Puchar Świata ISU w łyżwiarstwie szybkim 2012–2013 , oficjalnie Puchar Świata ISU w łyżwiarstwie szybkim 2012–2013 , był serią międzynarodowych zawodów w łyżwiarstwie szybkim , które trwały przez cały sezon. Sezon rozpoczął się 16 listopada 2012 roku w Heerenveen w Holandii, a zakończył finałem 10 marca 2013 roku, również w Heerenveen. W sumie odbyło się dziewięć weekendów rywalizacji w ośmiu różnych lokalizacjach, rozegrano dwanaście pucharów (sześć dla mężczyzn i sześć dla kobiet) oraz odbyły się 82 wyścigi.
W tym sezonie punkty Pucharu Świata przyznawane były w biegu masowym. Dodatkowo sprint drużynowy był rozgrywany jako impreza pokazowa na obu zawodach w Heerenveen. Puchar Świata jest organizowany przez Międzynarodową Unię Łyżwiarską (ISU).
Uwaga: biegi na 5000 i 10000 metrów mężczyzn rozgrywano jako jeden puchar, a kobiet na 3000 i 5000 metrów jako jeden puchar, jak wskazano za pomocą kodowania kolorami.