Centrum PubMed

Centrum PubMed
Producent Narodowa Biblioteka Medyczna Stanów Zjednoczonych (Stany Zjednoczone)
Historia 2000 do chwili obecnej
Dostęp
Koszt Bezpłatny
Zasięg
Dyscypliny Medycyna
Rekordowa głębokość Indeks, streszczenie i pełny tekst
Pokrycie formatu artykuły prasowe
Spinki do mankietów
Strona internetowa www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/ _ _ _ _ _ _
Lista tytułów www .ncbi .nlm .nih .gov /pmc /journals /

PubMed Central ( PMC ) to bezpłatne cyfrowe repozytorium , które archiwizuje pełnotekstowe artykuły naukowe w otwartym dostępie , które zostały opublikowane w czasopismach biomedycznych i naukach przyrodniczych . Jako jedna z głównych baz danych badawczych opracowanych przez Narodowe Centrum Informacji Biotechnologicznej (NCBI), PubMed Central to coś więcej niż repozytorium dokumentów. Zgłoszenia do PMC są indeksowane i formatowane pod kątem rozszerzonych metadanych , ontologii medycznej i unikalnych identyfikatorów, które wzbogacają XML uporządkowane dane dla każdego artykułu. Treści w PMC można łączyć z innymi bazami danych NCBI i uzyskiwać do nich dostęp za pośrednictwem Entrez , jeszcze bardziej zwiększając zdolność społeczeństwa do odkrywania, czytania i budowania na jego wiedzy biomedycznej.

PubMed Central różni się od PubMed . PubMed Central to bezpłatne cyfrowe archiwum pełnych artykułów, dostępne dla każdego z dowolnego miejsca za pośrednictwem przeglądarki internetowej (z różnymi warunkami ponownego wykorzystania). Z drugiej strony, chociaż PubMed to przeszukiwalna baza danych cytatów i streszczeń biomedycznych, pełny tekst artykułu znajduje się gdzie indziej (w wersji drukowanej lub online, za darmo lub za płatną ścianą abonencką ) .

Według stanu na grudzień 2018 r. archiwum PMC zawierało ponad 5,2 miliona artykułów, przy czym wkład pochodził od wydawców lub autorów, którzy zdeponowali swoje rękopisy w repozytorium zgodnie z Polityką publicznego dostępu NIH . Wcześniejsze dane pokazują, że od stycznia 2013 do stycznia 2014 depozyty inicjowane przez autorów przekroczyły 103 000 artykułów w okresie 12 miesięcy. PMC identyfikuje około 4000 czasopism, które w pewnym stopniu uczestniczą w deponowaniu opublikowanych treści w repozytorium PMC. Niektórzy wydawcy opóźniają publikację swoich artykułów w PubMed Central na określony czas po publikacji, zwany „okresem embarga”, wynoszący od kilku miesięcy do kilku lat, w zależności od czasopisma. (Najczęstsze są embarga trwające od sześciu do dwunastu miesięcy). PubMed Central jest kluczowym przykładem „systematycznej dystrybucji zewnętrznej przez stronę trzecią”, która jest nadal zabroniona przez umowy wielu wydawców.

Przyjęcie

Uruchomione w lutym 2000 r. repozytorium szybko się rozrosło, ponieważ polityka publicznego dostępu NIH ma na celu umożliwienie każdemu bezpłatnego dostępu do wszystkich badań finansowanych przez National Institutes of Health (NIH), a ponadto wielu wydawców współpracuje z NIH zapewnienia swobodnego dostępu do swoich dzieł. Pod koniec 2007 roku ustawa o skonsolidowanych środkach finansowych z 2008 roku (HR 2764) została podpisana i zawierała przepis wymagający od NIH zmiany zasad i włączenia do PubMed Central pełnych elektronicznych kopii ich recenzowanych badań i wyników finansowanych przez NIH badania. Artykuły te muszą zostać uwzględnione w ciągu 12 miesięcy od publikacji. To pierwszy raz, kiedy rząd USA zażądał od agencji zapewnienia otwarty dostęp do badań i jest ewolucją polityki z 2005 r., w ramach której NIH poprosił badaczy o dobrowolne dodanie swoich badań do PubMed Central.

Brytyjska wersja systemu PubMed Central, UK PubMed Central (UKPMC) , została opracowana przez Wellcome Trust i British Library jako część dziewięcioosobowej grupy brytyjskich fundatorów badań. System ten został uruchomiony w styczniu 2007 r. 1 listopada 2012 r. zmienił nazwę na Europe PubMed Central . Kanadyjski członek sieci PubMed Central International, PubMed Central Canada , został uruchomiony w październiku 2009 roku.

Język znaczników artykułów w czasopismach National Library of Medicine „NLM Journal Publishing Tag Set” jest dostępny bezpłatnie. Association of Learned and Professional Society Publishers komentuje, że „prawdopodobnie stanie się to standardem przygotowywania treści naukowych zarówno do książek, jak i czasopism”. Powiązane DTD jest dostępne dla książek. Biblioteka Kongresu i Biblioteka Brytyjska ogłosiły wsparcie dla NLM DTD. Jest również popularny wśród dostawców usług dziennikarskich.

Wraz z wydaniem planów publicznego dostępu dla wielu agencji poza NIH, PMC jest w trakcie stawania się repozytorium dla szerszej gamy artykułów. Obejmuje to treści NASA, z interfejsem oznaczonym jako „PubSpace”.

Technologia

Artykuły są wysyłane do PubMed Central przez wydawców w formacie XML lub SGML , przy użyciu różnych DTD artykułów . Starsi i więksi wydawcy mogą mieć własne, wewnętrzne DTD, ale wielu wydawców korzysta z NLM Journal Publishing DTD (patrz wyżej).

Otrzymane artykuły są konwertowane przez XSLT do bardzo podobnego DTD NLM Archiving and Interchange. Ten proces może ujawnić błędy, które są zgłaszane wydawcy w celu poprawienia. Grafika jest również konwertowana do standardowych formatów i rozmiarów. Oryginalne i skonwertowane formularze są archiwizowane. Przekonwertowany formularz jest przenoszony do relacyjnej bazy danych wraz z powiązanymi plikami graficznymi, multimedialnymi lub innymi powiązanymi danymi. Wielu wydawców udostępnia również w formacie PDF , które są udostępniane bez zmian.

Cytaty bibliograficzne są analizowane i automatycznie łączone z odpowiednimi abstraktami w PubMed, artykułami w PubMed Central i zasobami na stronach internetowych wydawców. Linki PubMed prowadzą również do PubMed Central. Nierozwiązywalne odniesienia, takie jak czasopisma lub konkretne artykuły, które nie są jeszcze dostępne w jednym z tych źródeł, są śledzone w bazie danych i automatycznie „opublikowane”, gdy zasoby staną się dostępne.

Wewnętrzny system indeksowania umożliwia wyszukiwanie i uwzględnia terminologię biologiczną i medyczną , taką jak nazwy leków generycznych i zastrzeżonych oraz alternatywne nazwy organizmów, chorób i części anatomicznych.

Gdy użytkownik uzyskuje dostęp do numeru czasopisma, automatycznie generowany jest spis treści poprzez pobranie wszystkich artykułów, listów, artykułów redakcyjnych itp. dotyczących tego numeru. Po osiągnięciu rzeczywistego elementu, takiego jak artykuł, PubMed Central konwertuje znaczniki NLM na HTML w celu dostarczenia i udostępnia łącza do powiązanych obiektów danych. Jest to wykonalne, ponieważ różnorodne przychodzące dane zostały najpierw przekonwertowane na standardowe DTD i formaty graficzne.

W oddzielnym strumieniu przesyłania, autorzy finansowani przez NIH mogą umieszczać artykuły w PubMed Central za pomocą NIH Manuscript Submission (NIHMS). Artykuły przesłane w ten sposób zazwyczaj przechodzą przez znaczniki XML w celu przekonwertowania na NLM DTD.

Przyjęcie

Reakcje społeczności publikacji naukowych na PubMed Central wahają się od autentycznego entuzjazmu u niektórych do ostrożnego zaniepokojenia u innych.

Chociaż PMC jest mile widzianym partnerem dla wydawców z otwartym dostępem, jeśli chodzi o ich zdolność do zwiększania odkrywania i rozpowszechniania wiedzy biomedycznej, ta sama prawda powoduje, że inni martwią się przekierowaniem ruchu z opublikowanej wersji rekordu, ekonomicznymi konsekwencjami mniejszego czytelnictwa, a także jako wpływ na utrzymanie wspólnoty uczonych w towarzystwach naukowych. Analiza z 2013 roku wykazała mocne dowody na to, że publiczne repozytoria opublikowanych artykułów były odpowiedzialne za „odciąganie znacznej liczby czytelników od stron internetowych czasopism” oraz że „efekt PMC rośnie w czasie”.

Biblioteki, uniwersytety, zwolennicy otwartego dostępu, grupy broniące zdrowia konsumentów i organizacje praw pacjentów pochwaliły PubMed Central i mają nadzieję, że zobaczą podobne publiczne repozytoria opracowane przez inne federalne agencje finansujące, aby swobodnie udostępniać wszelkie publikacje badawcze, które były wynikiem wsparcia podatników .

Badanie Antelmana dotyczące publikowania w otwartym dostępie wykazało, że w filozofii, politologii, inżynierii elektrycznej i elektronicznej oraz matematyce artykuły w otwartym dostępie miały większy wpływ na badania. Randomizowana próba wykazała wzrost liczby pobrań treści artykułów w otwartym dostępie, bez przewagi cytowań nad dostępem w ramach subskrypcji rok po publikacji.

Polityka NIH i prace nad otwartym repozytorium zainspirowały prezydencką dyrektywę z 2013 r. , która wywołała działania również w innych agencjach federalnych.

W marcu 2020 r. PubMed Central przyspieszył procedury wpłat na pełne teksty publikacji o koronawirusie . NLM zrobił to na prośbę Biura Polityki Nauki i Technologii Białego Domu oraz międzynarodowych naukowców w celu poprawy dostępu dla naukowców, pracowników służby zdrowia, innowatorów eksploracji danych , naukowców zajmujących się sztuczną inteligencją opieki zdrowotnej i ogółu społeczeństwa.

PMCID

PMCID (identyfikator PubMed Central), znany również jako numer referencyjny PMC, jest identyfikatorem bibliograficznym ogólnodostępnej bazy danych PubMed Central, podobnie jak PMID jest identyfikatorem bibliograficznym bazy danych PubMed . Te dwa identyfikatory są jednak różne. Składa się z „PMC”, po którym następuje ciąg siedmiu cyfr. Format to:

  • PMCID: PMC1852221

Autorzy ubiegający się o nagrody NIH muszą zawrzeć PMCID we wniosku.

Zobacz też

Linki zewnętrzne


[[Kategoria:Archiwa w otwartym dostępie]]