Baza zwierząt
AnimalBase to projekt powołany do życia w 2004 roku i prowadzony przez Uniwersytet w Getyndze w Niemczech. Celem projektu AnimalBase jest digitalizacja wczesnej literatury zoologicznej, zapewnienie otwartego dostępu do prac zoologicznych bez praw autorskich oraz dostarczenie ręcznie zweryfikowanych list nazw rodzajów i gatunków zoologicznych jako bezpłatnego zasobu dla ogółu społeczeństwa. AnimalBase przyczynił się do otwarcia klasycznej literatury taksonomicznej, co jest uważane za przydatne, ponieważ dostęp do wczesnej literatury (zwłaszcza z końca XVIII wieku) może być trudny dla badaczy, którzy potrzebują starych źródeł do swoich badań taksonomicznych .
Dane AnimalBase są własnością publiczną . Publiczne wykorzystanie danych AnimalBase nie jest ograniczone ani uwarunkowane. AnimalBase obejmuje wszystkie dyscypliny zoologiczne. W dziedzinie informatyki dotyczącej różnorodności biologicznej AnimalBase jest wyjątkowy w dostarczaniu powiązań między nazwami taksonów rodzajowych i specyficznych a ich cyfrowymi oryginalnymi opisami, ze szczególnym uwzględnieniem literatury i nazw opublikowanych przed 1800 rokiem.
Historia
Projekt został zainicjowany w 2003 r. dzięki dofinansowaniu z Niemieckiej Fundacji Badawczej (DFG). Baza danych i jej interfejs sieciowy zaczęły być rozwijane w 2004 r. i zostały uruchomione online w 2005 r. Interfejs sieciowy został zaprojektowany tak, aby był dostępny dla starszych generacji komputerów i przeglądarek internetowych . W latach 2003-2005 zdigitalizowano około 400 publikacji zoologicznych z lat 1550-1770, a do bazy danych włączono 10 000 połączonych nazw zoologicznych. Drugi wysiłek (2008–2011) obejmował dodatkową zdigitalizowaną literaturę, dającą dostęp do kilku dziesięciu tysięcy innych nazw zoologicznych, które zostały wyodrębnione z oryginalnych źródeł i połączone z ich zdigitalizowanymi oryginalnymi opisami.
Digitalizacja i linkowanie do zdigitalizowanej literatury z innych źródeł
Wczesne publikacje zoologiczne są digitalizowane zgodnie z najwyższymi standardami jakości przez Centrum Retrospektywnej Cyfryzacji w Getyndze ( Göttinger Digitalisierungszentrum , GDZ) Biblioteki Państwowej i Uniwersyteckiej w Getyndze (Staats- und Universitätsbibliothek Göttingen, SUB), która jest jedną z największych bibliotek w Niemczech, w tym ponad 4,5 miliona woluminów. Jeśli to możliwe, AnimalBase zapewnia również łącza do zdigitalizowanych domeny publicznej innych dostawców, takich jak Biodiversity Heritage Library (BHL) lub Gallica .
Wyodrębnianie nazw taksonomicznych z literatury
Nazwy zoologiczne taksonów rodzajowych i specyficznych, które zostały ustalone we wczesnych publikacjach zoologicznych, zostały wprowadzone do bazy ręcznie, z uwzględnieniem oryginalnej i poprawionej pisowni nazw, lokalizacji typów i numerów stron, na których nazwy te zostały pierwotnie ustanowione w publikacjach. Ponadto nazwy zostały porównane z wpisami w Index Animalium Charlesa Daviesa Sherborna (1902, 1922–1933) i Nomenclator Zoologicus autorstwa Neave (1939/1940, zaktualizowane). Status nomenklaturalny nazw został zweryfikowany w ramach aktualnego wydania Międzynarodowego Kodeksu Nomenklatury Zoologicznej (ICZN). Ewentualne rozbieżności między starszymi bazami danych a wynikami badań nazw AnimalBase (tj. pierwszeństwo w nomenklaturze lub nieprawidłowa pisownia) były czasami omawiane w komentarzach dotyczących każdego taksonu. Cały proces przebiegał zgodnie z ustalonym standardem AnimalBase.
Standard AnimalBase
Nazwy specyficzne i rodzajowe taksonów wprowadzane są ręcznie z odniesieniem do oryginalnego opisu. Podstawowy wpis nazwy taksonu jest zgodny ze standardem AnimalBase, który składa się z następujących wytycznych:
- Poprawność oryginalnej pisowni nazwy rodzajowej i specyficznej sprawdzana jest zgodnie z zasadami nazewnictwa (Kodeks ICZN, wydanie aktualne).
- Nazwy specyficzne są podawane ściśle w połączeniu z rodzajem, do którego zostały przypisane w oryginalnym opisie. W przypadkach, gdy nazwa rodzajowa została błędnie wpisana przez autora, który ustalił nazwę specyficzną, Zespół AnimalBase łączy nazwę specyficzną z poprawną pisownią tego rodzaju.
- Dodatkowo wpisuje się przypadkowo błędną oryginalną pisownię nazwy taksonu (tj. różniącą się od poprawnej pisowni), zachowując oryginalne użycie znaków diakrytycznych , ligacji, wielkich liter dla poszczególnych nazw, łączników, spacji między wyrazami, błędnych kolejnych pisowni nazwy taksonu nazwa rodzajowa w kombinacji rodzaj-gatunek stosowana przez autora.
- Podano nazwisko autora, pisane zgodnie z nazwiskiem podanym na stronie tytułowej oryginalnego źródła (przykłady: Linnæus 1758, Linné 1766).
- Podano rok lub datę publikacji, zgodnie z zasadami nazewnictwa (prawdziwa data publikacji).
- Zapewnione jest traktowanie płci (zmienne lub niezmienne nazwy specyficzne, zgodnie z postklasycznymi regułami gramatyki łacińskiej ). Często trudno jest określić, czy nazwa łacińska jest przymiotnikiem, czy nie, więc wynikowe wpisy AnimalBase tych danych mogą nie być w 100% wiarygodne.
- Podano link do zdigitalizowanej publikacji zawierającej oryginalny opis.
- Podano stronę oryginalnego opisu nazwy taksonu (czyli stronę, na której nazwa została wymieniona i udostępniona po raz pierwszy). Jeśli opisane zwierzę jest pokazane na tabliczkach rycinowych i nie ma na nich imienia, niekoniecznie jest to zaznaczone.
- Lokalizacja typu jest podana zgodnie z oryginalnym opisem, jeśli jest łatwo rozpoznawalna lub można ją wywnioskować pośrednio z pracy. Ta procedura może być niedokładna (ponieważ lokalizacja typu to lokalizacja, z której pochodzą typy noszące nazwy, które nie są badane przez zespół AnimalBase), ale z pewnością dostarcza przydatnych informacji.
- klasyfikowany jest takson (rodzaj, klasa, rząd lub podobnie klad).
- Wpisy są sprawdzane krzyżowo z Index Animalium i (w przypadku rodzajów) z Nomenclator Zoologicus. Niepoprawne wpisy (kolejne użycie wcześniej ustalonych nazw, które Sherborn często wymieniał błędnie jako nowe lub nomina nuda ) i nieprawidłowa pisownia imion w tych bazach danych nie są kopiowane do AnimalBase, jeśli zostaną wykryte jako takie.
- Niepoprawne kolejne pisownie nie są generalnie uważane za nowe taksony, ale mogą być wymienione jako niedostępne i omawiane, jeśli nazwa została wymieniona jako nowa nazwa w Index Animalium lub jest ważna z innego powodu.
- Wszystkie grupy zwierząt są traktowane konsekwentnie zgodnie z zasadami ICZN (nazwy ryb podlegają tym samym zasadom, co nazwy owadów).
Standard AnimalBase pozwala na łatwy dostęp do podstawowych danych oryginalnego opisu. Zespół AnimalBase nie dopasowuje pisowni ani autorstwa każdej pierwotnie ustalonej nazwy z tymi zawartymi w różnych zoologicznych bazach danych, wyspecjalizowanych w danej dyscyplinie lub regionie. Podstawowym zakresem AnimalBase jest udostępnianie linków do zdigitalizowanych oryginalnych opisów, ale można również sprawdzić poprawną pisownię i autorstwo nazw zoologicznych. W związku z tym AnimalBase może potencjalnie zapewnić przydatną aktualizację Sherborn’s Index Animalium.
AnimalBase zapewnia również opcję łączenia oryginalnych nazw z ich obecnymi przydziałami (aktualne kombinacje rodzaj-gatunek). Na przykład dostępne są szczegółowe informacje biologiczne i zdjęcia dotyczące 2500 gatunków europejskich mięczaków innych niż morskie , w tym ponad 6000 fotografii. AnimalBase to projekt oparty na współpracy i otwartych zasobach; wszyscy zarejestrowani współpracownicy mają możliwość poprawiania lub wprowadzania danych. Obejmuje to przesyłanie zdjęć ( bez praw autorskich ) gatunków zwierząt, danych biologicznych, w tym pomiarów i cech diagnostycznych, danych dotyczących rozmieszczenia , aktualnego stanu ochrony itp. Zdjęcia i dane dostarczone przez AnimalBase są wyraźnie dozwolone do wykorzystania na innych stronach internetowych (kopiowane lub łączone ). [ potrzebne źródło ]
Linki zewnętrzne
- AnimalBase http://www.animalbase.org
- Index Animalium http://www.sil.si.edu/digitalcollections/indexanimalium/
- Nomenclator Zoologicus https://web.archive.org/web/20121126194823/http://uio.mbl.edu/NomenclatorZoologicus/
- Centrum Digitalizacji SUB Göttingen