Mały RNA specyficzny dla ciała Cajala 17
| mały Cajal RNA specyficzny dla ciała 17 | |
|---|---|
 Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji SCARNA17
| |
| identyfikatorów | |
| Symbol | SKARNA17 |
| Alt. Symbolika | snoU12-22 |
| Rfam | RF00492 |
| Inne dane | |
| typ RNA | gen ; snRNA ; snoRNA ; skaRNA |
| Domeny | Eukariota |
| IŚĆ | GO:0006396 GO:0015030 GO:0005730 |
| WIĘC | SO: 0000275 |
| Struktury PDB | PDBe |
Mały RNA Cajala specyficzny dla ciała 17 ( znany również jako U12-22 scaRNA ) to rodzaj małego jądrowego RNA , który lokalizuje się w ciałach cajala i ma kierować modyfikacją spliceosomalnych RNA U1 , U2 , U4 , U5 i U12 .
Kompletny ludzki scaRNA U12-22/U4-8 składa się z dwóch tandemowych domen C/D box (określanych jako U12-22 i U4-8). Przewiduje się, że domeny 5' i 3' C/D będą kierować metylacją 2'O-rybozy odpowiednio reszty U22 w U12 i reszty C8 w snRNA U4. Ta rodzina obejmuje tylko domenę 5' C/D box (U12-22), ponieważ 3' C/D box jest reprezentowany przez RNA 18 specyficzne dla ciałek Małego Cajala . Domena 3' C/D (U4-8) również została wcześniej sklonowana przez Darzacqa i nazwana U91. Zarówno formy dubletowe (U12-22/U4-8), jak i singletowe (U4-8) tego snRNA zostały oczyszczone z komórek HeLa . Wykazano, że forma dubletu U12-22/U4-8 lokalizuje się w nukleoplazmie i sugeruje się, że przebywa w ciałach Cajala, podczas gdy pojedyncza domena U4-8 wydaje się gromadzić w jąderku . U ludzi lokalizacja genomowa U12-88/U4-8 jest międzygenowa i wykazano, że oczyszczony transkrypt posiada czapeczkę z metylowanej guanozyny, co sugeruje, że jest niezależnie transkrybowany przez polimerazę RNA II.