LSID

Identyfikatory Life Science to sposób nazywania i lokalizowania fragmentów informacji w sieci. Zasadniczo LSID jest unikalnym identyfikatorem niektórych danych, a protokół LSID określa standardowy sposób lokalizowania danych (a także standardowy sposób opisywania tych danych). Są trochę jak DOI używane przez wielu wydawców.

Identyfikator LSID jest reprezentowany jako jednolita nazwa zasobu (URN) w następującym formacie:

  • urn:lsid :<Urząd>:<Przestrzeń nazw>:<Identyfikator obiektu>[:<Wersja>]

nazw lsid: nie jest jednak zarejestrowana przez Internet Assigned Numbers Authority (IANA), więc nie są to ściśle URN ani URI.

Identyfikatory LSID można rozwiązać w adresach URL, np. http://zoobank.org/urn:lsid:zoobank.org:pub:CDC8D258-8F57-41DC-B560-247E17D3DC8C

Kontrowersje wokół używania LSID

Odnotowano duże zainteresowanie LSID zarówno w społecznościach bioinformatycznych , jak i zajmujących się różnorodnością biologiczną , przy czym te ostatnie nadal wykorzystują je jako sposób identyfikacji gatunków w globalnych katalogach. Jednak ostatnio, gdy wzrosło zrozumienie, w jaki sposób identyfikatory URI HTTP może wykonać podobne zadanie nazewnictwa, użycie identyfikatorów LSID jako identyfikatorów zostało skrytykowane jako naruszenie dobrej praktyki architektury sieciowej polegającej na ponownym wykorzystaniu istniejących schematów URI. Niemniej jednak wyraźne oddzielenie danych od metadanych; określenie metody wykrywania wielu lokalizacji w celu odzyskania danych; oraz możliwość wykrycia wielu niezależnych źródeł metadanych dla dowolnej zidentyfikowanej rzeczy były kluczowymi częściami LSID i jego specyfikacji rozdzielczości, które nie zostały pomyślnie naśladowane przez podejście oparte wyłącznie na HTTP.

World Wide Web zapewnia globalnie rozproszoną platformę komunikacji, która jest niezbędna dla prawie każdej współpracy naukowej, w tym bioinformatyki. Uważano jednak, że istnieje kilka ograniczeń i niedociągnięć, z których jednym była niemożność programowej identyfikacji obiektów nazwanych lokalnie, które mogą być szeroko rozpowszechnione w sieci. Ta postrzegana wada ograniczyłaby naszą zdolność do integracji wielu baz wiedzy, z których każda zawiera częściowe informacje o wspólnej domenie, jak to powszechnie widać w bioinformatyce. Life Science Identifier (LSID) i LSID Resolution System (LSRS) zostały zaprojektowane w celu zapewnienia prostych i eleganckich rozwiązań tego problemu, zgodnych z następną generacją Sieć semantyczna i siatka semantyczna , oparte na rozszerzeniu istniejących technologii internetowych. Jednak ostatnio zwrócono uwagę, że niektóre z tych dostrzeganych niedociągnięć nie są nieodłącznie związane z identyfikatorami URI HTTP, a wiele (choć nie wszystkie) funkcji zapewnianych przez identyfikatory LSID można uzyskać za pomocą odpowiednio spreparowanych identyfikatorów URI HTTP.

Alternatywne identyfikatory organizmów

Dla organizmów zaproponowano alternatywne identyfikatory, np. system DOI . NamesforLife (N4L), prywatna firma, stworzyła system nadawania DOI organizmom. Na przykład doi:10.1601/nm.3093 to DOI dla Escherichia coli , a doi:10.1601/tx.3093 to odpowiedni takson.

Zobacz też

Notatki

Linki zewnętrzne

Pobrano z „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=LSID&oldid=1136110079 ”