Kluyveromyces lactis

Kluyveromyces lactis yeast cuture growing on a yeast powder-dextrose culture plate; plate-specific details redacted in black
Kluyveromyces lactis
Kultura drożdży Kluyveromyces lactis na płytce
Klasyfikacja naukowa
Królestwo:
Dział:
Klasa:
Zamówienie:
Rodzina:
Rodzaj:
Gatunek:
K. lactis
Nazwa dwumianowa
Kluyveromyces lactis

Kluyveromyces lactis to drożdże z rodzaju Kluyveromyces powszechnie stosowane w badaniach genetycznych i zastosowaniach przemysłowych. Swoją nazwę zawdzięcza zdolności przyswajania laktozy i przekształcania jej w kwas mlekowy .

Kluyveromyces lactis (dawniej Saccharomyces lactis ) to drożdże, które mają zdolność przyswajania laktozy i przekształcania jej w kwas mlekowy. K. lactis i inne organizmy tj. Aspergillus niger var awamori i Escherichia coli K-12 hoduje się w fermentorach do produkcji chymozyny ( podpuszczki ) na skalę przemysłową; ta podpuszczka, która zastępuje konwencjonalną formę otrzymywaną z rzeźnych zwierząt, jest obecnie szeroko stosowana w produkcji serów.

Drożdże i grzyby są idealnymi organizmami do porównawczych badań genomicznych u eukariontów ze względu na ich małe i zwarte genomy oraz fakt, że obejmują szereg gatunków, takich jak Neurospora crassa , Saccharomyces cerevisiae i Schizosaccharomyces pombe , które były i nadal są szeroko stosowane w badaniach genetycznych. Jednak rozbieżność między tymi trzema gatunkami jest starożytna (szacuje się, że ma co najmniej 300 milionów lat), a organizacja ich genomów jest zupełnie inna. Różnorodność hemiascomycetes, grupy ascomycetes, która zawiera większość znanych gatunków drożdży, została po raz pierwszy zbadana w 2000 roku.

Przeprowadzono pełne sekwencjonowanie i porównanie czterech drożdży hemiascomycetous dla Candida glabrata , Kluyveromyces lactis , Debaryomyces hansenii i Yarrowia lipolytica . Wybrano je na podstawie ich pozycji filogenetycznej i szczególnego zainteresowania jako ludzkich patogenów lub drożdży ważnych dla przemysłu lub środowiska. Ta praca, która reprezentuje pierwszą wielogatunkową eksplorację ewolucji genomu w całym typie eukariotycznym, ujawnia różnorodność zdarzeń i mechanizmów, które miały miejsce, i powinna pozwolić na użyteczne porównania z innymi typami organizmów wielokomórkowych, gdy określi się więcej sekwencji genomu.

K. lactis jest gatunkiem heterotalicznym z cyklem głównie haplontycznym, w przeciwieństwie do S. cerevisia e, w którym cykl głównie diplobiontyczny jest pseudoheterotaliczny z powodu przełączania typu kojarzenia.

Analiza genomiczna

W latach 90. naukowcy znali i analizowali niewiele genów, dopóki zespół z Instytutu Pasteura w Paryżu nie przeprowadził pierwszej analizy genomicznej. Genom Kluyveromyces lactis zbadano przez sekwencjonowanie 588 krótkich znaczników z dwóch losowych bibliotek genomowych (znaczniki losowo sekwencjonowane lub RST) . Zidentyfikowano 296 genów K. lactis , z których 292 były nowe.

Cały genom K. lactis zsekwencjonowano w 2004 roku.

Gatunek ten ma około 5300 genów rozmieszczonych na sześciu chromosomach jądrowych i genomie mitochondrialnym. Sześć chromosomów jest oznaczonych jako AF.