Laboratorium PSF

Laboratorium PSF
Deweloperzy Michael J. Nasse, Jörg C. Woehl
Wersja stabilna
3.0 / 24 września 2010 ; 12 lat temu ( 24.09.2010 )
System operacyjny Windowsa , macOS
Typ Oprogramowanie do symulacji komputerowych
Licencja Freeware do użytku akademickiego i niekomercyjnego
Strona internetowa jedna cząsteczka .chem .uwm .edu /software

PSF Lab to oprogramowanie, które umożliwia obliczenie funkcji rozproszenia punktu oświetlenia (PSF) mikroskopu konfokalnego w różnych warunkach obrazowania. Obliczenia wektorów pola elektrycznego opierają się na rygorystycznym modelu wektorowym, który uwzględnia polaryzacji w obszarze bliskiego ogniska i obiektywy mikroskopu o dużej aperturze numerycznej .

Polaryzację wiązki wejściowej (zakładanej jako skolimowana i monochromatyczna ) można wybrać dowolnie (liniową, kołową lub eliptyczną). Ponadto można założyć stały profil natężenia wiązki wejściowej lub o kształcie gaussowskim . W drodze od obiektywu do ogniska światło oświetlające przechodzi przez maksymalnie trzy uwarstwione warstwy optyczne, co umożliwia symulację olejku immersyjnego /powietrze (warstwa 1) obiektyw, który skupia światło przez szklane szkiełko nakrywkowe (warstwa 2) w ośrodku próbki (warstwa 3). Każda warstwa charakteryzuje się (stałym) współczynnikiem załamania światła i grubością. PSF Lab może również symulować obiektywy mikroskopu , które są korygowane pod kątem określonych współczynników załamania światła i grubości szkiełek nakrywkowych (parametry projektowe). W ten sposób wszelkie odchylenia od idealnych warunków obrazowania, dla których obiektyw został zaprojektowany, są odpowiednio brane pod uwagę.

Można wybrać następujące parametry optyczne:

  • Wiązka wejściowa
    • Długość fali
    • Parametr wypełnienia profilu gaussowskiego (0 = stały profil)
    • Polaryzacja (liniowa, kołowa, eliptyczna)
  • Wyjścia
    • Poszczególne elementy pola
    • Kwadratowe komponenty pola
    • Intensywność
  • Obiektyw mikroskopu
    • Apertura numeryczna
  • Nośniki optyczne
    • Współczynnik załamania światła (projektowy i rzeczywisty)
    • Grubość (projektowa i rzeczywista)
    • Głębia (położenie ostrości w średnim zakresie 3)

Program oblicza tylko przekrój PSF 2D, ale można nałożyć kilka obliczeń (za pomocą programu innej firmy), aby uzyskać pełny PSF 3D. Obliczenia są zorganizowane w „zestawy”, z których każdy ma własny zestaw parametrów. Pętle można skonfigurować w taki sposób, że PSF Lab oblicza jeden lub kilka zestawów, zwiększając rozdzielczość obliczonych obrazów w każdej nowej iteracji. Powstały obraz jest wyświetlany w PSF Lab w postaci liniowej lub logarytmicznej skala kolorów z wybieraną przez użytkownika mapą kolorów, a intensywność, poszczególne składowe pola lub kwadratowe rozkłady składowych pola można eksportować do różnych formatów (formaty danych: .mat, .h5 (HDF5), .txt (ASCII); formaty obrazów: .fig, .ai, .bmp, .emf, .eps, .jpg, .pcx, .pdf, .png, .tif).

Zobacz też

Linki zewnętrzne


Pobrano z „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=PSF_Lab&oldid=1132461735 ”