Densovirinae
| Klasyfikacja wirusów | |
|---|---|
| Densovirinae | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Monodnaviria |
| Królestwo: | Shotokuvirae |
| Gromada: | Cossaviricota |
| Klasa: | Quintoviricetes |
| Zamówienie: | Piccovirales |
| Rodzina: | Parvoviridae |
| Podrodzina: | Densovirinae |
| Rodzaje | |
Densovirinae to podrodzina jednoniciowych wirusów DNA z rodziny Parvoviridae . Podrodzina ma 11 uznanych rodzajów i 21 gatunków. Wiadomo, że densowirusy infekują przedstawicieli rzędów owadów Blattodea , Diptera , Hemiptera , Hymenoptera , Lepidoptera i Orthoptera , podczas gdy niektóre wirusy infekują i namnażają się w skorupiakach, takich jak krewetki lub raki , lub rozgwiazdy z rodzaju Echinodermata .
Wirusologia
Densowirusy są małe (średnica 18–26 nanometrów) i nie mają otoczki. Wiriony mają kształt dwudziestościanu z liczbą triangulacji (T) = 1. W wirionie znajduje się 60 kopii białka otoczki. Każda kopia ma kształt opisany jako „kwadratowy klin w kształcie latawca”, a wygląd powierzchni jest szorstki z wieloma małymi wypustkami. Wydaje się, że wiriony nie zawierają lipidów .
Genomy nie są podzielone na segmenty, mają długość około 4–6 kilozasad i zwykle zawierają dwie lub trzy otwarte ramki odczytu . Otwarta ramka odczytu 5' koduje dwa białka niestrukturalne (NS-1 i NS-2), a otwarta ramka odczytu 3' koduje dwa lub trzy białka kapsydu (VP1, VP2, VP3). Zarówno końce 5', jak i 3' mają pętle spinki do włosów. Jeśli obecna jest trzecia otwarta ramka odczytu (w zależności od rodzaju), koduje ona drugie niestrukturalne białko. Genom jest ambisensowny, koduje białka zarówno w kierunku dodatnim, jak i ujemnym. Regulacja transkrypcji i modyfikacja potranskrypcyjna są wykorzystywane do produkcji różnych białek niestrukturalnych i białek strukturalnych.
Wiriony dostają się do komórki gospodarza poprzez przyłączenie się do receptorów gospodarza, w czym może pośredniczyć endocytoza za pośrednictwem klatryny lub niezależna od klatryny endocytoza zależna od dynaminy . Białko NS-1 ma nadrodzinę 3 helikazy DNA i motyw endonukleazy HuH. Motywy te są powszechne w małych wirusach DNA. Białka, które zawierają te motywy, wiążą się z wirusowymi miejscami startu replikacji oraz rozwijają i nacinają te miejsca, umożliwiając białkom gospodarza dostęp do genomu wirusa w celu replikacji i transkrypcji . Genom jest replikowany przez unikalny mechanizm obracającej się szpilki do włosów. Transkrypcja na matrycy DNA, z pewnym alternatywnym mechanizmem składania, jest sposobem transkrypcji.
Taksonomia
Obecnie rozpoznawanych jest jedenaście rodzajów, obejmujących łącznie 21 gatunków:
- akwambidensowirus
- Blattamambidensowirus
- Diciambidensowirus
- Hemiambidensowirus
- Iteradensowirus
- Miniambidensowirus
- Muskodensowirus
- Pefuambidensowirus
- Protoambidensowirus
- Scindoambidensowirus
- Tetuambidensowirus
Ambidensovirus był wcześniej uznawany za rodzaj, ale w 2019 roku został podzielony na sześć rodzajów poprzedzonych przedrostkiem Aqu -, Blatt -, Hemi -, Pefu -, Proto - i Scindo -.