Liaza fumaranowa

Identyfikatory
liazy
Symbol	Liaza_1
Pfam	PF00206
InterPro	IPR000362
PROZYTA	PDOC00147
SCOP2	1jsw / ZAKRES / SUPFAM
CDD	cd01362
Dostępne struktury białek: Pfam   konstrukcje / ECOD   WPB RCSB WPB ; PDBe ; WPBj Suma WPB podsumowanie struktury WPB O:13-309 O:8-300 O:90-301 B:88-286 B:3-286 A:3-286 B:6-301 B:11-305 B:20-305 A:11-305 B:11-305 A:11-305 A:11-305 B:11-305 A:13-307 B:13-307 A:13-307 B:13-307 A:13-307 A:19-307 A:13-345 B:13-342 :36-367 B :12-342 A:12-342 A:12-342 B:12-342 A:12-342 B:12-342 B:12-342 B:11-342

Liaza fumaranowa jest substratem enzymów klasy liazy .

Wykazano, że ma wspólną krótką konserwatywną sekwencję wokół metioniny , która prawdopodobnie bierze udział w aktywności katalitycznej tego typu enzymów. Oto przykłady członków tej rodziny:

• Enzym laktonizujący 3-karboksymukonian, EC 5.5.1.2 (3-karboksy-cis,cis-mukonian cykloizomerazy), enzym biorący udział w katabolizmie kwasów aromatycznych.
• Delta-krystaliczna ma około 90% identyczności sekwencji z liazą arginobursztynianową, co pokazuje, że jest to przykład „porwanego” enzymu - nagromadzone mutacje sprawiły jednak, że białko stało się nieaktywne enzymatycznie.
• Enzym fumarazy klasy I , EC 4.2.1.2 ( hydrataza fumaranowa ), który katalizuje odwracalną hydratację fumaranu do L-jabłczanu. Enzymy klasy I to termolabilne enzymy dimeryczne (jak na przykład: Escherichia coli fumA i fumB).
• Argininobursztynaza, EC 4.3.2.1 ( liaza argininobursztynianowa ), która katalizuje powstawanie argininy i fumaranu z argininobursztynianu, ostatniego etapu biosyntezy argininy.
• Amoniak liaza asparaginianowa, EC 4.3.1.1 ( aspartaza ), która katalizuje odwracalną konwersję asparaginianu do fumaranu i amoniaku. Ta reakcja jest analogiczna do tej katalizowanej przez fumarazę, z wyjątkiem tego, że w reakcji trans-eliminacji bierze udział amoniak, a nie woda.
• Enzym Fumaraza klasy II, EC 4.2.1.2 , są termostabilne i tetrameryczne i występują u prokariontów (jak na przykład: Escherichia coli fumC), jak również u eukariontów. Sekwencja dwóch klas fumaraz nie jest ściśle powiązana.
• Adenylosukcynaza, EC 4.3.2.2 ( liaza adenylobursztynianowa ), która katalizuje ósmy etap biosyntezy de novo puryn, tworzenie 5'-fosforybozylo-5-amino-4-imidazolokarboksyamidu i fumaranu z 1-(5-fosforybozylo)- 4-(N-sukcyno-karboksyamid). Enzym ten może również katalizować powstawanie fumaranu i AMP z adenylobursztynianu .

Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR000362