białko SecY
| Białko SecY/Sec61α | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktura kanału przewodzącego białko.
| |||||||||
| Identyfikatory | |||||||||
| Symbol | SecY | ||||||||
| Pfam | PF00344 | ||||||||
| InterPro | IPR002208 | ||||||||
| PROZYTA | PDOC00612 | ||||||||
| SCOP2 | 1rh5 / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3.A.5 | ||||||||
| Nadrodzina OPM | 19 | ||||||||
| Białko OPM | 1rh5 | ||||||||
| Błona | 165 | ||||||||
| |||||||||
Białko SecY jest główną podjednostką transbłonową bakteryjnego szlaku eksportu Sec i kompleksu ATPazy wydzielającej białko , znanego również jako translokon SecYEG . Homologi kompleksu SecYEG znajdują się u eukariontów i archeonów, gdzie podjednostka jest znana jako Sec61α.
Wydzielanie niektórych białek przenoszących peptyd sygnałowy przez błonę wewnętrzną bakterii Gram-ujemnych zachodzi na szlaku translokazy prebiałkowej. Białka są wytwarzane w cytoplazmie jako prekursory i wymagają podjednostki opiekuńczej, która kieruje je do składnika translokazy w błonie. Stamtąd dojrzałe białka są albo kierowane do błony zewnętrznej, albo pozostają jako białka peryplazmatyczne. Podjednostki białka translokazy są zakodowane na chromosomie bakteryjnym.
Szlak translokazy obejmuje 7 białek, w tym białko opiekuńcze (SecB), ATPazę ( SecA ), integralny kompleks błonowy (SecY, SecE i SecG) oraz dwa dodatkowe białka błonowe, które promują uwalnianie dojrzałego peptydu do peryplazmy ( SecD i SecF). Białko opiekuńcze SecB jest wysoce kwaśnym białkiem homotetramerycznym, które występuje jako „dimer dimerów” w cytoplazmie bakteryjnej. SecB utrzymuje prebiałka w stanie niezwiniętym po translacji i kieruje je do białka błony obwodowej ATPazy SecA w celu wydzielenia.
Regiony cytoplazmatyczne 2 i 3 oraz domeny TM 1, 2, 4, 5, 7 i 10 są dobrze konserwowane: uważa się, że konserwatywne regiony cytoplazmatyczne oddziałują z cytoplazmatycznymi czynnikami wydzielania, podczas gdy domeny TM mogą uczestniczyć w eksporcie białek. SecY jest również kodowany w genomie chloroplastów niektórych alg, gdzie może być zaangażowany w prokariotyczny system eksportu białek przez dwie błony retikulum endoplazmatycznego chloroplastów (CER), który jest obecny w algach chromofitowych i kryptofitowych.
podrodziny
Białka ludzkie zawierające tę domenę
SEC61A1 ; SEC61A2;