwymi wakuolami przesunęły się w kierunku badań ultrastrukturalnych, techniki, która zmieniła rozumienie różnorodności protistów, z kolei została dodatkowo wzbogacona przez porównawcze badania molekularne. Wraz z Guyem Brugerolle przedstawił swoją koncepcję, zgodnie z którą klady protistów można z pożytkiem identyfikować na podstawie dopełnienia i ułożenia organelli - to jest ich ultrastrukturalna tożsamość, a później wykorzystał tę koncepcję wraz z uzasadnieniem przekształconej kladystyki, aby na nowo zdefiniować różnorodność kladów wśród eukariontów . Uprościło to wyzwanie ustalenia pełnej filogenezy eukariontów, dostarczając listę kladów, między którymi należało ustalić pokrewieństwo.

W połowie lat osiemdziesiątych Patterson skupił swoje wysiłki na wolno żyjących heterotroficznych wiciowcach, ponieważ były one słabo poznane i nie były aktywnie badane. Dwa obszary badań były utrudnione z powodu braku świadomości różnorodności wiciowców. Pierwszym z nich była pojawiająca się koncepcja mikrobiologicznych sieci pokarmowych, która zmieniła sposób postrzegania dynamiki ekosystemów oceanicznych – sama w sobie ma kluczowe znaczenie dla międzynarodowego badania Joint Global Ocean Flux Study, którego celem jest lepsze zrozumienie przepływów węgla i globalnego ocieplenia. Po drugie, ponieważ najbardziej prymitywne eukarionty nosiły wici, oczekiwano, że zrozumienie różnorodności różnorodności wiciowców zapewni lepszy wgląd w eukariotyczne przodkowie i ewolucję. Wraz ze współpracownikami doprowadziło to do rozpoznania nowych domen różnorodności protistanu - takich jak stramenopile , pęcherzyki płucne i wykopaliska ( excavata ) - solidnie zdefiniowanych przez odniesienie do amorfii, wówczas rzadkości w protistologii.

Patterson zbadał pojawiającą się iw dużej mierze teoretyczną koncepcję, zgodnie z którą większość drobnoustrojów powinna mieć uniwersalną dystrybucję, początkowo sformułowaną przez Lourensa Baasa Beckinga i odświeżoną przez Toma Fenchela i Blanda Finlaya . Stosując znormalizowane protokoły pobierania próbek, dokumentacji i raportowania do społeczności żyjących w obszarach morskich, słodkowodnych i skrajnych, na Pacyfiku i Atlantyku, na półkulach północnej i południowej, w siedliskach przybrzeżnych i osadach głębinowych (itp.), on i współpracownicy obalili hipoteza, że ​​skład taksonomiczny zbiorowisk wolno żyjących wiciowców był determinowany czynnikami geograficznymi. Ta wiedza wyeliminowała potrzebę posiadania lokalnych katalogów i ekspertyz, przyspieszając badania taksonomiczne, filogenetyczne i ekologiczne z udziałem wiciowców.

Później jego zainteresowania przesunęły się na osadzanie wiedzy taksonomicznej w narzędziach do zarządzania informacjami o różnorodności biologicznej. Był starszym taksonomistą w projekcie Encyclopedia of Life, doradcą Fundacji Alfreda P. Sloana, coPI w Data Conservancy i finansowanym przez NSF projekcie Global Names oraz członkiem zespołu Plazi. Był głównym inicjatorem projektu Global Names Architecture.

Taksony nazwane jego imieniem obejmują Pattersoniella vitiphila , Foissner, 1987; Protoopalina pattersonii Delvinquier, 1995; Nuclearia pattersonii , Nerad, Silberman i in., 2008; Pseudovorticella pattersoni , Sun, Ji, Warren i Song 2009 oraz Stephanopogon pattersoni Lee Miller i Simpson, 2014.

Opisane taksony

Taksony nazwane z Davidem J. Pattersonem wśród autorów
Actinophrys salsuginosa Mikrjukov & Patterson, 2001 Digensia angusta Patterson & Zölffel, 1991 Notosolenus hamelini Al Qassab, Lee, Murray & Patterson, 2002 Ploeotia adhaerens Larsen & Patterson, 1990
Actinophrys tauryanini Mikrjukov & Patterson, 2001 Dyplomowany chodzący Larsen & Patterson, 1990 Notosolenus hemicircularis Lee & Patterson, 2000 Ploeotia amygdala Lee, Brandt, Vørs & Patterson, 2003
Adriamonas Verhagen, Zölffel, Brugerolle i Patterson, 1994 Dyplom metaboliczny Larsen & Patterson, 1990 Notosolenus lashue Lee & Patterson, 2000 Ploeotia azurina Patterson & Simpson, 1996
Adriamonas peritocrescens Verhagen, Zölffel, Brugerolle i Patterson, 1994 Dolium Larsen i Patterson, 1990 Notosolenus mediocanellatus Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 Ploeotia corrugata Larsen & Patterson, 1990
Amphidiniopsis korewalensis Murray & Patterson, 2002 Dolium sedentarium Larsen & Patterson, 1990 Notosolenus navicula Larsen & Patterson, 1990 Ploeotia decipiens Larsen & Patterson, 1990
Amphidinium boggayum Murray & Patterson, 2002 Eufolliculina uhligi Mulisch & Patterson, 1983 Notosolenus ostium Larsen & Patterson, 1990 Ploeotia discoides Larsen & Patterson, 1990
Amphidinium corrugatum Larsen & Patterson, 1990 Eumycetes Patterson, 1994 Notosolenus pyriforme Lee & Patterson, 2000 Ploeotia heracleum Larsen & Patterson, 1990
Amphidinium mootonorum Murray & Patterson, 2002 Fromentella Patterson & Zölffel, 1991 Notosolenus scutulum Larsen & Patterson, 1990 Ploeotia laminae Al Qassab, Lee, Murray & Patterson, 2002
Amphidinium yuroogurrum Murray & Patterson, 2002 Fromentella granulosa Patterson & Zölffel, 1991 Notosolenus steini Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 Ploeotia longifilum Larsen & Patterson, 1990
Ancyromonas Melba Patterson & Simpson, 1996 Glissandra Patterson i Simpson, 1996 Notosolenus tamanduensis Larsen i Patterson, 1990 Ploeotia obliqua Schroeckh, Lee & Patterson, 2003
Ancyromonas sinistrae Al Qassab, Lee, Murray & Patterson, 2002 Glissandra innuerende Patterson & Simpson, 1996 Notosolenus triangularis Larsen & Patterson, 1990 Ploeotia oblonga Larsen & Patterson, 1990
Anehmia Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 Goniomonas amphinema Larsen i Patterson, 1990 Notosolenus urceolatus Larsen & Patterson, 1990 Ploeotia plumosa Ekebom, Patterson & Vørs, 1996
Anehmia egzotyczna Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 Goniomonas pacifica Larsen & Patterson, 1990 Nuclearia flavescens Patterson, 1984 Ploeotia pseudonisonema Larsen & Patterson, 1990
Anisonema lodowaty Larsen i Patterson, 1990 Gyrodinium oblongum Larsen & Patterson, 1990 Nuclearia flavocapsulata Patterson, 1984 Ploeotia punctata Larsen & Patterson, 1990
Apusomonas australiensis Ekelund & Patterson, 1997 Heteronema exaratum Larsen & Patterson, 1990 Nuclearia leuckarti Patterson, 1984 Ploeotia robusta Larsen & Patterson, 1990
Astasia skvortzovi Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 Heteronema larseni Lee & Patterson, 2000 Nuklearia radianów Patterson, 1984 Ploeotia scrobiculata Larsen & Patterson, 1990
Axodines Patterson, 1994 Heteronema pterbica Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 Nuclearia ruber Patterson, 1984 Ploeotia tasmanica Lee, Simpson & Patterson, 2005
Barthelona Bernard Simpson & Patterson, 2000 Heteronema splendens Larsen & Patterson, 1990 Palustrimonas yorkeensis Patterson & Simpson, 1996 Ploeotia tenuis Larsen & Patterson, 1990
Barthelona vulgaris Bernard Simpson & Patterson, 2000 Heteronema vittatum Larsen & Patterson, 1990 Peranema dolichonema Larsen & Patterson, 1990 Protaspis gemmifera Larsen & Patterson, 1990
Bodo cephaloporus Larsen & Patterson, 1990 Jakoba Patterson, 1990 Peranema dolichonema Larsen & Patterson, 1990 Protaspis obliqua Larsen & Patterson, 1990
Bodo cygnus Patterson & Simpson, 1996 Jakoba incarcerata Bernard Simpson & Patterson, 2000 Peranema macrostoma Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 Protaspis tegere Larsen & Patterson, 1990
Bodo platyrhynchus Larsen i Patterson, 1990 Jakoba libera Patterson, 1990 Percolomonas Fenchel i Patterson, 1986 Protaspis verrucosa Larsen i Patterson, 1990
Bodo saliens Larsen & Patterson, 1990 Jenningsia curvicauda Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas cosmopolitus Fenchel i Patterson, 1986 Pseudoperanema dolichonema Larsen & Patterson, 1990
Bordnamonas Larsen & Patterson, 1990 Jenningsia deflexum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas cuspidata Larsen & Patterson, 1990 Pseudophyllomitus apiculatus Lee, 2002
Bordnamonas tropicana Larsen & Patterson, 1990 Jenningsia furcatum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas descissus Larsen & Patterson, 1990 Pseudophyllomitus granulatus Lee, 2002
Cabra Murray & Patterson, 2004 Jenningsia fusiforme Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas elephas Larsen & Patterson, 1990 Pseudophyllomitus vesiculosis Lee, 2002
Cabra matta Murray & Patterson, 2004 Jenningsia gbrum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas membranifera Larsen & Patterson, 1990 Pteridomonas danica Patterson & Fenchel, 1985
Caecitellus Patterson, Nygaard, Steinberg i Turley, 1993 Jenningsia granuliferum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas pyriformis Larsen & Patterson, 1990 Quasibodo Bernard Simpson & Patterson, 2000
Caecitellus parvulus Patterson, Nygaard, Steinberg i Turley, 1993 Jenningsia kupfferi Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas salinus Larsen i Patterson, 1990 Quasibodo śmieje się Bernard Simpson & Patterson, 2000
Kawiarnia Fenchel & Patterson, 1988 Jenningsia limax Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas similis Lee, Brandt, Vørs & Patterson, 2003 Ramicristates Patterson, 1994
Cafeteria ligulifera Larsen & Patterson, 1990 Jenningsia Macer Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas spinosus Larsen i Patterson, 1990 Rhabdomonas mirabilis Schroeckh, Lee & Patterson, 2003
Minuty kawiarni Larsen & Patterson, 1990 Jenningsia macrostomum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Percolomonas sulcatus Larsen & Patterson, 1990 Rhinodinium Murray, Hoppenrath, Preisfeld, Larsen, Yoshimatsu, Topriumi i Patterson, 2006
Cafeteria roenbergensis Fenchel & Patterson, 1988 Jenningsia nigrum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Petalomonas boadicea Larsen & Patterson, 1990 Rhinodinium broomeensis Murray, Hoppenrath, Preisfeld, Larsen, Yoshimatsu, Topriumi i Patterson, 2006
Carpediemonas Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 Jenningsia sacculus Lee, Blackmore & Patterson, 1999 Petalomonas calycimonoides Lee i Patterson, 2000 Rhizomonas setigera Patterson, Nygaard, Steinberg i Turley, 1993
Carpediemonas bialata Lee & Patterson, 2000 Kamera Patterson & Zölffel, 1991 Petalomonas christeni Lee & Patterson, 2000 Rhynchobodo Simius Patterson & Simpson, 1996
Carpediemonas membranifera Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 Obiektyw aparatu Patterson & Zölffel, 1991 Petalomonas compressa Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 Sciviamonas Ekelund, Patterson & Vørs w Ekelund & Patterson, 1997
Centroheliozoa Patterson, 1994 Kiitoksia kaloista Tong, Vørs & Patterson, 1997 Petalomonas intortus Lee & Patterson, 2000 Sciviamonas terricola Ekelund, Patterson & Vørs w Ekelund & Patterson, 1997
Cercomonas granulatus Lee & Patterson, 2000 Macappella Patterson & Zölffel, 1991 Petalomonas iugosus Lee i Patterson, 2000 Slabyrinthulids Patterson, 1994
Chlamydaster fimbriatus Dürrschmidt i Patterson, 1987 Massisteria Larsen & Patterson, 1990 Petalomonas labrum Lee i Patterson, 2000 Slanimals Patterson 1985
Ciliophrys azurina Mikrjukov & Patterson, 2001 Massisteria marina Larsen & Patterson, 1990 Petalomonas marginalis Larsen i Patterson, 1990 Sloomycetes Patterson, 1985
Clautriavia cavus Lee & Patterson, 2000 Mastigamoeba psammobia Larsen & Patterson, 1990 Petalomonas minor Larsen i Patterson, 1990 Slopalinida Patterson, 1985
Colpodella turpis Simpson & Patterson, 1996 Mastigamoeba punctachora Bernard Simpson & Patterson, 2000 Petalomonas physaloides Lee i Patterson, 2000 Sphenomonas alburiae Schroeckh, Lee & Patterson, 2003
Colpodella unguis Patterson & Simpson, 1996 Mastigamoeba schizofrenia Simpson, Bernard, Fenchel & Patterson, 1997 Petalomonas planus Lee i Patterson, 2000 Stramenochromes Patterson, 1989
Cristamonadida Brugerolle & Patterson Balerina Metafolliculina Mulisch, Harry, Patterson & Wyatt, 1986 Petalomonas poosilla Larsen & Patterson, 1990 Stramenopiles Patterson, 1994
Cryptaulax elegans Larsen & Patterson, 1990 Metopion Larsen i Patterson, 1990 Petalomonas quinquecarinata Lee & Patterson, 2000 Tetradimorpha pterbica Mikrjukov & Patterson, w Mikrjukov, 2000
Dinema dimorphum Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 Metopion fluens Larsen & Patterson, 1990 Petalomonas raiula Larsen & Patterson, 1990 Thecamonas Larsen & Patterson, 1990
Dinema inaequale Larsen & Patterson, 1990 Metromonas Larsen i Patterson, 1990 Petalomonas spinifera Lee i Patterson, 2000 Thecamonas filosa Larsen & Patterson, 1990
Dinema litorale Larsen & Patterson, 1990 Metromonas grandis Larsen & Patterson, 1990 Petalomonas virgatus Lee & Patterson, 2000 Thecamonas mutabilis Larsen & Patterson, 1990
Dinema maculata Larsen & Patterson, 1990 Metromonas simplex Larsen & Patterson, 1990 Petalomonas virgatus Lee & Patterson, 2000 Thecamonas trahens Larsen & Patterson, 1990
Dinema platysomum Lee & Patterson, 2000 Ministeria Patterson, Nygaard, Steinberg i Turley, 1993 Phyllomitus granulatus Larsen i Patterson, 1990 Toshiba Patterson & Zölffel, 1991
Dinema validum Larsen & Patterson, 1990 Ministeria marisola Patterson, Nygaard, Steinberg i Turley, 1993 Phyllomitus vesiculosus Larsen & Patterson, 1990 Toshiba vorax Patterson & Zölffel, 1991
Dinematomonas inaequale Larsen i Patterson, 1990 Monotrichomonas Bernard Simpson & Patterson, 2000 Platychilomonas Larsen i Patterson, 1990 Trimastix inaequalis Bernard Simpson & Patterson, 2000
Dinematomonas litorale Larsen & Patterson, 1990 Monotrichomonas carabina Bernard Simpson & Patterson, 2000 Platychilomonas psammobia Larsen & Patterson, 1990 Urceolus cornutus Larsen & Patterson, 1990
Dinematomonas maculata Larsen & Patterson, 1990 Notosolenus Adamus Lee i Patterson, 2000 Plaustrimonas Patterson & Simpson, 1996 Urceolus costatus Larsen & Patterson, 1990
Dinematomonas valida Larsen & Patterson, 1990 Notosolenus alatellus Larsen & Patterson, 1990 Pleurostomum turgidum Patterson & Simpson, 1996
Dingensia Patterson & Zölffel, 1991 Notosolenus brothernis Lee & Patterson, 2000 Ploeotia adhaerens Larsen & Patterson, 1990