Wallemia ichtiofaga
|
|
| Wallemia ichthyophaga | |
|---|---|
| Mikrofotografia przedstawiająca charakterystyczną sarcynową morfologię W. ichthyophaga i kryształy NaCl. | |
| Klasyfikacja naukowa | |
| Królestwo: | |
| Dział: | |
| Klasa: | |
| Zamówienie: | |
| Rodzina: | |
| Rodzaj: | |
| Gatunek: |
W. ichthyophaga
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Wallemia ichtiofaga
Johan-Olsen 1887
|
|
Wallemia ichthyophaga to jeden z trzech gatunków grzybów z rodzaju Wallemia , który z kolei jest jedynym rodzajem należącym do klasy Wallemiomycetes . Filogenetyczne pochodzenie linii zostało umieszczone w różnych częściach Basidiomycota , ale według analizy większych zbiorów danych jest to (495-milionowa) siostrzana grupa Agaricomycotina . Chociaż początkowo uważano, że jest aseksualny , genomika populacji znalazła dowody na rekombinację między szczepami, a locus typu kojarzenia zidentyfikowano we wszystkich zsekwencjonowanych genomach gatunku.
Do tej pory wyizolowano tylko ograniczoną liczbę szczepów W. ichthyophaga (z hipersolnej wody solanek , bąków (bogatych w magnez roztworów resztkowych w produkcji soli z wody morskiej) i solonego mięsa).
W. ichthyophaga wymaga co najmniej 1,5 M NaCl do wzrostu in vitro (lub innego osmolitu dla równoważnej aktywności wody ) i rozwija się nawet w nasyconym roztworze NaCl. Czyni go to najbardziej halofilnym znanym grzybem i odróżnia go od grzybów halotolerancyjnych (np. Aureobasidium pullulans ) i skrajnie halotolerancyjnych (np. Hortaea werneckii ), które są w stanie dobrze rosnąć nawet przy braku soli w pożywce. Niezdolność do wzrostu bez soli jest wyjątkiem w królestwie grzybów, ale jest powszechna u halofilnych Archaea .
Grzyb rośnie w postaci struktur przypominających sarcynę lub zwartych wielokomórkowych kęp. Zwiększają się one prawie czterokrotnie pod wpływem wysokiego zasolenia, a ściana komórkowa ulega trzykrotnemu pogrubieniu. Skutkuje to znacznie zmniejszoną funkcjonalną objętością komórek i uważa się, że jest to jeden z mechanizmów halotolerancji tego gatunku.
całego genomu W. ichthyophaga ujawniło, że ma on jeden z najmniejszych ze wszystkich zsekwencjonowanych genomów podstawczaków (9,6 Mbp, tylko 4884 przewidywanych białek). W przeciwieństwie do tego, co zaobserwowano w przypadku wyjątkowo halotolerancyjnego H. werneckii , u W. ichthyophaga prawie nie ma ekspansji genów transporterów kationów metali, a ich ekspresja nie reaguje na sól. Z drugiej strony występuje ogromne wzbogacenie w hydrofobiny (białka ściany komórkowej o różnorodnych funkcjach i wielu zastosowaniach biotechnologicznych), które zawierają niezwykle wysoki udział aminokwasów kwaśnych. Wysoki udział aminokwasów kwaśnych uważa się za adaptację białek do wysokich stężeń soli. Po zsekwencjonowaniu genomów prawie wszystkich znanych szczepów W. ichthyophaga analiza genomu populacji wykazała, że gatunek ten tworzy pojedynczą rekombinującą populację.