Metoda GF

Metoda GF , czasami nazywana metodą FG , jest klasyczną metodą mechaniczną wprowadzoną przez Edgara Brighta Wilsona w celu uzyskania pewnych współrzędnych wewnętrznych dla drgającej półsztywnej cząsteczki, tzw. współrzędnych normalnych Q k . Normalne współrzędne oddzielają klasyczne ruchy wibracyjne cząsteczki, a tym samym dają łatwą drogę do uzyskania amplitudy wibracyjnej atomów w funkcji czasu. W metodzie GF Wilsona przyjmuje się, że energia kinetyczna cząsteczki składa się wyłącznie z drgań harmonicznych atomów, czyli całkowita energia rotacyjna i translacyjna jest pomijana. Współrzędne normalne pojawiają się również w kwantowo-mechanicznym opisie ruchów wibracyjnych cząsteczki oraz w sprzężeniu Coriolisa między obrotami a drganiami.

warunków Eckarta wynika , że ​​macierz G −1 podaje energię kinetyczną w postaci dowolnych liniowych współrzędnych wewnętrznych, podczas gdy F reprezentuje (harmoniczną) energię potencjalną w postaci tych współrzędnych. Metoda GF daje transformację liniową z ogólnych współrzędnych wewnętrznych do specjalnego zestawu współrzędnych normalnych.

Metoda GF

Nieliniowa cząsteczka złożona z N atomów ma 3 N − 6 wewnętrznych stopni swobody , ponieważ pozycjonowanie cząsteczki w przestrzeni trójwymiarowej wymaga trzech stopni swobody, a opis jej orientacji w przestrzeni wymaga kolejnych trzech stopni swobody. Te stopnie swobody należy odjąć od 3 N stopni swobody układu N cząstek.

Oddziaływanie między atomami w cząsteczce jest opisane przez powierzchnię energii potencjalnej (PES), która jest funkcją 3 N − 6 współrzędnych. Wewnętrzne stopnie swobody s 1 , ..., s 3 N −6 opisujące PES w sposób optymalny są często nieliniowe; są to na przykład współrzędne walencyjne , takie jak kąty zginania i skręcania oraz rozciągnięcia wiązań. Dla takich współrzędnych krzywoliniowych można napisać kwantowo-mechaniczny operator energii kinetycznej , ale trudno jest sformułować ogólną teorię mającą zastosowanie do dowolnej cząsteczki. Dlatego Wilson zlinearyzował wewnętrzne współrzędne, zakładając małe przemieszczenia. Zlinearyzowana wersja współrzędnej wewnętrznej s t jest oznaczona przez S t .

PES V można rozszerzyć według Taylora wokół jego minimum pod względem St t . Trzeci wyraz ( hesjan z V ) oceniany w minimum jest macierzą pochodną siły F . W przybliżeniu harmonicznym szereg Taylora kończy się po tym wyrazie. Drugi wyraz, zawierający pierwsze pochodne, wynosi zero, ponieważ jest oceniany w minimum V . Pierwszy wyraz można zawrzeć w zerowej energii. Zatem,

Klasyczna energia kinetyczna drgań ma postać:

0 gdzie g st jest elementem tensora metrycznego współrzędnych wewnętrznych (krzywoliniowych). Kropki oznaczają pochodne czasu . Terminy mieszane nie występują tutaj, ponieważ stosowane są tylko liniowe Ocena tensora metrycznego g w minimum s V daje dodatnio określoną i symetryczną macierz G = g ( 0 s ) −1 . Można rozwiązać dwa problemy macierzowe

jednocześnie, ponieważ są one równoważne z uogólnionym problemem wartości własnej

gdzie gdzie fa ja jest równe ( jest częstotliwością trybu normalnego i ); to macierz jednostkowa. Macierz L −1 zawiera w swoich wierszach współrzędne normalne Q k :

Ze względu na postać uogólnionego problemu wartości własnej metoda ta nazywana jest metodą GF, często z dołączonym nazwiskiem jej twórcy: metoda GF Wilsona . Poprzez transpozycję macierzy po obu stronach równania i wykorzystując fakt, że zarówno G , jak i F są macierzami symetrycznymi, podobnie jak macierze diagonalne, można przekształcić to równanie na bardzo podobne dla FG . Z tego powodu metoda ta jest również nazywana metodą FG Wilsona .

Wprowadzamy wektory

które spełniają zależność

Wykorzystując wyniki uogólnionego równania wartości własnej, energia E = T + V (w przybliżeniu harmonicznym) cząsteczki wynosi:

Lagrange'a L = T - V jest

Odpowiednie równania Lagrange'a są identyczne z równaniami Newtona

dla zestawu niesprzężonych oscylatorów harmonicznych. Te zwykłe równania różniczkowe drugiego rzędu można łatwo rozwiązać, otrzymując Q t jako funkcję czasu; zobacz artykuł o oscylatorach harmonicznych .

Współrzędne normalne pod względem współrzędnych przemieszczenia kartezjańskiego

0 Często współrzędne normalne są wyrażane jako liniowe kombinacje współrzędnych przemieszczenia kartezjańskiego. Niech R A będzie wektorem położenia jądra A, a R A odpowiednim położeniem równowagi. Wtedy definicji kartezjańska współrzędna przemieszczenia jądra A. linearyzacja Wilsona wewnętrznych współrzędnych krzywoliniowych q t wyraża współrzędną S t pod względem współrzędnych przemieszczenia

gdzie s A t jest znane jako wektor s Wilsona . Jeśli wstawimy macierz (3 N - 6) × 3 N macierzy B , to równanie stanie się w języku macierzowym s ZA ja t {\

Rzeczywista postać elementów macierzy B może być dość skomplikowana. Zwłaszcza w przypadku kąta skręcenia atomy, wyprowadzenie odpowiednich wartości wymaga żmudnej algebry . Więcej szczegółów na temat tej metody, znanej jako metoda Wilsona s-vector , można znaleźć w książce Wilsona i in. lub wibracje molekularne . Teraz,

które można odwrócić i umieścić w języku sumowania:

Tutaj D jest macierzą (3 N - 6) × 3 N , która jest dana przez (i) linearyzację współrzędnych wewnętrznych s (proces algebraiczny) oraz (ii) rozwiązanie równań GF Wilsona (proces numeryczny).


Macierze biorące udział w analizie

Istnieje kilka powiązanych układów współrzędnych powszechnie stosowanych w analizie macierzy GF. Wielkości te są powiązane różnymi macierzami. Dla jasności podajemy tutaj układy współrzędnych i ich wzajemne relacje.

Odpowiednie współrzędne to:

  • Współrzędne kartezjańskie dla każdego atomu
  • Współrzędne wewnętrzne dla każdego atomu
  • Współrzędne kartezjańskie ważone masą
  • Normalne współrzędne

Te różne układy współrzędnych są ze sobą powiązane przez:

  • . macierz przekształca współrzędne kartezjańskie na (linearyzowane) współrzędne wewnętrzne.
  • czyli macierz mas przekształca współrzędne kartezjańskie na współrzędne kartezjańskie ważone masą.
  • normalne współrzędne na współrzędne wewnętrzne ważone masą.
  • przekształca normalne współrzędne na współrzędne wewnętrzne.

Zwróć uwagę na przydatną zależność:

Macierze te pozwalają skonstruować macierz G w prosty sposób

Związek z warunkami Eckarta

Z niezmienniczości współrzędnych wewnętrznych S t przy całkowitym obrocie i translacji cząsteczki wynika to samo dla współrzędnych linearyzowanych s t A . Można wykazać, że implikuje to, że współrzędne wewnętrzne spełniają następujące 6 warunków:

Warunki te wynikają z warunków Eckarta, które obowiązują dla wektorów przemieszczenia,

Dalsze referencje