Ekstensyna
Ekstensyny to rodzina giętkich, podobnych do pręcików glikoprotein bogatych w hydroksyprolinę (HRGP) ściany komórkowej roślin .
Są to bardzo obfite białka. Arabidopsis thaliana ma około 20 rozszerzeń . Tworzą usieciowane sieci w młodej ścianie komórkowej. Zazwyczaj mają dwa główne diagnostyczne powtarzające się motywy peptydowe, jeden hydrofilowy , a drugi hydrofobowy , z potencjałem do sieciowania. Uważa się, że ekstensyny działają jak samoorganizujące się amfifile niezbędne do składania i wzrostu ściany komórkowej poprzez wydłużanie i ekspansję komórek. Nazwa „extensin” zawiera w sobie hipotezę, że są one zaangażowane w wydłużanie komórek.
Motyw hydrofilowy
Ten pentapeptyd składa się z seryny (Ser) i czterech hydroksyprolin (Hyp): Ser-Hyp-Hyp-Hyp-Hyp. Hydroksyprolina jest niezwykła nie tylko jako aminokwas cykliczny, który ogranicza elastyczność peptydów, ale także jako aminokwas bez kodonu, kodowany jako prolina . Polipeptydy przeznaczone do sekrecji są następnie hydroksylowane przez bezpośrednie dodanie tlenu cząsteczkowego do proliny w pozycji C-4. Ekstensyna hydroksyprolina jest wyjątkowo glikozylowana krótkimi łańcuchami L-arabinozy , które dodatkowo usztywniają i zwiększają hydrofilowość. Generalnie seryna ma przyłączoną pojedynczą galaktozę.
Hydrofobowy motyw sieciowania tyrozyny
Dwie tyrozyny oddzielone pojedynczym aminokwasem, zwykle waliną lub inną tyrozyną, tworzą krótkie wewnątrzcząsteczkowe wiązanie sieciujące eteru difenylowego. Może to być dalej sieciowane przez enzym peroksydazę ekstensyny, tworząc międzycząsteczkowy mostek między cząsteczkami ekstensyny, tworząc w ten sposób sieci i arkusze.
Dalsza lektura
- Kieliszewski M, Lamport DTA (1994) Extensin: powtarzające się motywy, miejsca funkcjonalne, kody posttranslacyjne i filogeneza Plant Journal 5: 157–172 [ martwy link ]