Mały RNA specyficzny dla ciała Cajala

RNA specyficzny dla ciałek małego Cajala 1
RNA specyficzny dla ciałek małego Cajala 1
	Przewidywana struktura drugorzędowa RNA specyficzny dla ciałek małego Cajala 1
Identyfikatory
Symbol	SKARNA1
Rfam	RF00553
Inne dane
typ RNA	gen , snRNA , snoRNA , skaRNA;
Domeny	Kręgowce
Struktury PDB	PDBe

Małe RNA specyficzne dla ciała Cajala ( scaRNA ) to klasa małych jąderkowych RNA ( snoRNA ), które specyficznie lokalizują się w ciele Cajala , organelli jądrowej (suborganelli komórkowych) zaangażowanej w biogenezę małych jądrowych rybonukleoprotein (snRNP lub snurps). ScaRNA kierują modyfikacją ( metylacją i pseudourydylacją ) spliceosomalnych RNA U1 , U2 , U4 transkrybowanych przez polimerazę RNA II , U5 i U12 .

Pierwszym zidentyfikowanym scaRNA był U85. Różni się od typowych snoRNA tym, że jest złożonym snoRNA typu C/D box i H/ACA box i może kierować zarówno pseudourydylacją, jak i 2′- O -metylacją. Nie wszystkie scaRNA są złożonymi snoRNA C / D i H / ACA, a większość scaRNA jest strukturalnie i funkcjonalnie nie do odróżnienia od snoRNA, kierując rybosomalnego RNA (rRNA) w jąderku .

Drosophila scaRNA

W kilku badaniach zidentyfikowano scaRNA u Drosophila . Jedno z badań wykazało, że kilka scaRNA Drosophila może równie dobrze funkcjonować w nukleoplazmie mutantów pozbawionych ciał Cajala. Dalsze badania wykazały, że scaRNA pugU6-40 celuje w U6 snRNA, którego modyfikacja zachodzi w jąderku, a nie w CB, oraz że pugU1-6 i pug U2-55 kierują 2 RNA: snRNA i 28s rRNA.

Mały RNA Cajala specyficzny dla ciała 1

W biologii molekularnej RNA 1 specyficzny dla ciała małego Cajala (znany również jako SCARNA1 lub ACA35) jest małym jąderkowym RNA występującym w ciałach Cajala i uważanym za zaangażowany w pseudourydylację spliceosomalnego RNA U2 w reszcie U89.

scaRNA1 to niekodujące RNA , które są funkcjonalnymi produktami genów nie podlegających translacji na białka . Takie cząsteczki RNA zwykle zawierają ważną strukturę drugorzędową lub motywy wiążące ligand i biorą udział w wielu ważnych procesach biologicznych w komórce.

scaRNA1 należy do klasy snoRNA box H / ACA , ponieważ ma przewidywaną strukturę spinki do włosów-zawias-szpilka do włosów, zachowane motywy H / ACA-box i jest związany z białkiem GAR1 .

Linki zewnętrzne