Fimbriimonas ginsengisoli
| Fimbriimonas ginsengisoli | |
|---|---|
| Klasyfikacja naukowa | |
| Domena: | |
| Gromada: | |
| Klasa: |
Fimbriimonadia
|
| Zamówienie: |
Fimbriimonadales
|
| Rodzina: |
Fimbriimonadaceae
|
| Rodzaj: |
fimbriimonas
|
| Gatunek: |
F. żeń-szenia
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Fimbriimonas ginsengisoli Wan-Taek Im i in. 2012
|
|
Fimbriimonas ginsengisoli jest bakterią Gram-ujemną i pierwszym przedstawicielem klasy Fimbriimonadia w obrębie gromady Armatimonadota . Armatimonadota były wcześniej znane jako kandydat na typ OP10 . OP10 składał się wyłącznie z sekwencji klonów środowiskowego genu 16S rRNA przed odkryciem krewnego F. ginsengisoli , Armatimonas rosea .
Odkrycie
F. ginsengisoli został pierwotnie wyizolowany z próbki gleby z pola żeń-szenia w prowincji Pocheon w Korei Południowej. Hodowlę prowadzono na agarze R2A o stężeniu 1/2.
Krewni
Środowiskowe sekwencje genów 16S rRNA, należące do typu Armatimonadota , są obecnie podzielone na sześć grup. Grupy 2, 5 i 6 składają się wyłącznie z sekwencji. Grupa 1 zawiera Armatimonas rosea , Grupa 3 zawiera Chthonomonadetes calidirosea , a Grupa 4 zawiera Fimbriimonas ginsengisoli .
|
||||||||||
Chthonomonas calidirosea szczep T49T, tlenowa , sacharolityczna, bezwzględnie termofilna, ruchliwa, nie tworząca przetrwalników bakteria, została wyizolowana z geotermalnie ogrzanej gleby w Hell's Gate, Tikitere, Nowa Zelandia. Jest pierwszym przedstawicielem nowej klasy w typie Armatimonadota . Reprezentuje pierwszego hodowlanego przedstawiciela Chthonomonadetes , odpowiadającego grupie 3 typu Armatimonadota .
Armatimonas rosea , bakteria tlenowa , Gram-ujemna, różowo pigmentowana, nieruchoma, jajowata/w kształcie pałeczki, została wyizolowana z ryzoplanu rośliny wodnej Phragmites australis w Japonii. Jest pierwszym przedstawicielem rodzaju Armatimonadota .
Charakterystyka
W przypadku wzrostu na stężeniu R2A o połowę, kolonie były zabarwione na kolor kości słoniowej, okrągłe, wypukłe, miały tłustą powierzchnię, silnie śluzowate i stosunkowo małe (1–2 mm) po dwóch tygodniach inkubacji w temperaturze 30°C. F. ginsengisoli ma optymalną temperaturę 30 °C w zakresie 15-30 °C. Optymalne pH dla wzrostu wynosiło 7,0 w zakresie 6,0-8,5. Uzupełniający NaCl nie był potrzebny do wzrostu, ale stężenia do 1% były tolerowane.
Podczas badania za pomocą kontrastu fazowego i transmisyjnej mikroskopii elektronowej zaobserwowano, że komórki są nieruchome, mają kształt pręta, o rozmiarach w zakresie od 0,5 do 0,7 µm szerokości i 2,5-5,0 µm długości. F. ginsengisoli zawierał włókienka peritrichous, które były bardzo cienkie i owłosione i wystające ze ściany komórkowej. Nie zaobserwowano powstawania zarodników.
Podczas badania w połowie R2A pożywki zaobserwowano, że kultury F. ginsengisoli były ściśle tlenowe, bez oznak wzrostu w warunkach beztlenowych. Jest ujemny dla testu oksydazy, ale pozytywny dla testu katalazy. Nie mógł wykorzystywać większości testowanych substratów jako jedynego źródła węgla, ale mógł wykorzystywać pepton, kwasy casamino lub ekstrakt drożdżowy jako jedyne źródła węgla. Szczep nie degradował DNA, skrobi, ksylanu ani celulozy.
1. Tamaki, Hideyuki i in. „Armatimonas rosea gen. nov., sp. nov., nowego typu bakterii, Armatimonadetes phyl. nov., formalnie nazywanego typem kandydującym OP10”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 61.6 (2011): 1442–1447. http://ijs.sgmjournals.org/content/61/6/1442.short
2. Lee, Kevin CY., et al. „Chthonomonas calidirosea gen. nov., sp. nov., tlenowy, pigmentowany, termofilny mikroorganizm z nowej klasy bakterii, Chthonomonadetes classis nov., z nowo opisanego typu Armatimonadetes, pierwotnie wyznaczonego jako kandydat na dział OP10”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 61.10 (2011): 2482–2490. http://ijsb.sgmjournals.org/content/61/10/2482.short
3. Im, Wan-Taek i in. „Opis Fimbriimonas ginsengisoli gen. nov., sp. nov. W obrębie klasy Fimbriimonadia nov., typu Armatimonadetes”. Antonie van Leeuwenhoek (2012): 1–11. https://doi.org/10.1007%2Fs10482-012-9739-6
