Davida J. Pattersona
David Joseph Patterson jest północnoirlandzkim taksonomistą specjalizującym się w pierwotniakach i wykorzystaniu taksonomii w informatyce różnorodności biologicznej .
Wczesne życie i edukacja
David Joseph Patterson urodził się w Belfaście w Irlandii Północnej 19 kwietnia 1950 r. Jako syn Doris Mary (z domu Bell) i Samuela Pattersona, z jednym starszym bratem (matematyk Samuel James ) i siostrą (Frances Mary). Ojciec Alice Mii Vørs Patterson, Daniela Kierana Pattersona i Williama Zhao Pattersona. Kształcił się w szkołach podstawowych Belmont, Strandtown i Grosvenor High w Belfaście. Uzyskał tytuł Bachelor of Science z wyróżnieniem pierwszej klasy na Queen's University Belfast w 1971 roku.
Kariera
David Patterson uzyskał tytuł doktora filozofii na Uniwersytecie w Bristolu w 1976 r., gdzie był później zatrudniony (1977–1993). Uzyskał tytuł doktora nauk ścisłych w 1990 roku na Queen's University w Belfaście. W 1993 roku przeniósł się do University of Sydney w Australii , gdzie został dyrektorem Szkoły Nauk Biologicznych. W 2004 roku przeniósł się do Laboratorium Biologii Morskiej w Woods Hole (Mass., USA), gdzie współtworzył projekt Encyclopedia of Life odpowiedzialny za komponent informatyczny, opierając EOL na modelu opracowanym w ramach projektu micro*scope. W latach 2012-2014 był profesorem naukowym na Arizona State University; a także był profesorem (MBL) na Uniwersytecie Browna w Providence w stanie Rhode Island oraz emerytowanym profesorem na Uniwersytecie w Sydney w Sydney w Australii. Jako taksonomista interesował się przede wszystkim różnorodnością pierwotniaków i ewolucją protistów. On i jego współpracownicy opisali około 250 nowych taksonów. David Patterson otrzymał nagrodę im. Thomasa Henry'ego Huxleya oraz Medal Naukowy Towarzystwa Zoologicznego w Londynie; był sekretarzem Sekcji Brytyjskiej Towarzystwa Protozoologów; Prezes Międzynarodowego Towarzystwa Protistologii Ewolucyjnej; i wiceprzewodniczący (Międzynarodowego) Towarzystwa Protozoologii. Był członkiem Międzynarodowej Komisji Nomenklatury Zoologicznej, Komitetu Redakcyjnego ds. Glonów Międzynarodowego Stowarzyszenia Taksonomii Roślin, Komitetu Wykonawczego Międzynarodowej Unii Nauk Biologicznych oraz Komitetu Naukowego Światowego Systemu Danych.
Opublikował około 200 recenzowanych artykułów, w tym kilka książek w całej swojej karierze. Początkowe zainteresowania fizjologią jonów, regulacją objętości i kurczliwymi wakuolami przesunęły się w kierunku badań ultrastrukturalnych, techniki, która zmieniła rozumienie różnorodności protistów, z kolei została dodatkowo wzbogacona przez porównawcze badania molekularne. Wraz z Guyem Brugerolle przedstawił swoją koncepcję, zgodnie z którą klady protistów można z pożytkiem identyfikować na podstawie dopełnienia i ułożenia organelli - to jest ich ultrastrukturalna tożsamość, a później wykorzystał tę koncepcję wraz z uzasadnieniem przekształconej kladystyki, aby na nowo zdefiniować różnorodność kladów wśród eukariontów . Uprościło to wyzwanie ustalenia pełnej filogenezy eukariontów, dostarczając listę kladów, między którymi należało ustalić pokrewieństwo.
W połowie lat osiemdziesiątych Patterson skupił swoje wysiłki na wolno żyjących heterotroficznych wiciowcach, ponieważ były one słabo poznane i nie były aktywnie badane. Dwa obszary badań były utrudnione z powodu braku świadomości różnorodności wiciowców. Pierwszym z nich była pojawiająca się koncepcja mikrobiologicznych sieci pokarmowych, która zmieniła sposób postrzegania dynamiki ekosystemów oceanicznych – sama w sobie ma kluczowe znaczenie dla międzynarodowego badania Joint Global Ocean Flux Study, którego celem jest lepsze zrozumienie przepływów węgla i globalnego ocieplenia. Po drugie, ponieważ najbardziej prymitywne eukarionty nosiły wici, oczekiwano, że zrozumienie różnorodności różnorodności wiciowców zapewni lepszy wgląd w eukariotyczne przodkowie i ewolucję. Wraz ze współpracownikami doprowadziło to do rozpoznania nowych domen różnorodności protistanu - takich jak stramenopile , pęcherzyki płucne i wykopaliska ( excavata ) - solidnie zdefiniowanych przez odniesienie do amorfii, wówczas rzadkości w protistologii.
Patterson zbadał pojawiającą się iw dużej mierze teoretyczną koncepcję, zgodnie z którą większość drobnoustrojów powinna mieć uniwersalną dystrybucję, początkowo sformułowaną przez Lourensa Baasa Beckinga i odświeżoną przez Toma Fenchela i Blanda Finlaya . Stosując znormalizowane protokoły pobierania próbek, dokumentacji i raportowania do społeczności żyjących w obszarach morskich, słodkowodnych i skrajnych, na Pacyfiku i Atlantyku, na półkulach północnej i południowej, w siedliskach przybrzeżnych i osadach głębinowych (itp.), on i współpracownicy obalili hipoteza, że skład taksonomiczny zbiorowisk wolno żyjących wiciowców był determinowany czynnikami geograficznymi. Ta wiedza wyeliminowała potrzebę posiadania lokalnych katalogów i ekspertyz, przyspieszając badania taksonomiczne, filogenetyczne i ekologiczne z udziałem wiciowców.
Później jego zainteresowania przesunęły się na osadzanie wiedzy taksonomicznej w narzędziach do zarządzania informacjami o różnorodności biologicznej. Był starszym taksonomistą w projekcie Encyclopedia of Life, doradcą Fundacji Alfreda P. Sloana, coPI w Data Conservancy i finansowanym przez NSF projekcie Global Names oraz członkiem zespołu Plazi. Był głównym inicjatorem projektu Global Names Architecture.
Taksony nazwane jego imieniem obejmują Pattersoniella vitiphila , Foissner, 1987; Protoopalina pattersonii Delvinquier, 1995; Nuclearia pattersonii , Nerad, Silberman i in., 2008; Pseudovorticella pattersoni , Sun, Ji, Warren i Song 2009 oraz Stephanopogon pattersoni Lee Miller i Simpson, 2014.
Opisane taksony
Actinophrys salsuginosa Mikrjukov & Patterson, 2001 | Digensia angusta Patterson & Zölffel, 1991 | Notosolenus hamelini Al Qassab, Lee, Murray & Patterson, 2002 | Ploeotia adhaerens Larsen & Patterson, 1990 |
Actinophrys tauryanini Mikrjukov & Patterson, 2001 | Dyplomowany chodzący Larsen & Patterson, 1990 | Notosolenus hemicircularis Lee & Patterson, 2000 | Ploeotia amygdala Lee, Brandt, Vørs & Patterson, 2003 |
Adriamonas Verhagen, Zölffel, Brugerolle i Patterson, 1994 | Dyplom metaboliczny Larsen & Patterson, 1990 | Notosolenus lashue Lee & Patterson, 2000 | Ploeotia azurina Patterson & Simpson, 1996 |
Adriamonas peritocrescens Verhagen, Zölffel, Brugerolle i Patterson, 1994 | Dolium Larsen i Patterson, 1990 | Notosolenus mediocanellatus Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 | Ploeotia corrugata Larsen & Patterson, 1990 |
Amphidiniopsis korewalensis Murray & Patterson, 2002 | Dolium sedentarium Larsen & Patterson, 1990 | Notosolenus navicula Larsen & Patterson, 1990 | Ploeotia decipiens Larsen & Patterson, 1990 |
Amphidinium boggayum Murray & Patterson, 2002 | Eufolliculina uhligi Mulisch & Patterson, 1983 | Notosolenus ostium Larsen & Patterson, 1990 | Ploeotia discoides Larsen & Patterson, 1990 |
Amphidinium corrugatum Larsen & Patterson, 1990 | Eumycetes Patterson, 1994 | Notosolenus pyriforme Lee & Patterson, 2000 | Ploeotia heracleum Larsen & Patterson, 1990 |
Amphidinium mootonorum Murray & Patterson, 2002 | Fromentella Patterson & Zölffel, 1991 | Notosolenus scutulum Larsen & Patterson, 1990 | Ploeotia laminae Al Qassab, Lee, Murray & Patterson, 2002 |
Amphidinium yuroogurrum Murray & Patterson, 2002 | Fromentella granulosa Patterson & Zölffel, 1991 | Notosolenus steini Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 | Ploeotia longifilum Larsen & Patterson, 1990 |
Ancyromonas Melba Patterson & Simpson, 1996 | Glissandra Patterson i Simpson, 1996 | Notosolenus tamanduensis Larsen i Patterson, 1990 | Ploeotia obliqua Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 |
Ancyromonas sinistrae Al Qassab, Lee, Murray & Patterson, 2002 | Glissandra innuerende Patterson & Simpson, 1996 | Notosolenus triangularis Larsen & Patterson, 1990 | Ploeotia oblonga Larsen & Patterson, 1990 |
Anehmia Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 | Goniomonas amphinema Larsen i Patterson, 1990 | Notosolenus urceolatus Larsen & Patterson, 1990 | Ploeotia plumosa Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 |
Anehmia egzotyczna Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 | Goniomonas pacifica Larsen & Patterson, 1990 | Nuclearia flavescens Patterson, 1984 | Ploeotia pseudonisonema Larsen & Patterson, 1990 |
Anisonema lodowaty Larsen i Patterson, 1990 | Gyrodinium oblongum Larsen & Patterson, 1990 | Nuclearia flavocapsulata Patterson, 1984 | Ploeotia punctata Larsen & Patterson, 1990 |
Apusomonas australiensis Ekelund & Patterson, 1997 | Heteronema exaratum Larsen & Patterson, 1990 | Nuclearia leuckarti Patterson, 1984 | Ploeotia robusta Larsen & Patterson, 1990 |
Astasia skvortzovi Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 | Heteronema larseni Lee & Patterson, 2000 | Nuklearia radianów Patterson, 1984 | Ploeotia scrobiculata Larsen & Patterson, 1990 |
Axodines Patterson, 1994 | Heteronema pterbica Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 | Nuclearia ruber Patterson, 1984 | Ploeotia tasmanica Lee, Simpson & Patterson, 2005 |
Barthelona Bernard Simpson & Patterson, 2000 | Heteronema splendens Larsen & Patterson, 1990 | Palustrimonas yorkeensis Patterson & Simpson, 1996 | Ploeotia tenuis Larsen & Patterson, 1990 |
Barthelona vulgaris Bernard Simpson & Patterson, 2000 | Heteronema vittatum Larsen & Patterson, 1990 | Peranema dolichonema Larsen & Patterson, 1990 | Protaspis gemmifera Larsen & Patterson, 1990 |
Bodo cephaloporus Larsen & Patterson, 1990 | Jakoba Patterson, 1990 | Peranema dolichonema Larsen & Patterson, 1990 | Protaspis obliqua Larsen & Patterson, 1990 |
Bodo cygnus Patterson & Simpson, 1996 | Jakoba incarcerata Bernard Simpson & Patterson, 2000 | Peranema macrostoma Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 | Protaspis tegere Larsen & Patterson, 1990 |
Bodo platyrhynchus Larsen i Patterson, 1990 | Jakoba libera Patterson, 1990 | Percolomonas Fenchel i Patterson, 1986 | Protaspis verrucosa Larsen i Patterson, 1990 |
Bodo saliens Larsen & Patterson, 1990 | Jenningsia curvicauda Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas cosmopolitus Fenchel i Patterson, 1986 | Pseudoperanema dolichonema Larsen & Patterson, 1990 |
Bordnamonas Larsen & Patterson, 1990 | Jenningsia deflexum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas cuspidata Larsen & Patterson, 1990 | Pseudophyllomitus apiculatus Lee, 2002 |
Bordnamonas tropicana Larsen & Patterson, 1990 | Jenningsia furcatum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas descissus Larsen & Patterson, 1990 | Pseudophyllomitus granulatus Lee, 2002 |
Cabra Murray & Patterson, 2004 | Jenningsia fusiforme Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas elephas Larsen & Patterson, 1990 | Pseudophyllomitus vesiculosis Lee, 2002 |
Cabra matta Murray & Patterson, 2004 | Jenningsia gbrum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas membranifera Larsen & Patterson, 1990 | Pteridomonas danica Patterson & Fenchel, 1985 |
Caecitellus Patterson, Nygaard, Steinberg i Turley, 1993 | Jenningsia granuliferum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas pyriformis Larsen & Patterson, 1990 | Quasibodo Bernard Simpson & Patterson, 2000 |
Caecitellus parvulus Patterson, Nygaard, Steinberg i Turley, 1993 | Jenningsia kupfferi Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas salinus Larsen i Patterson, 1990 | Quasibodo śmieje się Bernard Simpson & Patterson, 2000 |
Kawiarnia Fenchel & Patterson, 1988 | Jenningsia limax Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas similis Lee, Brandt, Vørs & Patterson, 2003 | Ramicristates Patterson, 1994 |
Cafeteria ligulifera Larsen & Patterson, 1990 | Jenningsia Macer Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas spinosus Larsen i Patterson, 1990 | Rhabdomonas mirabilis Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 |
Minuty kawiarni Larsen & Patterson, 1990 | Jenningsia macrostomum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Percolomonas sulcatus Larsen & Patterson, 1990 | Rhinodinium Murray, Hoppenrath, Preisfeld, Larsen, Yoshimatsu, Topriumi i Patterson, 2006 |
Cafeteria roenbergensis Fenchel & Patterson, 1988 | Jenningsia nigrum Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Petalomonas boadicea Larsen & Patterson, 1990 | Rhinodinium broomeensis Murray, Hoppenrath, Preisfeld, Larsen, Yoshimatsu, Topriumi i Patterson, 2006 |
Carpediemonas Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 | Jenningsia sacculus Lee, Blackmore & Patterson, 1999 | Petalomonas calycimonoides Lee i Patterson, 2000 | Rhizomonas setigera Patterson, Nygaard, Steinberg i Turley, 1993 |
Carpediemonas bialata Lee & Patterson, 2000 | Kamera Patterson & Zölffel, 1991 | Petalomonas christeni Lee & Patterson, 2000 | Rhynchobodo Simius Patterson & Simpson, 1996 |
Carpediemonas membranifera Ekebom, Patterson & Vørs, 1996 | Obiektyw aparatu Patterson & Zölffel, 1991 | Petalomonas compressa Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 | Sciviamonas Ekelund, Patterson & Vørs w Ekelund & Patterson, 1997 |
Centroheliozoa Patterson, 1994 | Kiitoksia kaloista Tong, Vørs & Patterson, 1997 | Petalomonas intortus Lee & Patterson, 2000 | Sciviamonas terricola Ekelund, Patterson & Vørs w Ekelund & Patterson, 1997 |
Cercomonas granulatus Lee & Patterson, 2000 | Macappella Patterson & Zölffel, 1991 | Petalomonas iugosus Lee i Patterson, 2000 | Slabyrinthulids Patterson, 1994 |
Chlamydaster fimbriatus Dürrschmidt i Patterson, 1987 | Massisteria Larsen & Patterson, 1990 | Petalomonas labrum Lee i Patterson, 2000 | Slanimals Patterson 1985 |
Ciliophrys azurina Mikrjukov & Patterson, 2001 | Massisteria marina Larsen & Patterson, 1990 | Petalomonas marginalis Larsen i Patterson, 1990 | Sloomycetes Patterson, 1985 |
Clautriavia cavus Lee & Patterson, 2000 | Mastigamoeba psammobia Larsen & Patterson, 1990 | Petalomonas minor Larsen i Patterson, 1990 | Slopalinida Patterson, 1985 |
Colpodella turpis Simpson & Patterson, 1996 | Mastigamoeba punctachora Bernard Simpson & Patterson, 2000 | Petalomonas physaloides Lee i Patterson, 2000 | Sphenomonas alburiae Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 |
Colpodella unguis Patterson & Simpson, 1996 | Mastigamoeba schizofrenia Simpson, Bernard, Fenchel & Patterson, 1997 | Petalomonas planus Lee i Patterson, 2000 | Stramenochromes Patterson, 1989 |
Cristamonadida Brugerolle & Patterson | Balerina Metafolliculina Mulisch, Harry, Patterson & Wyatt, 1986 | Petalomonas poosilla Larsen & Patterson, 1990 | Stramenopiles Patterson, 1994 |
Cryptaulax elegans Larsen & Patterson, 1990 | Metopion Larsen i Patterson, 1990 | Petalomonas quinquecarinata Lee & Patterson, 2000 | Tetradimorpha pterbica Mikrjukov & Patterson, w Mikrjukov, 2000 |
Dinema dimorphum Schroeckh, Lee & Patterson, 2003 | Metopion fluens Larsen & Patterson, 1990 | Petalomonas raiula Larsen & Patterson, 1990 | Thecamonas Larsen & Patterson, 1990 |
Dinema inaequale Larsen & Patterson, 1990 | Metromonas Larsen i Patterson, 1990 | Petalomonas spinifera Lee i Patterson, 2000 | Thecamonas filosa Larsen & Patterson, 1990 |
Dinema litorale Larsen & Patterson, 1990 | Metromonas grandis Larsen & Patterson, 1990 | Petalomonas virgatus Lee & Patterson, 2000 | Thecamonas mutabilis Larsen & Patterson, 1990 |
Dinema maculata Larsen & Patterson, 1990 | Metromonas simplex Larsen & Patterson, 1990 | Petalomonas virgatus Lee & Patterson, 2000 | Thecamonas trahens Larsen & Patterson, 1990 |
Dinema platysomum Lee & Patterson, 2000 | Ministeria Patterson, Nygaard, Steinberg i Turley, 1993 | Phyllomitus granulatus Larsen i Patterson, 1990 | Toshiba Patterson & Zölffel, 1991 |
Dinema validum Larsen & Patterson, 1990 | Ministeria marisola Patterson, Nygaard, Steinberg i Turley, 1993 | Phyllomitus vesiculosus Larsen & Patterson, 1990 | Toshiba vorax Patterson & Zölffel, 1991 |
Dinematomonas inaequale Larsen i Patterson, 1990 | Monotrichomonas Bernard Simpson & Patterson, 2000 | Platychilomonas Larsen i Patterson, 1990 | Trimastix inaequalis Bernard Simpson & Patterson, 2000 |
Dinematomonas litorale Larsen & Patterson, 1990 | Monotrichomonas carabina Bernard Simpson & Patterson, 2000 | Platychilomonas psammobia Larsen & Patterson, 1990 | Urceolus cornutus Larsen & Patterson, 1990 |
Dinematomonas maculata Larsen & Patterson, 1990 | Notosolenus Adamus Lee i Patterson, 2000 | Plaustrimonas Patterson & Simpson, 1996 | Urceolus costatus Larsen & Patterson, 1990 |
Dinematomonas valida Larsen & Patterson, 1990 | Notosolenus alatellus Larsen & Patterson, 1990 | Pleurostomum turgidum Patterson & Simpson, 1996 | |
Dingensia Patterson & Zölffel, 1991 | Notosolenus brothernis Lee & Patterson, 2000 | Ploeotia adhaerens Larsen & Patterson, 1990 |
- http://eol.org
- mikro*zakres https://web.archive.org/web/20140729041740/http://pinkava.asu.edu/starcentral/microscope/portal.php
- http://dataconservancy.org
- http://globalnames.org
- Szkic biograficzny dla MBL
- To przyszło ze stawu - wywiad z Davidem J. Pattersonem