Rodzina RNA CsrB/RsmB
| Rodzina CsrB/RsmB RNA | |
|---|---|
 Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji CsrB
| |
| identyfikatorów | |
| Symbol | CsrB |
| Rfam | RF00018 |
| Inne dane | |
| typ RNA | gen ; sRNA |
| Domeny | Bakteria |
| WIĘC | SO: 0000377 |
| Struktury PDB | PDBe |
CsrB RNA jest niekodującym RNA , który wiąże się z około 9 do 10 dimerami białka CsrA . RNA CsrB zawierają konserwatywny motyw CAGGXXG, który znajduje się w maksymalnie 18 kopiach i sugerowano, że wiąże CsrA. Układ regulacyjny Csr ma silny negatywny wpływ regulacyjny na glikogenu , glikoneogenezę i katabolizm glikogenu oraz pozytywny wpływ regulacyjny na glikolizę . U innych bakterii, takich jak Erwinia carotovora, wykazano, że białko RsmA reguluje wytwarzanie determinantów wirulencji , takich jak enzymy zewnątrzkomórkowe . RsmA wiąże się z regulatorowym RNA RsmB, który również należy do tej rodziny.
Wykazano, że RNA RsmB jest regulowane w górę przez system GacS / A i zwiększa ekspresję genu T3SS w dół. FlhDC, główny regulator genów wici, również aktywuje produkcję rsmB RNA. Ujawniono sieć regulacyjną łączącą rsmB, FlhDC i T3SS.
Wykazano, że odgrywa rolę w biokontroli Rahnella aquatilis HX2 (środek biokontroli wytwarzający substancję przeciwbakteryjną).