Wirus nitkowaty Sulfolobus islandicus

Wirus nitkowaty Sulfolobus islandicus
Klasyfikacja wirusów
(nierankingowe): Wirus
królestwo : Adnaviria
Królestwo: Zilligvirae
Gromada: Taleaviricota
Klasa: Tokiviricetes
Zamówienie: więzadła wirusowe
Rodzina: Lipothrixviridae
Rodzaj: Betalipotrixwirus
Gatunek:
Wirus nitkowaty Sulfolobus islandicus

Wirus nitkowaty sulfolobus islandicus (SIFV) to wirus archeologiczny , sklasyfikowany w rodzinie Lipothrixviridae w rzędzie Ligamenvirales . Wirus infekuje hipotermofilny i kwasochłonny archeon Sulfolobus islandicus .

SIFV ma liniowy dwuniciowy genom DNA o wielkości 40 852 pz, który jest największym wśród scharakteryzowanych lipothrixwirusów. Wiriony to otoczone włókna o długości prawie 2 mikrometrów. Nukleokapsyd jest utworzony z dwóch paralogicznych głównych białek kapsydu, które ciasno owijają się wokół genomu dsDNA; w szczególności odwodnienie genomowego DNA przez główne białka kapsydu przekształca formie B w DNA w formie A.

Koło życia

Wiriony SIFV gromadzą się wewnątrz komórki. Wiązanie głównych dimerów białek kapsydu z liniowym genomem dsDNA prowadzi do złożenia nukleokapsydów, które są następnie otoczone wewnątrzkomórkowo przez nieznany mechanizm. SIFV i prawdopodobnie inne lipothrixwirusy są wirusami litycznymi. Uwalnianie wirionów odbywa się poprzez piramidalne portale, zwane piramidami związanymi z wirusami (VAP). W przeciwieństwie do niektórych innych wirusów archeologicznych (np. rudiwirusów i turriwirusów), VAP SIFV mają sześciokątną podstawę (tzn. zbudowaną z sześciu trójkątnych fasetek). VAP mogą być tak duże, jak 220 nm u podstawy i są zbudowane z pojedynczego białka kodowanego przez SIFV o długości 89 aa. Ekspresja tego białka w Escherichia coli prowadzi do powstawania VAP w wewnętrznej błonie bakteryjnej. [ potrzebne źródło ]