ATUM

ATUM

Typ	Prywatny
Przemysł	Biotechnologia
Założony	2003
Założyciele	Sridhar Govindarajan, Claes Gustafsson, Jeremy Minshull, Jon Ness
Siedziba	Newark , Kalifornia , Stany Zjednoczone
Produkty	Synteza genów , Inżynieria białek , Produkcja białek , Bioinformatyka , Rozwój linii komórkowych, Transpozazy typu Leap-In

ATUM to amerykańska firma biotechnologiczna dostarczająca narzędzia dla nauk przyrodniczych, od projektowania i syntezy zoptymalizowanego DNA po produkcję białek i rozwój linii komórkowych GMP.

Firma

Firma ATUM (wcześniej DNA2.0 ) została założona w 2003 roku w Menlo Park w Kalifornii . Firma jest własnością prywatną i nadal prowadzi wszystkie badania, rozwój i produkcję w Kalifornii, obecnie w swoim zakładzie w Newark o powierzchni 50 000 stóp kwadratowych. Zaczęło się i trwa jako syntezy genów i inżynierii białek dla środowisk akademickich, rządowych oraz przemysłu farmaceutycznego, chemicznego, rolniczego i biotechnologicznego. Synteza genów szybko zastąpiła klonowanie molekularne w wielu laboratoriach akademickich i korporacyjnych, jako „odlewnie ery biotechnologii”, umożliwiające wytwarzanie genów na zamówienie do badań biologicznych.

DNA2.0 zostało zaprezentowane w programie PBS Nova ScienceNow , aby pokazać, w jaki sposób geny są tworzone syntetycznie w laboratorium. W 2008 roku firma dostarczyła część fragmentów DNA wykorzystanych do stworzenia syntetycznego genomu bakteryjnego .

Dan Raczej Reports włączył DNA2.0 do swojego odcinka poświęconego biologii syntetycznej i o tym, jak rozwiązuje „niektóre z najważniejszych problemów, przed którymi stoi świat”.

W 2009 roku The Scientist nazwał algorytmy projektowania kodonów (obecnie opatrzone znakiem towarowym jako GeneGPS) opracowane przez DNA2.0 jako jedną z 10 najlepszych innowacji roku w naukach przyrodniczych. Firma ATUM opracowała Electra Vector System, uniwersalny klonowania , który wykorzystuje enzym restrykcyjny typu IIS SapI i ligazę DNA T4 w reakcji w jednej probówce. ATUM udostępnił niektóre składniki molekularne, takie jak syntetyczne białka fluorescencyjne, w ogólnodostępnych zbiorach części DNA ( Fundacja BioBricks ). Atum jest członkiem-założycielem Międzynarodowego Konsorcjum Syntezy Genów (IGSC) w celu promowania bezpieczeństwa biologicznego w branży syntezy genów. Opublikowano ponad 1200 artykułów naukowych wykorzystujących produkty i/lub usługi DNA2.0, z których 44 to pracownicy firmy jako autorzy.

Narzędzia badawcze

• Gene Designer to darmowy pakiet oprogramowania bioinformatycznego . Jest używany przez biologów molekularnych do projektowania, klonowania i walidacji sekwencji genetycznych.
• Bezpłatne narzędzie do projektowania gRNA z algorytmami punktacji dla CRISPR .
• DNA ATLAS to bezpłatne narzędzie do mapowania plazmidów, które pokazuje takie cechy, jak promotory , markery , miejsca restrykcyjne i otwarte ramki odczytu w dowolnej sekwencji wektora DNA .
• Internetowy zestaw narzędzi Bioinformatics został wybrany jako Best of the Web przez Genetic Engineering News.

Związki partnerskie

• Perelman School of Medicine na University of Pennsylvania będzie wykorzystywać technologię GeneGPS opracowaną przez ATUM przede wszystkim do wspierania prac Programu Terapii Genowej nad opracowaniem szczepionki przeciwko HIV-1 poprzez optymalizację ekspresji białka in vivo.
• Centrum Badań nad Infekcjami i Odpornością w St. George's, University of London i Atum nawiązały współpracę w celu opracowania farmaceutyków pochodzenia roślinnego.
• Adimab spółka z ograniczoną odpowiedzialnością i ATUM współpracują w obszarze przeciwciał poprzez projektowanie i konstruowanie bibliotek przeciwciał.
• Cytovance Biologics wykorzystuje GeneGPS firmy ATUM jako część swojego Keystone Expression System do rozwoju szczepów drobnoustrojów w celu udanej bioprodukcji.
• Archer Daniels Midland Company stosuje zastrzeżoną technologię inżynierii białek firmy ATUM, ProteinGPS, w przemysłowych procesach inżynierii enzymów ADM.
• ATUM jest sponsorem BioBuilder, źródła zajęć praktycznych i animacji informacyjnych na temat biologii syntetycznej dla uczniów i nauczycieli gimnazjów i szkół średnich; założona przez dr Natalie Kuldell z MIT.