FAKT (biologia)

FACT ( ułatwia transkrypcję chromatyny , czasami ułatwia transkrypcję chromatyny ) jest heterodimerycznym kompleksem białkowym , który wpływa na wydłużenie transkrypcji eukariotycznej polimerazy RNA II (Pol II) zarówno in vitro , jak i in vivo . Został odkryty w 1998 roku jako czynnik oczyszczony z komórek ludzkich, który był niezbędny do produktywnej transkrypcji Pol II in vitro na chromatynizowanej matrycy DNA.

FACT składa się z podjednostek 140 i 80 kilodaltonów (kDa). Podjednostka 140 kDa jest kodowana przez ludzki gen SUPT16H (36% identyczny z genem Spt16 S. cerevisiae ), podczas gdy podjednostka 80 kDa jest kodowana przez ludzki gen SSRP1 (POB3 w S. cerevisiae ). Obie te podjednostki w drożdżach wpływają na wydłużenie transkrypcji Pol II, a oczyszczony ludzki FACT wiąże się specyficznie z mononukleosomami i dimerem histonu H2A / H2B , ale nie z tetramerem H3 / H4 (patrz: cząstka rdzenia nukleosomu ) lub Pol II.

koimmunoprecypitacji ze znakowanymi rekombinowanymi białkami wykazały, że podjednostka Spt16 oddziałuje z dimerami i mononukleosomami H2A/H2B, ale nie z tetramerami H3/H4, podczas gdy podjednostka SSRP1 oddziałuje tylko z tetramerami H3/H4, a nie z mononukleosomami. Delecja silnie kwaśnego C-końca Spt16 (wspólna cecha znanych białek opiekuńczych histonów) nie uniemożliwia Spt16 tworzenia stabilnego kompleksu z SSRP1, ale eliminuje oddziaływanie z mononukleosomami i zdolność do stymulacji transkrypcji in vitro na chromatynizowanych matrycach. Te dwie podjednostki razem, ale nie osobno, mogą stymulować tworzenie nukleosomów z wolnych histonów i DNA ( białek opiekuńczych histonów ). Te dwie podjednostki są wysoce konserwatywne we wszystkich eukariontach i wykazano, że oprócz transkrypcji wpływają również na naprawę i replikację DNA.

W komórkach FACT jest wzbogacony w części genomu zaangażowane w aktywne wydłużanie Pol II, co widać w barwieniu fluorescencyjnym przeciwciałem chromosomów politenu Drosophila i testach immunoprecypitacji chromatyny (ChIP) na ekstraktach komórkowych Drosophila Kc.

Dalsza lektura

Reinberg, D., Sims, R. (2006). de FACTo Dynamika nukleosomów . Journal of Biological Chemistry, 281 (33) 23297-23391.