Domena czynnika von Willebranda typu D
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VWD | |||||||||
| Symbol | VWD | ||||||||
| Pfam | PF00094 | ||||||||
| InterPro | IPR001846 | ||||||||
| PROZYTA | PS51233 | ||||||||
| |||||||||
Domena czynnika von Willebranda typu D (vWD) to konserwatywna ewolucyjnie domena białkowa występująca m.in. w czynniku von Willebranda (vWF). vWF to duża multimeryczna glikoproteina , syntetyzowana przez rodzaj komórek szpiku kostnego zwanych megakariocytami . Domena vWD umożliwia vWF pełnienie funkcji krzepnięcia krwi poprzez przenoszenie czynnika VIII .
Struktura
Domena D8 ( aminokwasy 6-102 w vWF) jest wysoce ustrukturyzowanym regionem zawierającym 24 sparowane reszty cysteiny . Przewidywanie struktury drugorzędowej na podstawie 75 dopasowanych sekwencji vWF ujawniło w dużym stopniu naprzemienną sekwencję helis alfa i nici beta w większym białku vWF.
vWD jest widoczny jako płaty na obrazach krio-EM vWF. W domenie „D” vWF jest powiązany z kilkoma innymi domenami bogatymi w cysteinę o nazwach C8 ( Pfam PF08742 ), TIL ( Pfam PF01826 ) i vWE. Struktura krystaliczna domen „D” w vWF (D 'i D3) została rozwiązana w 2018 roku (). Właściwa domena VWD i domena vWE składają się głównie z antyrównoległych arkuszy beta. C8 składa się w kilka helis. TIL to głównie pętle z triadą arkuszy beta. VWD zawiera również miejsce wiązania wapnia. Wszystkie te domeny są bogate w disiarczki.
Funkcjonować
Domena vWD D'/D3 czynnika von Willebranda (vWF) służy jako nośnik czynnika krzepnięcia VIII (FVIII). Natywna konformacja domeny D' vWF jest wymagana nie tylko do wiązania czynnika VIII (FVIII), ale także do normalnej multimeryzacji i optymalnego wydzielania . Interakcja między krzepnięcia krwi VIII a VWF jest niezbędna do normalnego przeżycia czynnika krzepliwości krwi VIII w krążeniu krwi. Domena VWFD jest wysoce ustrukturyzowanym regionem, w którym została zachowana pierwsza Stwierdzono, że Cys tworzy mostek dwusiarczkowy z drugim konserwowanym. Inne domeny D w białku są niezbędne do multimeryzacji .
Domena ta znajduje się w mucynach , w zonadhezynie , w otogelinie iw witellogeninie . Wiele z tych białek to glikoproteiny zewnątrzkomórkowe. Występuje również w 2-monooksygenazie Cypridina-luciferin . Jego rzeczywiste funkcje w tych białkach są nieznane.