Deinococcus aerius
| Deinococcus aerius | |
|---|---|
| Klasyfikacja naukowa | |
| Domena: | Bakteria |
| Gromada: | deinokokota |
| Klasa: | Deinokoki |
| Zamówienie: | Deinokoki |
| Rodzina: | Deinococcaceae |
| Rodzaj: | Deinokoki |
| Gatunek: |
D. aerius
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Deinococcus aerius Yang i in., 2009
|
|
Deinococcus aerius to bakteria beztlenowa , którą można znaleźć w atmosferze nad wyspą japońską. Życie w takich warunkach sprawia, że bakterie te są bardzo odporne na wysychanie , promieniowanie UV-C i gamma . Chociaż wcześniej niezidentyfikowany jako szczep TR0125, bakteria ta została określona jako Deinococcus aerius przez sekwencjonowanie 16S rRNA .
Typ Grama, morfologia
Podczas wzrostu na agarze wzbogacanym beztlenowo zaobserwowano, że kolonie D. aerius były „okrągłe, wypukłe, błyszczące i pomarańczowe”. Barwienie Grama wykazało, że bakterie te są Gram-dodatnie. Skaningowa mikroskopia elektronowa wykazała, że komórki tej bakterii mają okrągły kształt i rozmiar około 1,0–1,5 mikrometra. Ponadto stwierdzono, że istnieją jako „pojedyncze komórki lub w parach, tetradach lub klastrach”.
Metabolizm
Kilka testów metabolizmu wykazało, że D. aerius nie bierze udziału w „redukcji azotanów, aktywności ureazy , hydrolazy argininowej i dekarboksylazy ornityny i nie jest w stanie wykorzystać niektórych źródeł węgla”. Jednak późniejsze badania wykazały, że bakterie te są w stanie rosnąć przy użyciu „ arabinozy , glukozaminy , ornityny , glutaminianu , maltozy , sacharozy, proliny , rafinozy , cysteiny , lizyny i metioniny ” jako źródeł węgla.
Gdzie się znajduje
Deinokoki. aerius był wcześniej izolowany z atmosfery nad Japonią na wysokości od 0,8 do 5,8 km. W tym celu pobrano próbki pyłu „na filtry membranowe za pomocą próbnika powietrza ASD1”. Próbki następnie inkubowano na agarze wzbogacającym beztlenowym i szczep TR0125 zidentyfikowano jako D. aerius.
Media uprawiane na
Deinococcus aerius hodowano na agarze mTGE zawierającym ekstrakt wołowy , trypton , glukozę i agar Difto Bacto . Analiza wzrostu wykazała, że bakteria ta najlepiej rozwija się w temperaturach między 25-30 °C i nie rośnie w 4, 10 lub 47 °C.
Ekologia
Ponieważ tak niewiele wiadomo na temat tego organizmu, jego interakcje z przedstawicielami jego rodzaju, a także innymi organizmami, są nadal nieznane.
Różnorodność
Korzystając z sekwencjonowania 16S rRNA, D. aerius można było umieścić na drzewie filogenetycznym , aby określić jego powiązania z innymi organizmami z rodzaju. Analiza genomu wykazała, że D. aerius miał 92,3% podobieństwa genomowego do D. geothermalis i 95,7% podobieństwa genomowego do D. apachensi .
Genom
cech genomu D. aerius zastosowano sekwencjonowanie całego genomu. Stwierdzono, że genom miał całkowitą długość 4 524 446 par zasad . Zawierało to 4446 sekwencji kodujących białka, 52 operony tRNA i 1 operon rRNA ”. Zaobserwowano, że D. aerius nie rośnie tak dobrze, jak inne gatunki Deinococcus , co może częściowo wynikać z jego pojedynczego operonu rRNA. Posiadanie tylko jednego operonu rRNA zmniejszyłoby szybkość syntezy białek w tych bakteriach, zmniejszając w ten sposób tempo możliwego wzrostu.