Betatorquevirus
| Klasyfikacja wirusów | |
|---|---|
| Betatorquevirus | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | incertae sedis |
| Królestwo: | incertae sedis |
| Gromada: | incertae sedis |
| Klasa: | incertae sedis |
| Zamówienie: | incertae sedis |
| Rodzina: | Anelloviridae |
| Rodzaj: | Betatorquevirus |
Betatorquevirus to rodzaj wirusów z rodziny Anelloviridae , w grupie II w klasyfikacji Baltimore . Rodzaj Betatorquevirus obejmuje wszystkie „miniwirusy momentu obrotowego teno” (TTMV), ponumerowane od 1 do 38 jako 38 gatunków.
Taksonomia
Rodzaj obejmuje następujące gatunki:
- Torque teno mini wirus 1
- Torque teno mini wirus 2
- Torque teno mini wirus 3
- Torque teno mini wirus 4
- Torque teno mini wirus 5
- Torque teno mini wirus 6
- Torque teno mini wirus 7
- Torque teno mini wirus 8
- Torque teno mini wirus 9
- Torque teno mini wirus 10
- Torque teno mini wirus 11
- Torque teno mini wirus 12
- Torque teno mini wirus 13
- Torque teno mini wirus 14
- Torque teno mini wirus 15
- Torque teno mini wirus 16
- Torque teno mini wirus 17
- Torque teno mini wirus 18
- Torque teno mini wirus 19
- Torque teno mini wirus 20
- Torque teno mini wirus 21
- Torque teno mini wirus 22
- Torque teno mini wirus 23
- Torque teno mini wirus 24
- Torque teno mini wirus 25
- Torque teno mini wirus 26
- Torque teno mini wirus 27
- Torque teno mini wirus 28
- Torque teno mini wirus 29
- Torque teno mini wirus 30
- Torque teno mini wirus 31
- Torque teno mini wirus 32
- Torque teno mini wirus 33
- Torque teno mini wirus 34
- Torque teno mini wirus 35
- Torque teno mini wirus 36
- Torque teno mini wirus 37
- Torque teno mini wirus 38
Wstępne odkrycie
Odkrycie TTMV, podobnie jak oryginalnego izolatu wirusa Torque Teno (TTV), było przypadkowe. Po wyizolowaniu TTV w 1997 roku od japońskiego pacjenta, stworzono startery do bardziej szczegółowego badania TTV. Startery specyficzne dla TTV stosowane w PCR próbek ludzkiego osocza dały sekwencje, które częściowo pasowały do sekwencji TTV, ale były zauważalnie krótsze. Ostatecznie uznano, że TTV ma genom o wielkości 3,6–3,9 kb, podczas gdy TTMV ma genom o wielkości 2,8–2,9 kb. Inny wirus podobny do TT, wyizolowany później w 2007 roku, wirus Torque teno midi lub TTMDV, ma genom o wielkości 3,2 kb.
Genom i kapsyd
TTMV ma podobne cechy morfologiczne jak inne ludzkie anellowirusy. Kapsyd ma dwudziestościenną symetrię T = 1. Wirion nie ma otoczki lipidowej i dlatego jest „nagi”, co czyni go niezwykle prostym wirusem. Szacuje się, że wirion ma nieco mniej niż 30 nm średnicy.
Genom jest kolisty i zbudowany z jednoniciowego DNA o ujemnej polarności. Ma długość 2,86–2,91 kilozasad. Wiadomo, że anellowirusy mają 3 lub 4 nakładające się, zagnieżdżone otwarte ramki odczytu; TTMV ma 3 ORF, które się nakładają. ORF-2 i ORF-3 nakładają się na ORF-1 na przeciwległych końcach. W przypadku TTMV ORF-1 ma około 663 reszt, a ORF-2 ma około 91 reszt. Tuż za polem TATA znajduje się wysoce konserwatywny region 130-nt.
Filogeneza i rozprzestrzenianie się
TTMV jest wysoce rozbieżny. Pierwsze drzewo filogenetyczne utworzone z sekwencji genomowych TTMV ujawniło duże skupisko szczepów; ORF-1 miała rozbieżności ponad 42% na poziomie nukleotydów i ponad 67% na poziomie aminokwasów.
TTMV jest również bardzo rozpowszechniony, podobnie jak inne ludzkie anellowirusy. Późniejsze badania po jego odkryciu wykazały, że częstość występowania DNA TTMV wśród dawców krwi wynosi 48–72%. Prawdopodobnie może zakażać szeroką gamę tkanek, ponieważ został wyizolowany z różnych płynów ustrojowych i tkanek, w tym ze śliny, kału, osocza/surowicy, PBMC , szpiku kostnego, śledziony, trzustki, nerek, tkanki nerwowej, węzłów chłonnych, nasienia, i wymazy z szyjki macicy. Dokładny mechanizm przenoszenia nie jest znany, ale uważa się, że jest to możliwe drogą krwiopochodną, seksualną, fekalno-oralną i oddechową.
Ostatnie badania wykazały, że ludzie mogą mieć wiele infekcji wirusami TT.
Kliniczny
Chociaż TTV są potencjalnie związane z chorobami, a ich patogenność była przedmiotem dyskusji od czasu ich odkrycia, TTMV nie jest obecnie znany jako bezpośrednia przyczyna jakiejkolwiek choroby u ludzi. TTMV wyizolowano z wielu ropniaków parapneumonicznych . Jednak jego znaczenie kliniczne pozostaje niejasne.
Linki zewnętrzne
- Taksonomia wirusów ICTV 2009
- Taksonomia UniProt
- Anellovirus w US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
- ICTVdb
- Strefa Wirusowa: Betatorquevirus