Armatimonas rosea
Armatimonas rosea | |
---|---|
Klasyfikacja naukowa | |
Domena: | |
Gromada: | |
Klasa: |
Armatimonadia
|
Zamówienie: |
Armatimonadales
|
Rodzina: |
Armatimonadaceae
|
Rodzaj: |
Armatimonas
|
Gatunek: |
A. róża
|
Nazwa dwumianowa | |
Armatimonas rosea Tamaki i in. 2011
|
Armatimonas rosea jest bakterią Gram-ujemną, a także pierwszym gatunkiem scharakteryzowanym w typie Armatimonadota. Armatimonadota były wcześniej znane jako typ kandydujący OP10. OP10 składał się wyłącznie ze środowiskowych sekwencji klonów genu 16S rRNA przed A. rosea .
Odkrycie
A. rosea została pierwotnie wyizolowana z kłącza rośliny wodnej Phragmites australis zamieszkującej słodkowodne jezioro w prefekturze Yamanashi w Japonii. Hodowlę i izolację zakończono w pożywce o niskiej zawartości składników odżywczych, DTS.
Krewni
Środowiskowe sekwencje genów 16S rRNA należące do typu Armatimonadota są obecnie podzielone na sześć grup. Grupy 2, 5 i 6 składają się wyłącznie z sekwencji. Grupa 1 zawiera Armatimonas rosea , Grupa 3 zawiera Chthonomonadetes calidirosea , a Grupa 4 zawiera Fimbriimonas ginsengisoli .
|
||||||||||
Chthonomonas calidirosea szczep T49T, tlenowa , sacharolityczna, bezwzględnie termofilna, ruchliwa, nie tworząca przetrwalników bakteria, została wyizolowana z geotermalnie ogrzanej gleby w Hell's Gate, Tikitere, Nowa Zelandia. Jest pierwszym przedstawicielem nowej klasy w typie Armatimonadota . Reprezentuje pierwszego hodowlanego przedstawiciela Chthonomonadetes , odpowiadającego grupie 3 typu Armatimonadota . [ potrzebne źródło ]
Fimbriimonas ginsengisoli , tlenowa, nieruchoma, mezofilna bakteria w kształcie pałeczki, została wyizolowana z próbki gleby pola żeń-szenia. Reprezentuje pierwszego hodowlanego przedstawiciela Fimbriimonadia , odpowiadającego grupie 4 typu Armatimonadota .
Charakterystyka
W przypadku wzrostu na pożywce R2A o stosunkowo niskiej zawartości składników odżywczych kolonie były różowo zabarwione, okrągłe, gładkie, znacznie twarde, stosunkowo małe (1–2 mm) po tygodniu inkubacji w temperaturze 30°C. A.rosea ma optymalną temperaturę 30–35 °C z zakresem 20–40 °C. Optymalne pH dla wzrostu wynosiło 6,5 w zakresie 5,5–8,5. Jest w stanie tolerować stężenia NaCl do 0,5%.
Podczas badania za pomocą kontrastu fazowego i transmisyjnej mikroskopii elektronowej zaobserwowano, że komórki są nieruchome, jajowate lub w kształcie pręta, o rozmiarach w zakresie od 1,4 do 1,8 µm szerokości i 2,4–3,2 µm długości. Nie zaobserwowano zarodników ani wici.
Podczas badania na pożywce R2A zaobserwowano, że kultury A. rosea były tlenowe i chemoheterotroficzne , bez oznak wzrostu w warunkach beztlenowych. Jest ujemny dla następujących testów: oddychanie azotanowe, wzrost fermentacyjny, katalaza i oksydaza cytochromowa.
- Tamaki, Hideyuki; i in. (2011). „ Armatimonas rosea gen. Nov., sp. nov., nowego typu bakterii Armatimonadetes phyl. nov., formalnie nazywanego typem kandydującym OP10” . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 61 (6): 1442–1447. doi : 10.1099/ijs.0.025643-0 . PMID 20622056 .
- Lee, Kevin CY.; i in. (2011). „ Chthonomonas calidirosea gen. nov., sp. nov., tlenowy, pigmentowany, termofilny mikroorganizm z nowej klasy bakterii, Chthonomonadetes classis nov., z nowo opisanego typu Armatimonadetes, pierwotnie wyznaczonego na podział kandydujący OP10” . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 61 (10): 2482–2490. doi : 10.1099/ijs.0.027235-0 . PMID 21097641 .
- Im, Wan-Taek; i in. (2012). „Opis Fimbriimonas ginsengisoli gen. Nov. Sp. Nov. W obrębie klasy Fimbriimonadia nov. Z typu Armatimonadetes”. Antoniego van Leeuwenhoeka . 102 (2): 1–11. doi : 10.1007/s10482-012-9739-6 . PMID 22527625 . S2CID 12581539 .