Tymczasowy rejestr rodzajów morskich i innych niż morskie
 | |
| Skrót | IRMNG |
|---|---|
| Tworzenie | 2006 |
| Siedziba | Ostenda , Belgia |
Menadżer i kurator |
Tony'ego Reesa |
Główne organy |
Strona internetowa |
Organizacja macierzysta |
Organizacja Badań Naukowych i Przemysłowych Wspólnoty Narodów (2006-2014); Flanders Marine Institute (2016-obecnie) |
| Strona internetowa |
|
Interim Register of Marine and Nonmarine Genera ( IRMNG ) to taksonomiczna baza danych , która próbuje objąć opublikowane nazwy rodzajowe dla wszystkich dziedzin życia od 1758 r. , na rzecz Informatyki Bioróżnorodności inicjatyw oraz ogólnych użytkowników informacji o różnorodności biologicznej (taksonomicznych). Oprócz ponad 490 000 opublikowanych wystąpień nazw rodzajowych według stanu na marzec 2020 r. (W tym także nazw podrodzajowych w zoologii), baza danych zawiera ponad 1,7 miliona nazw gatunków (1,3 miliona wymienionych jako „zaakceptowane”), chociaż ten składnik danych nie jest utrzymywany w tak aktualnym lub kompletnym stanie, jak gospodarstwa na poziomie rodzaju. IRMNG można przeszukiwać online w celu uzyskania dostępu do najnowszej wersji zestawu danych, a także udostępniać jako okresowe migawki lub zrzuty danych do importu/przesyłania do innych systemów zgodnie z potrzebami.
Opis
IRMNG zawiera nazwy naukowe (tylko) rodzajów , podzbioru gatunków i głównych wyższych rang większości roślin, zwierząt i innych królestw , zarówno żyjących, jak i wymarłych, w ramach znormalizowanej hierarchii taksonomicznej, wraz z powiązanymi informacjami o siedliskach, które można odczytać maszynowo (np. morski /niemorski) oraz status zachowany / skamieniały dla większości wpisów. Baza danych ma na celu zapewnienie pełnego pokrycia zarówno akceptowanych, jak i nieakceptowanych nazw rodzajów we wszystkich królestwach, z podzbiorem tylko nazw gatunków uwzględnionych jako działalność drugorzędna. W wydaniu z marca 2020 r. IRMNG zawierało 492 620 nazw rodzajów, z których 232 093 zostało wymienionych jako „zaakceptowane”, 121 389 „niezaakceptowane”, 7 462 o statusie „inny”, tj. Tymczasowo nieopublikowane, nomen dubium , nomen nudum , takson inquirendum lub nazwa tymczasowa, a 131 676 jako „niepewne” (w tej chwili nieoceniony pod kątem statusu taksonomicznego). Dane pochodzą z różnych (często specyficznych dla domeny) źródeł drukowanych, internetowych i baz danych, w tym (między innymi) Nomenclator Zoologicus dla zwierząt i Index Nominum Genericorum dla roślin, i są przeorganizowane w wspólną strukturę danych , aby wspierać różnorodne kwerendy, generowanie stron poszczególnych taksonów i masowe dostarczanie danych do innych systemów informatycznych zajmujących się różnorodnością biologiczną projektowanie. Treści IRMNG można wyszukiwać i wyświetlać swobodnie przez Internet, a także pobierać pliki danych aż do rangi taksonomicznej rodzaju według stanu na określone daty, które są dostępne w formacie Darwin Core Archive (DwC-A). Dane obejmują homonimy (z ich autorytetami), w tym zarówno dostępne (ważnie opublikowane), jak i wybrane niedostępne.
Szacunki dotyczące „zaakceptowanych imion” według stanu na marzec 2020 r. Są następujące, w podziale na królestwa:
- Animalia : 239 093 zaakceptowanych nazw rodzajowych (± 55 350)
- Plantae : 28 724 zaakceptowanych nazw rodzajów (± 7721)
- Grzyby : 10 468 zaakceptowanych nazw rodzajowych (± 182)
- Chromista : 11114 zaakceptowanych nazw rodzajów (± 1268)
- Pierwotniaki : 3109 zaakceptowanych nazw rodzajowych (± 1206)
- Bakterie : 3433 zaakceptowanych nazw rodzajów (± 115)
- Archaea : 140 zaakceptowanych nazw rodzajowych (± 0)
- Wirusy : 851 zaakceptowanych nazw rodzajów (± 0)
Cytowane zakresy niepewności powstają, ponieważ IRMNG wymienia „niepewne” nazwy (nie zbadane w nich) oprócz znanych „akceptowanych” nazw; podane wartości to średnia samych nazw „zaakceptowanych” (wszystkie nazwy „niepewne” traktowane jako nieakceptowane) i nazw „zaakceptowanych + niepewnych” (wszystkie nazwy „niepewne” traktowane jako zaakceptowane), z powiązanym zakresem niepewności wskazującym te dwie skrajności .
Lokalizacja bazy danych i hosting
IRMNG został zainicjowany i zaprojektowany przez australijskiego biologa i menedżera danych Tony'ego Reesa w 2006 roku. Za pracę nad tym i innymi projektami GBIF przyznało mu nagrodę Ebbe Nielsen 2014 . Od 2006 do 2014 IRMNG znajdował się w CSIRO Marine and Atmospheric Research i został przeniesiony do Flanders Marine Institute (VLIZ) w latach 2014-2016; od 2016 roku wszystkie wydania są dostępne za pośrednictwem nowej strony internetowej www.irmng.org, której gospodarzem jest VLIZ. VLIZ obsługuje również Światowy Rejestr Gatunków Morskich (WoRMS), korzystając ze wspólnej infrastruktury.
Użycie IRMNG
Treści z IRMNG są wykorzystywane przez kilka globalnych projektów Biodiversity Informatics, w tym Open Tree of Life , Global Biodiversity Information Facility (GBIF) i Encyclopedia of Life (EOL), oprócz innych, w tym Atlas of Living Australia i Global Names Architecture (GNA)'s Global Names Resolver . Od 2018 r. dane IRMNG są również wykorzystywane do wypełniania hierarchii taksonomicznej i dostarczania nazw rodzajowych dla szeregu taksonów na obszarach protistów (królestwa Protozoa i Chromista ) i algi roślinne ( Charophyta , Chlorophyta , Glaucophyta i Rhodophyta ) w Katalogu Życia .
Dalsza lektura
- Rees, Tony (2008). „18.8. IRMNG - tymczasowy rejestr rodzajów morskich i innych niż morskie” (PDF) . Postępowanie TDWG . 2008 : 72–73.
- Rees, Tony; Vandepitte, Leen; Decock, Wim; Vanhoorne, Bart (2017). „IRMNG 2006–2016: 10 lat globalnej bazy taksonomicznej” . Informatyka o różnorodności biologicznej . 12 : 1–44. doi : 10.17161/bi.v12i0.6522 .
- Rees, Tony; Vandepitte, Leen; Vanhoorne, Bart; Decock, Wim (2020). „Wszystkie rodzaje świata: przegląd i szacunki na podstawie opublikowanego w marcu 2020 r. Tymczasowego rejestru rodzajów morskich i innych niż morskie (IRMNG)” . Megataksa . 1 (2): 123–140. doi : 10.11646/megataxa.1.2.3 .