Sygnał lokalizacyjny Gurkena
| Sygnał lokalizacji Gurken | |
|---|---|
 Przewidywana drugorzędowa struktura Phoebe i zachowanie sekwencji Gurken
| |
| identyfikatorów | |
| Symbol | Gurken |
| Rfam | RF00626 |
| Inne dane | |
| typ RNA | Cis-reg |
| Domeny | Eukariota |
| WIĘC | SO: 0005836 |
| Struktury PDB | PDBe |
Lokalizacja mRNA jest powszechnym sposobem potranskrypcyjnej regulacji ekspresji genów, która kieruje białko do miejsca jego funkcji. Białka są wysoce zależne od środowisk komórkowych pod względem stabilności i funkcji, dlatego sygnały lokalizacji mRNA są kluczowe dla utrzymania funkcji białek. Sygnał lokalizacji Gurkena jest elementem regulacyjnym RNA zachowanym u wielu gatunków Drosophila . Element składa się z pętli macierzystej RNA w regionie kodującym informacyjnego RNA , który tworzy sygnał dla dyneiny mRNA Gurkena do czapeczki grzbietowo-przedniej w pobliżu jądra oocytu .
Mechanizm akcji
Podczas oogenezy Drosophila sygnalizacja między linią zarodkową a somą prowadzi do ustalenia polaryzacji przednio-tylnej w jaju i zarodku. Proces ten obejmuje interakcję gurkena (grk), białka podobnego do TGFα, z torpedą (u góry), receptorem naskórkowego czynnika wzrostu Drosophila (EGFR). Lokalizacja RNA gurkena określa morfologię komórki poprzez regulację dystrybucji białka gurkena. Transkrypty mRNA Gurkena, które nie są zlokalizowane w grzbietowo-przedniej części oocytu, zostają wyciszone poprzez modyfikacje potranslacyjne. Zaobserwowano potranslacyjne modyfikacje białka gurken w celu określenia lokalizacji i funkcji białka. Poliadenylacja transkryptów gurken zachodzi podczas oogenezy; długość poli (A) określa etap oogenezy, w którym białko gurkena jest adenylowane. 30-50 adenlyowanych reszt gurken jest związanych z początkową oogenezą, podczas gdy 50-90 adenlyowanych reszt jest związanych z późną fazą oogenezy.
Główna różnica między sygnałem lokalizacji gurken a innymi sygnałami lokalizacji polega na tym, że sygnały lokalizacji gurken są rozmieszczone w regionach kodujących, podczas gdy większość innych sygnałów lokalizacji znajduje się w regionach 3' nie podlegających translacji . Sygnał lokalizacji gurkena nie działa prawidłowo, jeśli znajduje się w nieulegającym translacji regionie 3'.