Nadrodzina Holin II
Nadrodzina Holin II to nadrodzina przypuszczalnych białek tworzących pory . Jest to w sumie jedna z siedmiu różnych nadrodzin holinów . Ogólnie uważa się, że białka te odgrywają rolę w regulowanej śmierci komórki , chociaż funkcjonalność różni się w zależności od rodziny i poszczególnych członków. Nadrodzina Holin II obejmuje rodziny TC:
- 1.E.1 - Rodzina P21 Holin S (P21 Holin).
- 1.E.6 - Rodzina T7 Holin (T7 Holin).
- 1.E.7 - Rodzina HP1 Holin (HP1 Holin).
- 1.E.25 - Rodzina fagów Pseudomonas F116 Holin (F116 Holin )
- 1.E.50 - Rodzina Beta-Proteobacterial Holin (BP-Hol).
Wszystkie cztery z tych rodzin pochodzą od Pseudomonadota i mają stosunkowo małe rozmiary, średnia wielkość białek w całej nadrodzinie wynosi 78 ± 14 reszt aminoacylowych (aas). Można znaleźć pewne wyjątki (tj. białko z rodziny Lysis S o 720 aminokwasach, TC# 1.E.1.1.7 ). Podobnie jak w nadrodzinie holin I , białka w tych rodzinach generalnie wykazują 2 klucze transbłonowe (TMS). Rodziny 1 i 6 w Superfamily II są uznanymi domenami w Conserved Domains Database (CDD) odpowiednio jako nadrodziny Lysis S i PHA00426, podczas gdy rodziny 7 i 25 nie mają uznanych konserwatywnych domen.
Zobacz też
