Rodzina domen Yip1
Rodzina domen Yip1 to grupa białek zaangażowanych w regulację ruchu wydzielniczego u eukariontów . Rodzina składa się z czterech członków w drożdżach i dziewięciu członków w ludziach. Członkowie rodziny mają wspólną architekturę zawierającą pięć domen transbłonowych .
Ewolucja
Członkowie rodziny domeny Yip1 znajdują się we wszystkich eukariotach. Pączkujące drożdże Saccharomyces cerevisiae mają czterech członków rodziny domen Yip1: Yif1p, Yip1p, Yip4p i Yip5p. Sekwencja aminokwasowa członków rodziny domen Yip dzieli ich na dwie grupy, zwane podjednostkami α i podjednostkami β. Podjednostki α – u drożdży Yip1p i Yip4p – są ze sobą bliżej spokrewnione niż z podjednostkami β, Yip5p i Yif1p. U ssaków obie grupy są rozszerzone, z podjednostkami α YipF4, YipF5, YipF6 i YipF7; jak również podjednostki β Yif1A , Yif1B, YipF1, YipF2 i YipF3.
Funkcjonować
Członkowie rodziny domen Yip1 lokalizują się w aparacie Golgiego, gdzie wchodzą ze sobą w interakcje, tworząc kompleksy zaangażowane w handel ładunkami w aparacie Golgiego i / lub między retikulum endoplazmatycznym a aparatem Golgiego. Członkowie rodziny domen Yip1 są szeroko rozmieszczeni w organizmie – z wyjątkiem YipF7, który występuje głównie w mięśniach szkieletowych i języku , podczas gdy YipF1A występuje głównie w wątrobie . W komórce różni członkowie rodziny Yip mają nieco inne lokalizacje, z YipF5, YipF7, Yif1A i Yif1B (u drożdży Yip1p i Yif1p) na marginesie retikulum endoplazmatycznego i aparatu Golgiego; YipF3 i YipF4 w cis-Golgi ; oraz YipF1, YipF2 i Yipf6 (w drożdżach Yip4p i Yip5p) w trans-Golgi .
YipF1 został warunkowo znokautowany u myszy bez zauważalnego efektu.
Niefunkcjonalna wersja YipF6 zaostrzała zapalenie jelit u myszy, a czasami powodowała samoistne zapalenie jelit.
Struktura
Każde białko z rodziny domen Yip1 zawiera pięć domen transbłonowych, z końcem N wystawionym na cytozol , a końcem C na światło aparatu Golgiego . Uważa się, że członkowie rodziny domen Yip1 wchodzą w interakcje z partnerem, przy czym dwie cząsteczki każdego partnera tworzą aktywny kompleks tetramerowy z 20 segmentami transbłonowymi.