Tioesteraza acylo-białkowa
 Struktura krystaliczna ludzkiego APT1, kod PDB 1fj2 . Helisy alfa są zaznaczone na czerwono, nici beta na złocie, reszty miejsca katalitycznego na czarno. Dwa różne monomery dimeru są zacienione na zielono i brązowo.
| |||||||||
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Symbol | Tioesterazy acylo-białkowe (APT) | ||||||||
| Pfam | PF02230 | ||||||||
| InterPro | IPR029058 | ||||||||
| |||||||||
Tioesterazy acylo-białkowe to enzymy odszczepiające modyfikacje lipidów w białkach, zlokalizowane na atomie siarki reszt cysteiny połączonych wiązaniem tioestrowym . Tioesterazy acylo-białkowe są częścią nadrodziny białek hydrolaz α/β i mają konserwatywną triadę katalityczną . Z tego powodu tioesterazy acylo-białkowe są również zdolne do hydrolizy wiązań estrowych związanych z tlenem .
Funkcjonować
Tioesterazy acylo-białkowe biorą udział w depalmitoilacji białek, co oznacza, że odszczepiają palmitoilowe modyfikacje reszt cysteinowych białek. Cele komórkowe obejmują trimeryczne białka G-alfa , kanały jonowe i GAP-43 . Ponadto zidentyfikowano ludzkie tioesterazy acylo-białkowe 1 i 2 jako główne składniki kontrolujące cykl palmitoilacji onkogenu Ras . Depalmitoilacja Ras przez tioesterazy acylo-białkowe potencjalnie zmniejsza powinowactwo Ras do błon wewnętrznych , umożliwiając jego ponowną palmitoilację w aparacie Golgiego i skierowanie do błony plazmatycznej . Dlatego uważa się, że tioesterazy acylo-białkowe korygują potencjalną błędną lokalizację Ras.
Znane enzymy
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Obecnie w pełni zwalidowane ludzkie tioesterazy acylo-białkowe to APT1 i APT2, które mają 66% homologii sekwencji . Ponadto opisano kilka przypuszczalnych tioesteraz acylo-białkowych, w tym rodzinę enzymów ABHD17. W lizosomie PPT1 z rodziny tioesterazy palmitoilowej ma podobną aktywność enzymatyczną jak tioesterazy acylo-białkowe.
Struktura
Tioesterazy acylo-białkowe mają 3 główne składniki strukturalne , które determinują funkcje białek i przetwarzanie substratów : 1. Konserwatywna , klasyczna triada katalityczna do rozrywania wiązań estrowych i tioestrowych ; 2. Długi hydrofobowy tunel substratu do umieszczenia ugrupowania palmitoilowego, jak zidentyfikowano w strukturach krystalicznych ludzkiej tioesterazy acylo-białkowej 1, ludzkiej tioesterazy acylo-białkowej 2 i tioesterazy acylo-białkowej Zea mays 2; 3. Pętla pokrywająca miejsce katalityczne jest bardzo elastyczna i jest głównym czynnikiem determinującym szybkość uwalniania produktu przez enzym .
Zahamowanie
Zaangażowanie w kontrolowanie lokalizacji onkogenu Ras uczyniło tioesterazy acylo-białkowe potencjalnymi celami leków przeciwnowotworowych . Uważa się, że hamowanie tioesterazy acylo-białkowej zwiększa błędną lokalizację Ras na błonach komórkowych , ostatecznie prowadząc do załamania cyklu Ras. Inhibitory tioesterazy acylo-białkowej były specyficznie ukierunkowane na hydrofobowy tunel substratu, miejsce katalityczne seryny lub oba.
Badania
Obecne podejścia do badania aktywności biologicznej tioesterazy acylo-białkowej obejmują proteomikę , monitorowanie przemieszczania substratów fluorescencyjnych wstrzykiwanych w mikroiniekcji , stosowanie przepuszczalnych dla komórek mimetyków substratów i przepuszczalnych dla komórek małocząsteczkowych fluorescencyjnych narzędzi chemicznych.