Rodzina BP Holin

Rodzina β-proteobakteryjnych holin (BP-Hol) ( TC# 1.E.50 ) jest małą rodziną, która obejmuje członków pochodzących z wielu fagów Burkholderia , jak również gatunku Poloromonas . Od 3 kwietnia 2016 roku rodzina ta należy do nadrodziny Holin II . Członkowie Saier Bioinformatics Lab na Uniwersytecie Kalifornijskim w San Diego odkryli, że rodzina BP-Hol jest najbliżej spokrewniona z rodziną holinów T7 ( TC# 1.E.6 ). Białka te mają długość od 60 do 110 reszt aminokwasowych (aas) i wykazują 1 lub 2 segmenty transbłonowe (TMS). Niektóre są opisane jako holliny typu II i mogą być spokrewnione z członkami rodziny T7 Holin ( TC# 1.E.6 ), chociaż białka BP-Hol pozostają funkcjonalnie niescharakteryzowane. Reprezentatywną listę białek należących do rodziny BP-Hol można znaleźć w Transporter Classification Database .

Zobacz też

• Holin
• Lizyna
• Baza danych klasyfikacji transporterów

Dalsza lektura

• "BcepMigl_gp72 - Holin - fag Burkholderia BcepMigl - gen i białko BcepMigl_gp72" . www.uniprot.org . Źródło 2016-03-29 .
•      Grundling, Angelika; Manson, Michael D.; Młody, Ry (31.07.2001). „Holinowie zabijają bez ostrzeżenia” . Proceedings of the National Academy of Sciences 98 (16): 9348–9352. doi : 10.1073/pnas.151247598 . ISSN 0027-8424 . PMC 55423 . PMID 11459934 .
•     Preston, Gail M.; Studholme, David J.; Caldelari, Isabelle (2005-04-01). „Profilowanie sekretomów proteobakterii patogennych dla roślin” . Recenzje mikrobiologii FEMS 29 (2): 331–360. doi : 10.1016/j.fmrre.2005.01.001 . ISSN 1574-6976 . PMID 15808747 .
•     Reddy, Bhaskara L.; Saier Jr., Milton H. (2013-11-01). „Analizy topologiczne i filogenetyczne rodzin i nadrodzin bakteryjnych holinów” . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes 1828 (11): 2654-2671. doi : 10.1016/j.bbamem.2013.07.004 . PMC 3788059 . PMID 23856191 .
•      Saier, Milton H.; Reddy, Bhaskara L. (2015-01-01). „Holiny u bakterii, eukariontów i archeonów: wielofunkcyjne ksenologie o potencjalnych zastosowaniach biotechnologicznych i biomedycznych” . Journal of Bacteriology 197 (1): 7–17. doi : 10.1128/JB.02046-14 . ISSN 0021-9193 . PMC 4288690 . PMID 25157079 .
•     Wang, IN; Smith, DL; Młody, R. (2000-01-01). „Holins: zegary białkowe infekcji bakteriofagowych” . Roczny przegląd mikrobiologii 54 : 799–825. doi : 10.1146/annurev.micro.54.1.799 . ISSN 0066-4227 . PMID 11018145 .

Od tej edycji ten artykuł wykorzystuje treść z „1.E.50. The β-Proteobacterial Holin (BP-Hol) Family” , która jest licencjonowana w sposób umożliwiający ponowne wykorzystanie na podstawie licencji Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , ale nie w ramach GFDL . Należy przestrzegać wszystkich odpowiednich warunków.