Wirus Apium Y
| Wirus Apium | |
|---|---|
| Klasyfikacja wirusów Y | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Rybowiria |
| Królestwo: | Orthornawirusy |
| Gromada: | Pisuviricota |
| Klasa: | Stelpaviricetes |
| Zamówienie: | Patatawirusy |
| Rodzina: | Potyviridae |
| Rodzaj: | Potywirus |
| Gatunek: |
Wirus Apium Y
|
Wirus Apium Y (ApVY) jest wirusem chorobotwórczym dla roślin z rodzaju Potyvirus i rodziny wirusów Potyviridae .
Wirus Y Apium jest niedawno opisanym członkiem rodziny potywirusów. Po raz pierwszy został znaleziony w Australii w 2002 roku w trującej cykucie ( Conium maculatum : imigrujący chwast w Australii). Badanie gatunków rodzimych i chwastów z rodziny Apiaceae wykazało, że ApVY jest szeroko rozpowszechniony w Australii. Ponadto ta ankieta i inne wykazały dwa inne potywirusy. Jednym z nich był dobrze znany potywirus infekujący Apiaceae, wirus mozaiki selera (CeMV). CeMV wykryto w uprawach selera ( Apium graveolens ) na całym świecie, w tym w Australii, Nowej Zelandii i USA. Trzecim potywirusem znalezionym w tych ankietach był inny nieznany wcześniej potywirus, Carrot virus Y (CarVY).
Podział geograficzny
Odkąd jego sekwencja została po raz pierwszy zdeponowana w GenBank, ApVY został znaleziony w Nowej Zelandii , na Florydzie , w stanie Waszyngton i Kalifornii w Stanach Zjednoczonych oraz Turcji .
W Nowej Zelandii wykryto go w selerze w mieszanej infekcji CeMV. W stanie Waszyngton znaleziono dwa różne szczepy ApVY, jeden w uprawach selera naciowego, a drugi w cykucie . Ten w selerze był w 98% identyczny z australijskimi sekwencjami nukleotydowymi. Ten znaleziony w naturalnie zakażonej truciźnie cykuty był tylko w 91% identyczny z sekwencjami z Australii. Później okazało się, że są w 98% identyczne z północnoamerykańskimi izolatami znalezionymi na Florydzie iw Kalifornii. Z kolei izolat z Florydy był w 90-91% identyczny z izolatem australijskim.
Trzeci szczep tego wirusa jest znany w Niemczech od początku lat 90. Sekwencje tego wirusa wyizolowanego z pietruszki ( Petroselinum crispum ) były w 94% identyczne z australijskim izolatem z pietruszki.
ApVY został niedawno wykryty również w prowincji Balıkesir w Turcji i może być tam szeroko rozpowszechniony, ponieważ wszystkie 10 próbek pietruszki z objawami dało wynik pozytywny przy użyciu metody wykrywania RT-PCR. W badaniu z powodzeniem wygenerowano również nową parę starterów do amplifikacji 1066 pz genomu ApVY, w tym genu kompletnego białka płaszcza (CP). Trzy z czterech sekwencjonowanych izolatów tureckich miały wspólnego przodka z dwoma izolatami słoweńskimi, co umieściło je w tej samej grupie filogenetycznej, podczas gdy inny został zgrupowany z pięcioma izolatami z USA.
Zakres żywicieli i objawy
Oprócz uprawianego selera i pietruszki oraz cykuty, naturalne infekcje ApVY zidentyfikowano w selerze morskim ( Apium prostratum ), kolendrze ( Coriandrum sativum ) i zielsku biskupim ( Ammi majus ). Stwierdzono, że jest przenoszony przez mszyce na odmiany selera (korzeń selera, Apium graveolens var. Rapaceum ) w Kalifornii. Wszystkie należą do rodziny roślin Apiaceae . W innym badaniu zakresu żywicieli, wirus powoduje miejscowe zmiany i inne objawy na Chenopodium quinoa , Blitum capitatum i Beta macrocarpa , które należą do Amaranthaceae .
Zgłaszane objawy obejmowały mozaikę, przejaśnienia żył lub prążki, nekrotyczne/chlorotyczne linie i zahamowanie wzrostu. Niektóre próbki pietruszki, selera i cykuty trującej, które dały pozytywny wynik w testach, były jednak bezobjawowe.