Alishewanella fetalis
|
|
| Alishewanella fetalis | |
|---|---|
| A. fetalis wyhodowana na płytce agarowej BHI uwidoczniona za pomocą transmisyjnej mikroskopii elektronowej | |
| Klasyfikacja naukowa | |
| Domena: | |
| Gromada: | |
| Klasa: | |
| Zamówienie: | |
| Rodzina: | |
| Rodzaj: | |
| Gatunek: |
A. płodu
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Alishewanella fetalis Fonnesbech Vogel i in. 2000
|
|
Rodzaj Alishewanella jest jedną z głównych gałęzi rodziny Alteromonadaceae . W 2000 roku zaproponowano umieszczenie w nim A. fetalis , wyizolowanego z autopsji płodu ludzkiego. W 2009 roku A. aestuarii został wyizolowany z płaskiego osadu pływowego i wskazany jako przedstawiciel Alishewanella . Trzeci Alishewanella został wyizolowany z gajami sikhae, koreańskiej sfermentowanej żywności, w 2009 roku i nadano mu nazwę A. jeotgali . Ostatnio, w 2010 r., z gleby wysypiskowej w Korei wyizolowano czwarty obecnie izolowany gatunek Alishewanella , A. agri . Obecnie są to jedyne cztery wyizolowane i scharakteryzowane gatunki z rodzaju Alishewanella .
Identyfikacja
Alishewanella fetalis jest Gram-ujemną, nieruchomą, fakultatywnie beztlenową bakterią o kształcie pałeczki . Pręciki te mają około 2 μm długości i 0,5-1 μm szerokości. Zwykle występują jako pojedyncza komórka. Początkowo był błędnie oznaczany jako Shewanella putrefaciens , wcześniej znany jako Pseudomonas putrefaciens , ze względu na obecność podobnych kwasów tłuszczowych w lipidach jego błony . Jednak po dalszej ocenie stwierdzono, że był to nowy gatunek. Ze względu na pokrewieństwo z Shewanella , rodzaj nazwano Alishewanella . Ponadto, po wstępnej izolacji z autopsji ludzkiego płodu w 1992 roku w Szwecji , nadano mu nazwę gatunkową fetalis .
Wzrost
A. fetalis rośnie w temperaturze od 25° do 42°C, a optymalny wzrost następuje w temperaturze 37°C. Nie może rosnąć poniżej 20°C. Jest fakultatywnie beztlenowy i może wykorzystywać akceptory elektronów, takie jak tlenek trimetyloaminy (TMAO), azotan , azotyn i tiosiarczan , ale nie żelazo siarczynowe lub żelazowe. Jest nie tylko halotolerancyjny, ale wymaga NaCl do wzrostu. Stężenia NaCl do 8%, ale nie do 10% są tolerowane. A. fetalis jest oksydazo- i katalazo -dodatnia, ale nie wytwarza indolu i β-galaktozydazy . Nie może fermentować węglowodanów . Na podstawie tych wyników A. fetalis jest bardzo blisko spokrewniony zarówno z algami Shewanella putrefaciens , jak i Shewanella . Jednak A. fetalis różni się od rodzaju Shewanella zdolnością do wytwarzania H 2 S.
Genom
Badania A. fetalis pokazują, że zawartość GC w genomie wynosi 50,6%, co znacznie różni się od zawartości GC w Shewanella putrefaciens , gdzie zawartość GC wynosi 42-47%. Wykazuje pokrewieństwo zarówno z Rheinheimara baltica poprzez 16S rRNA , jak iz rodziną Vibrionaceae poprzez gyrazę B. Jeśli chodzi o inne gatunki Alishewanella , A. fetalis jest blisko spokrewniony z Alishewanella jeotgali (98,04%), Alishewanella aestuarii (98,3%) i Alishewanella agri (98,7%) przez 16S rRNA .