Genotyp multilocus

Genotyp multilocus to kombinacja alleli znajdujących się w dwóch lub więcej loci u jednego osobnika.

Na przykład w gatunku diploidalnym , jeśli istnieją dwa loci SNP , a pierwszy locus ma allele A i G, podczas gdy drugi locus ma allele T i C, genotyp multilocus można przedstawić jako {A/G, T/C} . Jeśli genom nie jest haploidalny, genotyp multilocus niekoniecznie determinuje, które allele współwystępują na chromosomach. W przykładzie, jeśli dwa loci znajdują się na tym samym chromosomie, możliwości są albo {AT,GC} albo {AC,GT}. Gdzie AT reprezentuje haplotyp z allelami A i T razem na jednym chromosomie i G i C razem na drugim. Jeśli haplotypy są określane, genotyp multilocus jest określany jako genotyp fazowany, w przeciwnym razie jest określany jako niefazowany. Niektórzy autorzy sugerują, że termin genotyp multilocus powinien być stosowany tylko do danych multilocus fazowanych, podczas gdy inni stosują go również do danych multilocus niefazowanych. Kombinacja alleli w dwóch lub więcej loci na pojedynczym chromosomie tworzy haplotyp, a dwa haplotypy u osobnika diploidalnego tworzą diplotyp (synonim fazowego genotypu multilocus).