Technika selektora
Technika selektora to metoda amplifikacji i multipleksowania genomowego DNA.
Proces
Genomowy DNA trawi się enzymami restrykcyjnymi , poddaje cyrkulacji przez hybrydyzację z selektorami, a następnie przyłącza się do sekwencji wektora przez ligację . W wyniku procedury powstają koliste cząsteczki DNA z zawartym ogólnym motywem pary starterów , które można wykorzystać do amplifikacji metodą PCR lub RCA .
Konstrukcja selektora
Selektor składa się z dwóch oligonukleotydów, jednego oligonukleotydu wektorowego i jednej sondy selektorowej . Razem tworzą jeden selektor ze specyficznymi dla celu końcami po każdej stronie ogólnego motywu startera.
Mechanizmy selekcji
- Sonda selektora hybrydyzuje z obydwoma końcami wybranego celu.
- Sonda selektorowa hybrydyzuje jednym końcem z końcem 3' celu, a drugim końcem z wewnętrzną sekwencją celu. Wystający koniec 5' odcina się stosując polimerazę Taq .
Publikacje
- Demonstracja metody selektora
- Oprogramowanie PieceMaker do projektowania eksperymentów selektorowych
Kategoria: