Motyw RNA ManA
| ManA RNA | |
|---|---|
 Konsensus drugorzędowej struktury manA RNA
| |
| Identyfikatory | |
| Symbol | RNA manA |
| Rfam | RF01745 |
| Inne dane | |
| typ RNA | Cis -element regulujący |
| Domeny | Fotobakterie |
| Struktury PDB | PDBe |
Motyw RNA manA (zwany także manA ) odnosi się do konserwatywnej struktury RNA , która została zidentyfikowana przez bioinformatykę . Instancje manA wykryto w bakteriach z rodzaju Photobacterium oraz fagach infekujących niektóre rodzaje sinic . Jednak większość przewidywanych manA pochodzi z DNA pobranego z nieuprawianych bakterii morskich . Prawie wszystko manA są umieszczone w taki sposób, że mogą znajdować się w nieulegających translacji regionach 5' genów kodujących białka , dlatego postawiono hipotezę, że RNA manA działają jako elementy cis-regulatorowe . Biorąc pod uwagę względną złożoność ich struktury drugorzędowej i ich hipotetyczną rolę regulatorową cis , mogą to być przełączniki rybne .
Uważa się, że geny regulowane przez RNA manA to najczęściej geny zaangażowane w metabolizm cukrów fruktozy i mannozy , syntezę nukleotydów , fotosyntezę bakteryjną i klasę białek opiekuńczych znanych jako ibpA . ManA RNA są również często sąsiadujące z transferowymi RNA i prawdopodobnie są z nimi transkrybowane. Chociaż tych genów nie uważa się za typowe dla fagów, wcześniej zaobserwowano, że fagi infekujące cyjanobakterie zwykle zawierają takie geny.