Mikrodysekcja chromosomów
Mikrodysekcja chromosomów to technika polegająca na fizycznym usunięciu dużej części DNA z całego chromosomu . Najmniejsza część DNA, którą można wyizolować tą metodą, to 10 milionów par zasad - setki lub tysiące pojedynczych genów .
Naukowcy badający chromosomy są znani jako cytogenetycy . Są w stanie zidentyfikować każdy chromosom na podstawie jego unikalnego wzoru ciemnych i jasnych pasm. Jednak pewne nieprawidłowości powodują, że chromosomy mają niezwykłe wzory prążków. Na przykład jeden chromosom może mieć wstawiony fragment innego chromosomu, tworząc dodatkowe prążki. Lub część chromosomu może być powtarzana w kółko, co skutkuje niezwykle szerokim, ciemnym pasmem (znanym jako jednorodnie wybarwiający się region ). Niektóre aberracje chromosomalne zostały powiązane z rakiem i dziedzicznymi zaburzeniami genetycznymi, a chromosomy wielu komórek nowotworowych wykazują nieregularne prążki. Aby lepiej zrozumieć, co powoduje te stany, naukowcy mają nadzieję ustalić, które geny i sekwencje DNA znajdują się w pobliżu tych niezwykłych prążków. Mikrodysekcja chromosomów to wyspecjalizowany sposób izolowania tych regionów poprzez usunięcie DNA z prążka i udostępnienie tego DNA do dalszych badań.
Aby przygotować komórki do mikrodysekcji chromosomów, naukowiec najpierw traktuje je substancją chemiczną, która zmusza je do przejścia w metafazę : fazę cyklu życiowego komórki, w której chromosomy są ciasno zwinięte i dobrze widoczne. Następnie komórki są upuszczane na szkiełko mikroskopowe , tak aby jądro, które utrzymuje razem cały materiał genetyczny, rozpadło się i uwolniło chromosomy na szkiełko. Następnie pod mikroskopem naukowiec lokalizuje interesujące nas pasmo i za pomocą bardzo cienkiej igły odrywa je od reszty chromosomu. Następnie badacz wytwarza wiele kopii wyizolowanego DNA, stosując procedurę zwaną PCR ( reakcja łańcuchowa polimerazy ). Naukowiec wykorzystuje te kopie do badania DNA z niezwykłego regionu omawianego chromosomu.
- Scalenghe F, Turco E, Edstrom JE, Pirrotta V, Melli M.: Mikrodysekcja i klonowanie DNA z określonego regionu chromosomów polietylenowych Drosophila melanogaster. chromosom. 1981;82(2):205-16.