Powtórzenie pentatricopeptydu
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| powtórzeń pentatricopeptydu | |||||||||
| Symbol | PPR | ||||||||
| Pfam | PF01535 | ||||||||
| Klan Pfam | CL0020 | ||||||||
| InterPro | IPR002885 | ||||||||
| PROZYTA | PS51375 | ||||||||
| |||||||||
Powtórzenie pentatricopeptydu ( PPR) jest motywem sekwencji 35 aminokwasów . Białka zawierające powtórzenia pentatricopeptydu to rodzina białek powszechnie występujących w królestwie roślin . Wyróżnia je obecność tandemowych zdegenerowanych motywów PPR oraz względny brak intronów w kodujących je genach.
Około 450 takich białek zidentyfikowano w genomie Arabidopsis , a kolejne 477 w genomie ryżu . Pomimo dużej wielkości rodziny białek, dane genetyczne sugerują, że redundancja funkcji między białkami PPR u Arabidopsis jest niewielka lub żadna .
Przeznaczenie białek PPR jest obecnie przedmiotem sporu. Wykazano, że wiele osobników Arabidopsis wchodzi w interakcje (często zasadniczo) z mitochondriami i innymi organellami i prawdopodobnie bierze udział w edycji RNA . Jednak do zajścia tej edycji potrzeba wielu białek trans, a badania nadal sprawdzają, które białka są potrzebne.
Struktura PPR została rozwiązana. Składa się w helisa-obrót-helisa, podobną do tej występującej w powtórzeniu tetratrikopeptydu . Kilka powtórzeń białka tworzy pierścień wokół jednoniciowej cząsteczki RNA w sposób wrażliwy na sekwencję, przypominający efektory TAL .
Przykłady
Ludzkie geny kodujące białka zawierające to powtórzenie obejmują: