wirus alfatorque

Klasyfikacja wirusów
Alphatorquevirus
(nierankingowe): Wirus
królestwo : incertae sedis
Królestwo: incertae sedis
Gromada: incertae sedis
Klasa: incertae sedis
Zamówienie: incertae sedis
Rodzina: Anelloviridae
Rodzaj: wirus alfatorque

Alphatorquevirus to rodzaj wirusów z rodziny Anelloviridae , w grupie II w klasyfikacji Baltimore . Obejmuje wiele gatunków wirusa znanego wcześniej jako TTV, wirus przenoszony przez transfuzję lub wirus Torque Teno, SENV, SANBAN i inne. Rodzaj obejmuje 26 gatunków.

Taksonomia

Rodzaj obejmuje następujące gatunki:

  • Wirus Torque teno chlorocebus 1
  • Wirus Torque teno chlorocebus 2
  • Wirus Torque teno chlorocebus 3
  • Wirus Torque teno chlorocebus 5
  • Wirus Torque Teno 1
  • Wirus Torque Teno 2
  • Wirus Torque Teno 3
  • Wirus Torque Teno 4
  • Wirus Torque Teno 5
  • Wirus Torque Teno 6
  • Wirus Torque Teno 7
  • Wirus Torque Teno 9
  • Wirus Torque Teno 10
  • Wirus Torque Teno 13
  • Wirus Torque Teno 14
  • Wirus Torque Teno 15
  • Wirus Torque Teno 17
  • Wirus Torque Teno 18
  • Wirus Torque Teno 19
  • Wirus Torque Teno 20
  • Wirus Torque Teno 21
  • Wirus Torque Teno 24
  • Wirus Torque Teno 25
  • Wirus Torque Teno 26
  • Wirus Torque Teno 29
  • Wirus Torque Teno 31

Historia

TTV, wirus przenoszony przez transfuzję lub wirus Torque Teno, został po raz pierwszy opisany u japońskiego pacjenta w 1997 roku przez naukowca T. Nishizawę. Wirus jest niezwykle powszechny, nawet u zdrowych osób — w niektórych krajach występuje nawet w 100%, aw Wielkiej Brytanii i Stanach Zjednoczonych występuje u około 10% dawców krwi . Chociaż wydaje się, że sam nie powoduje objawów zapalenia wątroby , często występuje u pacjentów z chorobami wątroby. Uważa się, że w większości przypadków infekcja TTV przebiega bezobjawowo .

Początkowo wykrywany u japońskich pacjentów z zapaleniem wątroby o nieznanej przyczynie, TTV wykryto w różnych populacjach bez udowodnionej patologii, w tym u dawców krwi. Ten nowy wirus został pierwotnie odkryty w 1997 roku za pomocą analizy różnic reprezentatywnych (RDA) w osoczu japońskiego pacjenta (inicjały TT) z potransfuzyjnym zapaleniem wątroby. Najpierw scharakteryzowano sekwencję (N22) o długości 500 nukleotydów (nt), a następnie przedłużono ją do około 3700 nt (klon TA278). W tym czasie analiza sekwencji sugerowała, że ​​TTV był spokrewniony z rodziną Parvoviridae . Pod koniec 1998 roku dwa niezależne badania wykazały obecność dodatkowego regionu bogatego w GC o wielkości około 120 nt, co doprowadziło do odkrycia kolistego charakteru genomu TTV (~ 3800 nt). To odkrycie ustaliło związek TTV z Circoviridae .

Etymologia

Początkowo wirus został nazwany TTV na cześć pacjenta o inicjałach TT. Później przyjęto nazwę wirus Torque (naszyjnik) teno (z łac. tenuis - „cienki”), ponieważ zachowała oryginalny skrót.

Rozprzestrzenianie się wirusów

Duża liczba badań epidemiologicznych pozwoliła jednoznacznie wskazać globalne rozmieszczenie wirusa ( Afryka , Ameryka Północna i Południowa , Azja , Europa , Oceania ) w populacjach wiejskich i miejskich. Mimo że nie wykazano związku zakażenia TTV z daną patologią, wysunięto hipotezę o związku miana wirusa ze statusem immunologicznym gospodarza. Ponadto, chociaż początkowo podejrzewano, że wirus jest przenoszony wyłącznie przez transfuzję krwi, globalne rozproszenie wirusa w populacjach i wykrycie go w różnych próbkach biologicznych (osocze, ślina, kał itp.) przenoszone przez kropelki śliny. Zaproponowano również transmisję seksualną.

Pokrewne wirusy znaleziono u szympansów, małp człekokształtnych, małp afrykańskich, tupai, kurczaków, świń, krów, owiec i psów.

Przenoszenie pionowe odnotowano u świń.

Genom

Genom TTV jest kolistym jednoniciowym fragmentem DNA o ujemnym sensie , o długości około 3,8 kb; jest to wirus bez otoczki z wirionem o średnicy około 40 nm. Chociaż wykazuje pewne podobieństwo do członków grupy Circoviridae , brakuje mu homologii sekwencji z jakimkolwiek znanym wirusem. Jest klasyfikowany w rodzinie Anelloviridae .

Jego genom zawiera 2 duże otwarte ramki odczytu , kodujące 770 i 202 aminokwasy , a także kilka mniejszych ORF. Region genomowy -154/-76 zawiera krytyczny promotor.

Izolaty zostały sklasyfikowane w pięciu głównych kladach ponumerowanych od 1 do 5. Genogrupa 3 TTV obejmuje również 8 szczepów wirusów znanych jako SENV-A do H.

Kliniczny

Obecnie nie uważa się, aby te wirusy powodowały choroby u ludzi. Zakażenie tymi wirusami zwykle prowadzi do trwającej całe życie wiremii, a ich możliwy związek z chorobą pozostaje przedmiotem badań. Wyższe niż zwykle miano wirusa było związane z ciężkimi idiopatycznymi miopatiami zapalnymi, rakiem i toczniem.

Badanie próbek kału u 135 Brazylijczyków z zapaleniem żołądka i jelit wykazało obecność wirusa u 121 (91%). Obecność wielu genotypów była powszechna.

Zgłaszano obecność tego wirusa w ostrym uszkodzeniu płuc i zaostrzeniach idiopatycznego włóknienia płuc.

Zgłaszano zwiększone miano wirusa w przypadkach wrodzonych niedoborów lektyny wiążącej mannozę.

Zgłoszono możliwy przypadek niedokrwistości aplastycznej z zapaleniem wątroby.

Zgłoszono jeden przypadek potransplantacyjnego zapalenia wątroby.

Zaproponowano związek z rakiem głowy/szyi.

Wykazano, że miano wirusa TTV wzrasta u pacjentów z immunosupresją. Podwyższone poziomy TTV obserwowano na przykład w sepsie .

Ponieważ TTV jest wszechobecny, a replikacja wirusa koreluje ze stanem odporności, TTV badano jako obiecujący marker do oceny globalnej funkcjonalnej kompetencji immunologicznej u biorców przeszczepów.

Replikacja

Niewiele wiadomo na temat replikacji TTV, jednak na podstawie badań nad cirkowirusami na zwierzętach wydaje się konieczna struktura replikacji dwuniciowej. Niektóre badania opisywały obecność dwuniciowego DNA TTV w różnych tkankach i narządach, co sugeruje aktywną replikację w tych lokalizacjach. Odkrycia te minimalizują również hipotetyczne implikacje TTV w zaburzeniach wątroby. Obecnie nie są dostępne żadne inne dane dotyczące TLMV (TTV-like Mini Virus – szczep infekujący ludzi).

Linki zewnętrzne

Pobrano z „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Alphatorquevirus&oldid=1136464284 ”