pRNA bakteriofaga
| Bakteriofag pRNA | |
|---|---|
 Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji Phage_pRNA
| |
| identyfikatorów | |
| Symbol | fag_pRNA |
| Rfam | RF00044 |
| Inne dane | |
| typ RNA | Gen |
| Domeny | Wirusy |
| WIĘC | SO: 0000655 |
| Struktury PDB | PDBe |
pRNA bakteriofaga jest elementem ncRNA . Podczas replikacji liniowych wirusów dsDNA genom wirusowy jest pakowany do wstępnie uformowanego wirusowego prokapsydu . Pakowanie DNA w prokapsyd wymaga silnika molekularnego , który wykorzystuje ATP jako energię do wykonania niekorzystnego energetycznie ruchu. W niektórych bakteriofagach cząsteczka RNA (pRNA) jest istotnym składnikiem tego silnika. Analizy strukturalne silnika pakującego wykazały, że pRNA ma pięciokrotną symetrię po przyłączeniu do głowicy. Uważa się, że pRNA jest związany przez białko łączące kapsyd . Tylko pierwsze 120 zasad pRNA jest niezbędnych do upakowania wirusowego DNA. Proponuje się, aby pRNA składało się z dwóch domen, jednej odpowiadającej pierwszym 120 zasadom, a drugiej pozostałym 50 zasadom. Rozszczepienie jądrowe zachodzi w regionie pojedynczej nici łączącej te dwie domeny.