omegasome
Omegasom to organelle komórkowe składające się z dwuwarstwowych błon lipidowych wzbogaconych w 3-fosforan fosfatydyloinozytolu (w skrócie PI(3)P lub PtdIns3P) i związanych z procesem autofagii . Jest subdomeną retikulum endoplazmatycznego (ER) i ma morfologię przypominającą grecką wielką literę Omega (Ω). Omegasomy to miejsca, z których tworzą się fagofory (zwane także „membranami izolacyjnymi”), które są strukturami przypominającymi worki, które dojrzewają do autofagosomów i łączą się z lizosomami w celu degradacji zawartości autofagosomów. Tworzenie omegasomów zależy od różnych czynników, jednak generalnie tworzenie omegasomów jest zwiększone w odpowiedzi na głód , aw niektórych sytuacjach biochemicznych obecność PI(3)P prowadzi do powstawania omegasomów.
Makroautofagia
Autofagia (od greckich słów oznaczających „jaźń” i „jedzenie”) to proces trawienia lub degradacji cząsteczek cytoplazmatycznych ( białek , lipidów , cukrów i organelli ). Makroautofagia jest głównym szlakiem autofagicznym, używanym głównie do eliminacji uszkodzonych organelli komórkowych, takich jak mitochondria , rybosomy itp., które pomagają w dostarczaniu aminokwasów i energii do komórek oraz utrzymują długowieczność. Omegasomy umiejscowione na retikulum endoplazmatycznym, wzbogacone w białka wiążące PI(3)P i PI(3)P, odpowiadają za tworzenie fagoforów. Omegasom jest obecny przy otwarciu workowatego fagoforu, podczas gdy elementy przeznaczone do degradacji przez makroautofagię są ładowane do fagoforu. Istnieją specyficzne białka receptorowe, które rekrutują elementy do fagoforu. Fagofor rozszerza się, aby pomieścić elementy, aż omegasom zostanie zamknięty, aby wytworzyć z grubsza kulisty autofagosom. Nie jest jasne, w jaki sposób autofagosomy są „odłączane” lub „wychodzą” z omegasomu, ale białko Atg3 związane z autofagocytozą i inne białka. Ponadto wydaje się, że zaangażowane są kolekcje cienkich kanalików na styku omegasomu i fagoforu. Uważa się również, że aktyna jest ważna. Zaobserwowano, że różne infekcje patogenami, które prowadzą do indukcji autofagii, wykazują tworzenie autofagosomów poprzez omegasomy, które rozwinęły się jako wrodzona odpowiedź na infekcję.
Funkcjonować
Omegasomy odgrywają znaczącą rolę funkcjonalną w różnych szlakach biochemicznych, które pomagają w różnych procesach autofagosomu. Omegasomy przyciągają efektory potrzebne do celowania w PI3P, jednocześnie zapewniając, że błony autofagosomalne łączą się z pęcherzykami z podwójną błoną i promują tworzenie autofagosomu. Omegasomy działają jako progenitory tworzenia autofagosomu podczas szlaku autofagii. Istnieją różne mediatory autofagosomu zaangażowane w autofagię, jednak to regulacja szlaku przez omegasom zapewnia płynne przejście tworzenia autofagosomu i wzbogacenie składników odżywczych w komórkach.