ŁĄCZYĆ
COMBINE , COmputational Modeling in BIology NETwork, to inicjatywa mająca na celu koordynację rozwoju różnych wspólnotowych standardów i formatów modeli obliczeniowych, początkowo w biologii systemowej i dziedzinach pokrewnych.
Historia
Inicjatywa COMBINE została zapoczątkowana w 2010 roku jako próba rozpoczęcia szerszej serii spotkań naukowych w celu zastąpienia kilku mniejszych i bardziej ukierunkowanych spotkań i hackathonów , w szczególności spotkań Systems Biology Graphical Notation (SBGN) i Systems Biology Markup Language (SBML). Pierwsze spotkanie COMBINE zostało zorganizowane przez Igora Goryanina i odbyło się w Wyższej Szkole Informatyki Uniwersytetu w Edynburgu w październiku 2010 r. Po końcowej sesji spotkania odbyło się wydarzenie z okazji 10. rocznicy SBML. Od tego czasu spotkania COMBINE odbywają się corocznie; COMBINE 2014 został zorganizowany przez University of Southern California , a COMBINE 2015 zostanie zorganizowany przez grupę Chrisa Myersa z University of Utah .
Formaty reprezentacji
Inicjatywa COMBINE ma na celu koordynację rozwoju wspólnotowych standardów i formatów modelowania komputerowego, zwłaszcza w biologii systemowej. Oczekuje się, że w ten sposób zostanie opracowany zestaw uzupełniających się, ale nienakładających się standardów, obejmujących wszystkie aspekty modelowania komputerowego we wszystkich obszarach biologii. Główne formaty reprezentacji objęte działalnością COMBINE to BioPAX , SBGN , SBML oraz języki znaczników SED-ML i CellML . Powiązane wysiłki standaryzacyjne to MIRIAM , SBO , KiSAO i repozytorium modeli BioModels.net .