Pseudomonas F116 holin

Pseudomonas F116 jest niescharakteryzowaną holiną homologiczną do tej z Neisseria gonorrhoeae , która została scharakteryzowana. Białko to jest prototypem Pseudomonas F116 holin (F116 Holin) ( TC# 1.E.25 ), która jest członkiem nadrodziny Holin II . Analiza bioinformatyczna sekwencji genomu N. gonorrhoeae ujawniła obecność dziewięciu prawdopodobnych wysp profagowych. Sekwencja genomowa FA1090 zidentyfikowała pięć regionów genomowych (NgoPhi1 - 5), które są spokrewnione z fagiem lizogennym dsDNA. Sekwencje DNA z NgoPhi1, NgoPhi2 i NgoPhi3 zawierały regiony identyczne. Region NgoPhi2 wykazywał duże podobieństwo do Pseudomonas aeruginosa F116. NgoPhi1 i NgoPhi2 kodują funkcjonalnie aktywne fagi. Gen holin NgoPhi1 (identyczny z tym kodowanym przez NgoPhi2), gdy jest wyrażany w E. coli , może zastąpić gen S faga lambda.

Zobacz też

• Holin
• Lizyna
• Baza danych klasyfikacji transporterów

Według stanu na dzień 10 marca 2016 r. ten artykuł pochodzi w całości lub w części z bazy danych klasyfikacji transporterów (TCDB) . Właściciel praw autorskich udzielił licencji na treść w sposób, który pozwala na ponowne wykorzystanie zgodnie z CC BY-SA 3.0 i GFDL . Należy przestrzegać wszystkich odpowiednich warunków. Oryginalny tekst znajdował się w „1.E.25 The Pseudomonas phage F116 Holin (F116 Holin) Family”