RBM3

Identyfikatory
RBM3
	, IS1-RNPL, RNPL, białko z motywem wiążącym RNA (RNP1, RRM) 3, białko z motywem wiążącym RNA 3
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( Człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Ojej Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Składnik komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
Ortolodzy Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) Wyszukiwanie PubMed
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Domniemane białko wiążące RNA 3 to białko kodowane u ludzi przez gen RBM3 .

Funkcjonować

Gen ten należy do rodziny białek wiążących RNA bogatych w glicynę i koduje białko z jedną domeną motywu rozpoznawania RNA (RRM). Ekspresja tego genu jest indukowana przez szok termiczny i niskie ciśnienie tlenu. pseudogen . Scharakteryzowano alternatywne warianty splicingu transkrypcyjnego, kodujące różne izoformy .

RBM3 jest białkiem wiążącym RNA indukowanym zimnem i bierze udział w biogenezie mRNA, wywierając działanie antyapoptotyczne . Według profilowania opartego na przeciwciałach i analizy transkryptomicznej , białko RBM3 jest obecne we wszystkich analizowanych tkankach ludzkich i na podstawie mikroskopii konfokalnej zlokalizowane jest głównie w nukleoplazmie .

Znaczenie kliniczne

RBM3 jest protoonkogenem powiązanym z progresją nowotworu i przerzutami oraz potencjalnym biomarkerem raka . Na podstawie danych dotyczących przeżycia pacjentów wysoki poziom białka RBM3 w komórkach nowotworowych jest korzystnym biomarkerem prognostycznym w raku jelita grubego .

Dalsza lektura

•   Danno S, Nishiyama H, Higashitsuji H, Yokoi H, Xue JH, Itoh K, Matsuda T, Fujita J (lipiec 1997). „Zwiększony poziom transkryptu RBM3, członka rodziny białek wiążących RNA bogatych w glicynę, w komórkach ludzkich w odpowiedzi na stres zimnem”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 236 (3): 804–7. doi : 10.1006/bbrc.1997.7059 . PMID 9245737 .
•   Chappell SA, Mauro wiceprezes (wrzesień 2003). „Wewnętrzne miejsce wejścia rybosomu (IRES) zawarte w mRNA białka motywu wiążącego RNA 3 (Rbm3) składa się z funkcjonalnie odrębnych elementów” . Journal of Biological Chemistry . 278 (36): 33793–800. doi : 10.1074/jbc.M303495200 . PMID 12824175 .
•   Wellmann S, Bührer C, Moderegger E, Zelmer A, Kirschner R, Koehne P, Fujita J, Seeger K (kwiecień 2004). „Regulowana tlenem ekspresja białek wiążących RNA RBM3 i CIRP poprzez mechanizm niezależny od HIF-1” . Journal of Cell Science . 117 (cz. 9): 1785–94. doi : 10.1242/jcs.01026 . PMID 15075239 .
•   Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (maj 2004). „Solidne profilowanie fosfoproteomiczne miejsc fosforylacji tyrozyny z ludzkich komórek T przy użyciu chromatografii powinowactwa z unieruchomionym metalem i tandemowej spektrometrii mas”. Chemia analityczna . 76 (10): 2763–72. doi : 10.1021/ac035352d . PMID 15144186 .
•   Dellis S, Strickland KC, McCrary WJ, Patel A, Stocum E, Wright CF (listopad 2004). „Interakcje białek między czynnikami późnej transkrypcji wirusa krowianki”. Wirusologia . 329 (2): 328–36. doi : 10.1016/j.virol.2004.08.017 . HDL : 10161/15063 . PMID 15518812 .
•    Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (styczeń 2005). „Dynamika proteomu jądrowego”. Natura . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/natura03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
•    Ong SE, Mittler G, Mann M (listopad 2004). „Identyfikacja i oznaczanie ilościowe miejsc metylacji in vivo za pomocą ciężkiego metylu SILAC”. Metody natury . 1 (2): 119–26. doi : 10.1038/nmeth715 . PMID 15782174 . S2CID 6654604 .
•    Martínez-Arribas F, Agudo D, Pollán M, Gómez-Esquer F, Díaz-Gil G, Lucas R, Schneider J (kwiecień 2006). „Pozytywna korelacja między ekspresją genów RBM chromosomu X (RBMX, RBM3, RBM10) i proapoptotycznego genu Bax w ludzkim raku piersi”. Journal of Cellular Biochemistry . 97 (6): 1275–82. doi : 10.1002/jcb.20725 . PMID 16552754 . S2CID 9804734 .