NSP3 (rotawirus)
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NSP3 (rotawirusa). | |||||||||
| Symbol | Rota_NSP3 | ||||||||
| Pfam | PF01665 | ||||||||
| InterPro | IPR002873 | ||||||||
| CATH | 1lj2A00 | ||||||||
| SCOP2 | d1lj2a_ / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Białko rotawirusa NSP3 (NS34) jest związane z 3'-końcową sekwencją konsensusową wirusowych mRNA w zakażonych komórkach.
Cztery nukleotydy to minimalny wymóg rozpoznawania RNA przez rotawirusowe białko niestrukturalne NSP3: przy użyciu krótkich oligorybonukleotydów ustalono, że minimalną sekwencją RNA wymaganą do wiązania NSP3A jest GACC .
Rotawirusowe białko wiążące RNA NSP3 oddziałuje z eIF4GI i usuwa białko wiążące poli (A) z eIF4F . A NSP3A, zastępując PABP na eIF4GI, odpowiada za wyłączenie syntezy białek komórkowych.
Ekspresja NSP3 w komórkach ssaków umożliwia wydajną translację wirusopodobnego mRNA: NSP3 tworzy połączenie między wirusowym mRNA a komórkową maszynerią translacyjną, a zatem jest funkcjonalnym analogiem komórkowego białka wiążącego poli(A).
Mutageneza ukierunkowana na miejsce i izotermiczna kalorymetria miareczkowa udokumentowały, że NSP3 i PABP wykorzystują analogiczne strategie rozpoznawania eIF4G, pomimo wyraźnych różnic w strukturze trzeciorzędowej.
Wykorzystując test dwuhybrydowy drożdży, RoXan odkryto, że nowe białko komórkowe wiąże NSP3. Interakcja między NSP3 i RoXaN nie zaburza interakcji między NSP3 i eIF4GI, a trójskładnikowy kompleks złożony z NSP3, RoXaN i eIF4G I można wykryć w komórkach zakażonych rotawirusem, implikując RoXaN w regulacji translacji.