Motyw pan RNA
| motyw pan RNA | |
|---|---|
 Konsensusowa struktura drugorzędowa pan RNA
| |
| Identyfikatory | |
| Symbol | patelnia |
| Rfam | RF01749 |
| Inne dane | |
| typ RNA | Cis -element regulujący |
| Domeny | Chloroflexota , Bacillota , Pseudomonadota |
| Struktury PDB | PDBe |
Motyw pan RNA określa konserwatywną strukturę RNA , którą zidentyfikowano za pomocą bioinformatyki . RNA motywu pan są obecne w trzech typach : Chloroflexota , Bacillota i Pseudomonadota , chociaż w ramach tego ostatniego typu są one znane tylko w deltaproteobacteria . Pan RNA jest obecny w Firmicute Bacillus subtilis , jednej z najlepiej przebadanych bakterii .
pan RNA są zlokalizowane w nieulegających translacji regionach 5' genów kodujących enzymy biorące udział w syntezie pantotenianu witaminy . W ten sposób zaproponowano, że pan RNA reprezentuje element cis-regulatorowy działający na poziomie RNA w celu regulacji syntezy pantotenianu. Podstawową cechą strukturalną pan RNA jest to, że mają jedną lub dwie pętle macierzyste , które mają dwie wypukłe adenozyny . Ich stosunkowo prosta budowa i brak licznych konserwatywnych nukleotydów jest mniej typowy dla ryboprzełącznika i proponowano wiązać je z białkiem .
Linki zewnętrzne