Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
SUPT16H
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, CDC68, FACTP140, SPT16/CDC68, SPT16, homolog SPT16, ułatwia podjednostkę przebudowy chromatyny,
identyfikatory zewnętrzne NEDDFAC
Wikidane
Podjednostka kompleksu FACT SPT16 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SUPT16H .
Funkcjonować
Transkrypcję genów kodujących białka można odtworzyć na nagim DNA tylko przy użyciu ogólnych czynników transkrypcyjnych i polimerazy RNA II . Jednak ten minimalny system nie może transkrybować DNA zapakowanego w chromatynę , co wskazuje, że czynniki pomocnicze mogą ułatwiać dostęp do DNA. Jeden z takich czynników, FACT (ułatwia transkrypcję chromatyny), oddziałuje specyficznie z histonami H2A / H2B , wpływając na nukleosom demontaż i elongacja transkrypcji. FACT składa się z podjednostki 80 kDa i podjednostki 140 kDa, z których ta ostatnia jest białkiem kodowanym przez ten gen.
Interakcje
Wykazano, że SUPT16H oddziałuje z BAZ1B .
Dalsza lektura
LeRoy G, Orphanides G, Lane WS, Reinberg D (1998). „Wymaganie RSF i FACT do transkrypcji szablonów chromatyny in vitro”. nauka . 282 (5395): 1900–4. doi : 10.1126/science.282.5395.1900 . PMID 9836642 .
Orphanides G, Wu WH, Lane WS, Hampsey M, Reinberg D (1999). „Czynnik wydłużania transkrypcji specyficzny dla chromatyny FACT obejmuje ludzkie białka SPT16 i SSRP1”. Natura . 400 (6741): 284–8. Bibcode : 1999Natur.400..284O . doi : 10.1038/22350 . PMID 10421373 . S2CID 4300397 .
Kang SW, Kuzuhara T, Horikoshi M (2000). „Funkcjonalna interakcja ogólnego czynnika inicjacji transkrypcji TFIIE z ogólnym czynnikiem chromatyny SPT16 / CDC68” . Komórki genów . 5 (4): 251–63. doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00323.x PMID 10792464 .
Wada T, Orphanides G, Hasegawa J, Kim DK, Shima D, Yamaguchi Y, Fukuda A, Hisatake K, Oh S, Reinberg D, Handa H (2000). „FACT łagodzi hamowanie wydłużania transkrypcji za pośrednictwem DSIF / NELF i ujawnia funkcjonalne różnice między P-TEFb i TFIIH” . Mol. komórka . 5 (6): 1067–72. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80272-5 PMID 10912001 .
Keller DM, Lu H (2003). „Fosforylacja seryny 392 p53 wzrasta po UV poprzez indukcję składania kompleksu CK2.hSPT16.SSRP1” . J. Biol. chemia . 277 (51): 50206–13. doi : 10.1074/jbc.M209820200 PMID 12393879 .
Kitagawa H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D, Ogawa S, Unno K, Okubo M, Tokita A, Nakagawa T, Ito T, Ishimi Y, Nagasawa H, Matsumoto T, Yanagisawa J, Kato S (2003). „Kompleks przebudowy chromatyny WINAC kieruje receptor jądrowy do promotorów i jest upośledzony w zespole Williamsa” . komórka . 113 (7): 905–17. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00436-7 PMID 12837248 .
Belotserkovskaya R, Oh S, Bondarenko VA, Orphanides G, Studitsky VM, Reinberg D (2003). „FACT ułatwia zależną od transkrypcji zmianę nukleosomu”. nauka . 301 (5636): 1090–3. Bibcode : 2003Sci...301.1090B . doi : 10.1126/science.1085703 . PMID 12934006 . S2CID 26667338 .
Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Link AJ, Patton JG (2003). „Regulacja alternatywnego splicingu przez SRrp86 i jego białka oddziałujące” . Mol. Komórka. Biol . 23 (21): 7437–47. doi : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . PMC 207616 PMID 14559993 .
Tan BC, Lee SC (2004). „Nek9, nowe białko związane z FACT, moduluje progresję interfazy” . J. Biol. chemia . 279 (10): 9321–30. doi : 10.1074/jbc.M311477200 PMID 14660563 .
Frytownica CJ, Biały JB, Jones KA (2005). „Mastermind rekrutuje CycC: CDK8 do fosforylacji Notch ICD i koordynowania aktywacji z obrotem” . Mol. komórka . 16 (4): 509–20. doi : 10.1016/j.molcel.2004.10.014 PMID 15546612 .
Kouskouti A, Talianidis I (2005). „Modyfikacje histonów definiujące aktywne geny utrzymują się po inaktywacji transkrypcji i mitozy” . EMBO J. 24 (2): 347–57. doi : 10.1038/sj.emboj.7600516 . PMC 545808 PMID 15616580 .
Huang JY, Chen WH, Chang YL, Wang HT, Chuang WT, Lee SC (2006). „Modulacja aktywności wiążącej nukleosom FACT przez poli (ADP-rybozylację)” . Kwasy nukleinowe Res . 34 (8): 2398–407. doi : 10.1093/nar/gkl241 . PMC 1458519 PMID 16682447 .
Pavri R, Zhu B, Li G, Trojer P, Mandal S, Shilatifard A, Reinberg D (2006). „Funkcje monoubikwitynacji histonu H2B współpracują z FACT w celu regulacji wydłużania przez polimerazę RNA II” . komórka . 125 (4): 703–17. doi : 10.1016/j.cell.2006.04.029 PMID 16713563 .
Tan BC, Chien CT, Hirose S, Lee SC (2006). „Współpraca funkcjonalna między helikazą FACT i MCM ułatwia inicjację replikacji chromatyny DNA” . EMBO J. 25 (17): 3975–85. doi : 10.1038/sj.emboj.7601271 . PMC 1560368 PMID 16902406 .
Biswas D, Dutta-Biswas R, Mitra D, Shibata Y, Strahl BD, Formosa T, Stillman DJ (2006). „Przeciwstawne role Set2 i yFACT w regulacji wiązania TBP u promotorów” . EMBO J. 25 (19): 4479–89. doi : 10.1038/sj.emboj.7601333 . PMC 1589996 PMID 16977311 .
Linki zewnętrzne
Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : Q9Y5B9 PDBe-KB .
