Klub piłkarski Malabar United został założony w 2007 roku przez Mohammeda Mannila. Zaczęli swoją historię grając w lokalnym Cochin Premier League. Skończyli w półfinale w 2008 Cochin Premier League. 2009 roku po raz pierwszy wystąpili w I-lidze 2. lidze , ale nie awansowali. Następnie próbowali ponownie w 2010 i 2011 roku, ale ostatecznie nie udało im się awansować do I-ligi . Następnie klub wypadł z następnego sezonu w 2012 I-League 2. Dywizji .
